Deduction of minimum sysmbiosis island gene sets for Lotus rhizobia

莲花根瘤菌最小共生岛基因集的推导

• 批准号: 23510235
• 负责人: SAEKI Kazuhiko
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Nara Women's University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23510235/
• 关键词: 植物微生物相互作用; 共生; 窒素固定; 根粒形成; 遺伝子水平伝搬

In an attempt to deduce the rhizobial minimum symbiosis gene sets for mutualism between Mesorhizobium loti and Lotus species, we compared nucleotide sequences of symbiosis islands of three M. loti strains and found 155 genes are completely conserved among them. We made controllable promoters and new selectable markers to be used with M. loti strains. We also made a temperature sensitive derivative of the broad-host range vector pBBR1MCS2, by mutagenesis of its rep gene. In addition, we performed Next Generation Sequencing analysis of several M. loti strains and mapped the obtained reads on the genome sequence of the strain MAFF303099. The results supported the divergence of main chromosomes among M. loti strains with conserved core structure of symbiosis island.

为了推导中索根瘤菌与莲花物种之间互利共生的根瘤菌最小共生基因集，我们比较了三个中索根瘤菌菌株的共生岛的核苷酸序列，发现其中有155个基因是完全保守的。我们制作了可用于 M. Loti 菌株的可控启动子和新的选择标记。我们还通过其rep基因的诱变制备了广泛宿主范围载体pBBR1MCS2的温度敏感衍生物。此外，我们对几种 M. Loti 菌株进行了下一代测序分析，并将获得的读数映射到菌株 MAFF303099 的基因组序列上。结果支持具有保守共生岛核心结构的M. loti菌株之间主要染色体的分歧。

项目成果

Core gene sets and evolution of symbiosis islands in rhizobial isolates from Lotus japonicus indigenous to Japan

日本本土百脉根根瘤菌的核心基因组和共生岛的进化

• 发表时间: 2013
• 作者: Saeki K;Kasai-Maita H;Kubota K;Kaneko T;Hirakawa H;Tabata S;Sato S
• 通讯作者: Sato S

Core gene sets and evolution of symbiosis islands in rhizobial isolates from Lotus japonicas indigenous to Japan

日本本土莲花根瘤菌分离物的核心基因组和共生岛的进化

• 发表时间: 2013
• 作者: Kazuhiko Saeki;Hiroko Kasai-Maita;Kazuna Kubota;Takakazu Kaneko;Hideki Hirakawa;Satoshi Tabata;Shusei Sato
• 通讯作者: Shusei Sato

ミヤコグサ根粒菌共生アイランドの伝搬と進化 : 宿主モデル系統 MG20自生地採集株群に焦点をあてて

百脉根根瘤菌共生岛的繁殖与进化：以自然采集的宿主模型菌株MG20为中心

• 发表时间: 2012
• 作者: 佐伯和彦;谷佳美;池田翠,金子貴一,眞板寛子,平川英樹,田畑哲之;佐藤修正
• 通讯作者: 佐藤修正

ミヤコグサ根粒菌野生系統の耐塩性について

野生莲根瘤菌的耐盐性研究

• 发表时间: 2013
• 作者: 窪田和奈;眞板寛子;平川英樹;佐藤修正;佐伯和彦
• 通讯作者: 佐伯和彦

ミヤコグサ根粒菌を宿主とした人為制御可能な発現ベクターの開発と応用

以百脉根根瘤菌为宿主的人工可控表达载体的开发及应用

• 发表时间: 2012
• 作者: 白井理恵;中村公美,副島麻衣,岡崎伸;佐伯和彦
• 通讯作者: 佐伯和彦