細胞内共生を通じた新奇オルガネラ獲得:珪藻細胞に見られる窒素固定構造の進化解明
通过内共生获得新型细胞器:阐明硅藻细胞中固氮结构的进化
基本信息
- 批准号:22870037
- 负责人:
- 金额:$ 1.58万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
- 财政年份:2010
- 资助国家:日本
- 起止时间:2010 至 2011
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Rhopalodia科珪藻は細胞内にSpheroid bodyと呼ばれる窒素固定に特化した構造を持つ。Spheroid bodyは細胞内共生シアノバクテリアに由来するが、既に"窒素固定オルガネラ"として珪藻細胞に統合されていると考えられており、細胞内共生を通じたオルガネラ獲得の進化機構を知る上で格好のモデルとなり得る。本研究では、Spheroid bodyおよび宿主珪藻の系統的多様性を解明するとともに、Spheroid bodyの全ゲノム配列解読を行うことにより、オルガネラ化における進化段階を明らかにする事を目標とした。本年度は、昨年度の研究において得られたSpheroid bodyゲノム配列の解析を主として行った。次世代シーケンスによって得られたリードをアセンブルした結果、2.42MbpのSpheroid bodyゲノム配列を得た。今回のシークエンスではゲノム全てを解読するには至らなかったが、近縁なシアノバクテリアに見られる解糖系、TCA回路およびタンパク質合成に関わる遺伝子のうち約80%を発見した。このことはSpheroid bodyゲノムの大半の領域を取得できたことを示唆するが、それに対して光化学系I,IIおよびフィコビリソームのサブユニット遺伝子は発見できなかった。このことからSpheroid bodyがその進化の中で、不要になった光合成関連遺伝子を失った可能性が考えられる。また、今回の解析では膜輸送系や二成分制御系などの細胞外との相互作用に関わる遺伝子の多くも見つからなかった。これらの遺伝子が欠失する傾向は、Spheroid body同様シアノバクテリア由来のオルガネラであるPaulinella chromatophoraの有色体ゲノムで確認されており、外環境に暴露されることのなくなった細胞内共生者ゲノムに共通して起こる事象であるかもしれない。
Rhopalodia is a family of algae that specializes in intracellular Spheroid body and protein fixation. Spheroid body is the origin of intracellular symbiosis, namely,"protein fixation" and "algae cell integration". In this study, the diversity of Spheroid body and host system was analyzed. The complete configuration of Spheroid body was analyzed. The evolution stage of Spheroid body and host system was analyzed. This year's study was conducted in the same way as last year's. The next generation of Spheroid body alignment was obtained. In the present case, the total number of unsolved problems in the TCA loop is about 80%. The Spheroid Body is the most important part of the Photochemical System I and II. The evolution of the Spheroid body is in the middle, not in the middle, and the possibility of the loss of the photosynthetic correlation is examined. The analysis of membrane transport system and two-component control system are related to extracellular interaction. The tendency of the Spheroid body isoform to lose its origin is to identify Paulinella chromophora chromophore, which is commonly associated with intracellular symbionts.
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Rhopalodia科珪藻に見られる細胞内共生シアノバクテリアの起源と分子進化
Rhopalodiaceae硅藻中发现的内共生蓝藻的起源和分子进化
- DOI:
- 发表时间:2011
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:中山卓郎;池上裕子;中山剛;井上勲;稲垣祐司;笠井文絵
- 通讯作者:笠井文絵
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
中山 卓郎其他文献
Visuotactile sensory experience shared with others.
与他人分享视觉触觉感官体验。
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
野村 真未;西上 幸範;市川 正敏;中山 卓郎;太田 啓介;中村 桂一郎;Teramoto W. - 通讯作者:
Teramoto W.
外洋性渦鞭毛藻Ornithocercus magnificusに見られる共生シアノバクテリアのゲノム解析
远洋甲藻Ornithocercus magnificus中发现的共生蓝藻的基因组分析
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
中山 卓郎;高野 義人;野村 真未;柴 小菊;稲葉 一男;谷藤 吾朗;河田 雅圭;稲垣 祐司 - 通讯作者:
稲垣 祐司
有殻アメーバ直伝、卵型シェルターの作り方
如何直接用带壳的阿米巴原虫制作蛋形庇护所
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
野村 真未;西上 幸範;市川 正敏;中山 卓郎;太田 啓介;中村 桂一郎 - 通讯作者:
中村 桂一郎
有殻アメーバの頑健な卵型被殻構築過程の4Dイメージングおよび模型作成(4D Imaging and 3D modeling of the robust egg-shaped shell construction process of testate amoeba)
睾丸变形虫坚固的蛋形壳构建过程的 4D 成像和 3D 建模
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
野村 真未;西上 幸範;Galipon Josephine ;市川 正敏;中山 卓郎;太田 啓介;中村 桂一郎 - 通讯作者:
中村 桂一郎
中山 卓郎的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('中山 卓郎', 18)}}的其他基金
二次共生の中間段階にある共生者ゲノムの解読
对次级共生中间阶段的共生体基因组进行测序
- 批准号:
24K09587 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
The overlooked diversity of the marine microbiome - Exploring the prokaryotic microbiome within eukaryotic microorganisms
被忽视的海洋微生物组多样性 - 探索真核微生物中的原核微生物组
- 批准号:
20H03305 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 1.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Paulinella chromatophoraのシアネレに関する研究
产色泡藻蓝藻的研究
- 批准号:
07J07571 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 1.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows