System level analysis of the BMP4 synexpression groups

BMP4 同表达组的系统水平分析

• 批准号: 5403306
• 负责人: Professor Dr. Christof Niehrs, Ph.D.
• 金额: --
• 依托单位: Abteilung Molekulare Embryologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2002-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5403306?language=en
• 关键词: System; level; analysis; BMP4; synexpression

Synexpressionsgruppen sind Cluster von Genen, die in gemeinsamen molekularen Prozessen, wie z.B. Proteinsekretion, Chromatinstruktur und Wachstumsfaktor-Signalwegen fungieren. Synexpressionsgruppen sind inzwischen auch in Hefe, Zebrafisch, Maus und Mensch gefunden worden und sind daher offenbar ein weit verbreitetes Phänomen. Die Identifizierung von Synexpressionsgruppen erlaubt die Assemblierung molekularer Pathways und die Vorhersage der Funktion unbekannter Gene. Im ersten Teil dieses Antrags sollen daher Synexpressionsgruppen mittels Xenopus cDNA Microarrays in einem groß angelegten Clustering Experiment identifiziert werden. Dazu bestimmen wir das Expressionsprofil von 40.000 ESTs unter mehr als 50 verschiedenen Bedingungen. Im vorliegenden Antrag soll die räumlich-zeitliche Expression der Gene in den koexprimierten Genclustern durch whole-mount in situ Hybridisierung ermittelt werden, um ihre Zugehörigkeit zu echten Synexpressionsgruppen zu bestätigen und um die zu Grunde liegenden molekularen Wege zu assemblieren. Im zweiten Teil des Antrags soll eine Systemanlage der BMP4 Synexpressionsgruppe durchgeführt werden. Es hat sich herauskristallisiert, daß viele Mitglieder von Synexpressionsgruppen, die Signalwege betreffen, negative Rückkopplungs-Inhibitoren sind. Die quantitative Theorie dynamischer Systeme macht bestimmte Vorhersagen hinsichtlich der Bedeutung solcher Rückkopplung für die interne Regulation von Signalwegen. Wir planen diese Vorhersagen zu testen, indem wir die Rolle des negativen Rückkopplungsfaktoren BAMBI im BMP4 Signalweg mittels eines in vitro Systems und GFP Echtzeit Analyse untersuchen.

共表达群属于Genen簇，以分子形式存在，如z.B.蛋白质结合、染色质结构和真菌信号因子。在Hefe、Zebrafisch、Maus和Mensch中，同义词群也是如此，它们都被沃登所取代，而且也是一个非常冗长的名词。共表达组的鉴定主要是分子组装途径和功能未知基因的发现。首先，我们用非洲爪蟾cDNA微阵列进行了一次大规模的聚类实验。大足通过对梅尔和50个不同的基因组中40000个EST的表达谱分析。通过整体原位杂交，Antrag可在小鼠胚胎中进行基因的实时表达，使其表达水平达到最佳水平，并使其基本分子水平达到最佳水平。Im zweiten Teil des Antrags soll eine Systemanlage der BMP 4 Synexpressgrouppe durchgeführt韦尔登.这是一个非常有趣的现象，来自Synexpressionsgruppen的许多Mitglieder，信号线更好，负Rückkopplungs-Inhibitoren sind。Die quantitative Theorie dynamischer System macht bestimmte Vorhersagen hinsichtlich der Bedeutung solcher Rückkopplung für die interne Regulation von Signalwegen.我们计划进行这项试验，即在体外系统和GFP检测分析中使用BMP 4信号通路检测BAMBI的阴性Rückkopplungsfaktoren作用。