Struktur-Untersuchung von HLA-B*3501 mit dem 14mer T-Zell Epitop LPAVVGLSPGEQEY

使用 14mer T 细胞表位 LPAVVGLSPGEQEY 进行 HLA-B*3501 的结构研究

• 批准号: 5404082
• 负责人: Dr. Michael Probst-Kepper
• 金额: --
• 依托单位: Klinik für Allgemein-, Viszeral- und Transplantationschirurgie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2002-12-31 至 2006-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5404082?language=en
• 关键词: Struktur; Untersuchung; von; HLA; 3501

Die Struktur-Funktions-Beziehung des HLA-B*3501/b2M/14mer Komplexes soll mit Proteinkristallographischen Methoden untersucht werden. Ausgehend von der bekannten Struktur von HLA-B*3501 mit dem HIV-Octamer VPLRPMTY sowie dem EBNA-Nonamer LPPLDITPY, welche beide das bisher bekannte B35-Ankermotiv aufweisen, soll die Wechselwirkung des nach dem bisherigen Kenntnisstand für B*3501 zu langen 14mer Peptides LPAVVGLSPGEQEY mit seinem veränderten Ankermotiv mit der HLA-Bindungstasche von B*3501 untersucht werden. Im besonderen ist zuerst die Frage nach einem bulge-out oder einem N- oder C-terminalen Überhängen des 14mer Peptides zu klären. Theoretisch sollte ein C-terminales Überhängen auszuschließen sein, da die strukturelle Basis für das C-terminal bevorzugte Tyrosin durch die Kristallisation mit dem HIV-Octamer VPLRPMTY erarbeitet wurde und das Tyrosin ebenfalls notwendiger Anker für das 14mer ist. Damit ist aber nicht notwendiger Weise auch ein N-terminales Überhängen ausgeschlossen. Dazu werden die strukturellen Unterschiede ausgewählter APLs mit antagonistischer und partiell agonistischer Wirkung untersucht. Des Weiteren ergeben sich hierbei auch Möglichkeiten zur Beantwortung von Fragen der spezifischen T CR-Erkennung im Kontext der neuen Struktur, da die TCRa und -b Kette des spezifischen T-Zell Klons verfügbar sind. Diese Kenntnisse sollen zur Entwicklung von besseren Vorhersage-Algorithmen zur alternativen Peptidbindung von HLA-B*3501 sowie einen tieferen Verständnis der spezifischen TCR/Peptid/MHC Interaktion und Struktur-Funktionsbeziehung von partiell agonistischen und antagonistischen Peptiden beitragen. Die biologischen Unterschiede der APL werden durch Genprofilling im Vergleich mit der Wirkung des wt Peptids im Zusammenhang mit den aus den vorliegenden genetischen Programmen anerger CD8 und CD4 T-Zellen untersucht.

用蛋白质印迹法测定HLA-B*3501/b2 M/14聚体复合物的结构功能。用EBNA-九聚体LPPLDITPY对HLA-B*3501的八聚体VPLRPMTY结构进行检测，然后用14聚体肽LPAVVGLSPGEQEY与B * 3501的HLA-Bindungstasche进行比较，发现B35-Ankermotiv具有更强的免疫原性。我最喜欢的是14聚体肽的N-或C-末端凸起的Frage。Theoretisch sollte ein C-terminales Überhängen auszuschließen sein，da die strukturelle Basis für das C-terminal bevorzugte Tyrosin durch die Kristallisation mit dem HIV-Octamer VPLRPMTY erarbeitet wurde and das Tyrosin ebenfalls notwendiger Anker für das 14mer ist.但这并不意味着Weise也有一个N-末端。因此，韦尔登采用了对抗性和部分对抗性武器来对付杀伤人员地雷。Des Weiteren ergeben sich hierbei auch Möglichkeiten zur Beantwortung von Fragen der specifischen T CR-Erkennung im Kontext der neuen Struktur，da die TCR a und -B Kette des specifischen T-Zell Klons verfügbar sind.本文通过对HLA-B*3501特异性TCR/肽/MHC相互作用和结构功能的研究，探讨了HLA-B*3501特异性肽结合的最佳选择。APL韦尔登的生物学研究是通过基因组学的方法进行的，该方法使用了CD 8和CD 4 T-Zellen的遗传程序。