Evolution of coordinated regulation of microRNAs and transcription factors

microRNA和转录因子协调调控的进化

• 批准号: 23570273
• 负责人: IWAMA Hisakazu
• 金额: $ 2.25万
• 依托单位: Kagawa University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23570273/
• 关键词: マイクロＲＮＡ; 転写因子; 協調的遺伝子制御; cis-element; 遺伝子進化; マイクロRNA; 協調的制御; ターゲット遺伝子; 遺伝子制御網; 行列; 遺伝子の生成死滅過程; ゲノムアライメント; HITS-CLIP; PAR-CLIP

A method to identify the evolutionary period of origin of human microRNAs (miRNAs) was established based on the genome synteny information. Applying the method to the genomes of 43 species estimated the period of origin for each of 1433 human miRNAs. Based on the estimation, the categories of transcription factors significantly associated with the evolutionary periods of origin of human miRNAs were specified. Furthermore, the rate at which human miRNAs originated was shown to have two peaks at the early phase of mammalian evolution and at the initial phase hominoid evolution, suggesting the effects of the two periods on the human transcriptom.

建立了一种基于基因组同线性信息的人类microRNAs（miRNAs）起源进化时期的鉴定方法。将该方法应用于43个物种的基因组，估计了1433种人类miRNAs中每一种的起源时期。基于估计，确定了与人类miRNAs起源进化时期显着相关的转录因子类别。此外，人类miRNAs的起源速率在哺乳动物进化的早期阶段和类人猿进化的初始阶段有两个高峰，表明这两个阶段对人类转录组的影响。

项目成果

Coordinated Networks of microRNAs and Transcription Factors with Evolutionary Perspectives

• DOI: 10.1007/978-94-007-5590-1_10
• 发表时间: 2013-01-01
• 期刊: MICRORNA CANCER REGULATION: ADVANCED CONCEPTS, BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY TOOLS
• 作者: Iwama, Hisakazu

ヒト・マイクロRNA遺伝子ファミリーの進化と起源推定

人类microRNA基因家族的进化和起源估计

• 发表时间: 2014
• 期刊: 生体の科学
• 作者: T.Kinouchi;N.Fujii;N.Fujii;岩間久和
• 通讯作者: 岩間久和

Transcriptional double-autorepression feedforward circuits act for multicellularity and nervous system development.

• DOI: 10.1186/1471-2164-12-228
• 发表时间: 2011-05-11
• 期刊: BMC genomics
• 影响因子: 4.4
• 作者: Iwama H;Murao K;Imachi H;Ishida T
• 通讯作者: Ishida T

哺乳類進化過程でのヒト・マイクロRNA生起とターゲット配列との関連

哺乳动物进化过程中人类microRNA的出现与靶序列的关系

• 发表时间: 2013
• 作者: 岩間久和;加藤清仁;井町仁美;村尾孝児;正木勉
• 通讯作者: 正木勉

二重自己抑制性のフィードフォワード遺伝子制御の多細胞性への関与とマイクロRNA寄与の可能性

多细胞性中双重自抑制前馈基因调控的参与以及 microRNA 的可能贡献

• 发表时间: 2011
• 作者: 岩間久和;井町仁美;村尾孝児
• 通讯作者: 村尾孝児