Development of the methods for the Diatom tests utilizing DNA binding ability of frustle

利用硅藻的 DNA 结合能力开发硅藻测试方法

• 批准号: 23590854
• 负责人: SEO Yasuhisa
• 金额: $ 3.49万
• 依托单位: Oita University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23590854/
• 关键词: 溺死; プランクトン; 珪藻; DNA; PCRフラグメント; 酵素染色; 血液; 硅藻; ＤＮＡ

We have focused on the DNA-binding abilities of the diatom frustule, which is constructed of silica, in the presence of chaotropic ions, in an attempt to devise a better forensic test for diatoms. It is proved possible to capture diatoms via lambda DNA using silica-coated magnetic beads followed by isolation and purification from the Mag beads.For purification of diatoms from the blood, DNA binding ability of diatom frustule in the presence of chaotropic agent was utilized. The procedure is basically same as commonly used method for DNA purification from the blood as Proteinase K treatment and denaturation using chaotropic agent. Under this condition, the DNA adsorbed to the diatom and formed DNA/diatom complex. DNA/diatom complex was simply recovered ethanol precipitation and then the DNA was fragmented using DNase.we also developed and evaluated a method for staining diatoms that exploits the DNA binding ability of silica.

我们重点研究了硅藻在杂色离子存在下与DNA结合的能力，试图设计出一种更好的硅藻法医检测方法。利用硅胶包裹的磁珠通过lambda DNA捕获硅藻，然后从磁珠中分离纯化硅藻。为了从血液中纯化硅藻，利用了硅藻胞体在杂色剂存在下与DNA的结合能力。该方法与常用的从血液中提取DNA的方法基本相同，即用蛋白水解酶K处理，用变色剂变性。在此条件下，DNA吸附到硅藻上，形成DNA/硅藻复合体。DNA/硅藻复合体简单回收乙醇沉淀，DNA用DNA裂解。我们还开发和评价了一种利用硅胶的DNA结合能力的硅藻染色方法。

项目成果

DNA binding 特性を利用した珪藻被殻のサンドイッチ染色法

利用DNA结合特性的硅藻壳三明治染色方法

• 发表时间: 2013
• 作者: 中路伸也;岸田哲子;瀬尾泰久;黒木浩二
• 通讯作者: 黒木浩二

心臓血からの硅藻簡易検出法

从心脏血液中检测硅藻的简单方法

• 发表时间: 2012
• 作者: 佐藤伸悟;岸田哲子;瀬尾泰久;黒木浩二
• 通讯作者: 黒木浩二

心臓血からの珪藻簡易検出法

从心脏血液中检测硅藻的简单方法

• 发表时间: 2012
• 作者: 佐藤伸悟;岸田哲子;瀬尾泰久;黒木浩二
• 通讯作者: 黒木浩二

A simple DNA coprecipitation method for the detection of diatoms in heart blood.

• DOI: 10.1016/j.forsciint.2013.07.016
• 发表时间: 2013-10
• 期刊: Forensic science international
• 影响因子: 2.2
• 作者: Yasuhisa Seo;Shingo Sato;K. Kuroki;T. Kishida

珪藻のDNA binding特性を利用した溺死診断法の改良について

利用硅藻DNA结合特性改进溺水诊断方法

• 发表时间: 2011
• 作者: 一田大輔;瀬尾泰久;黒木浩二;岸田哲子
• 通讯作者: 岸田哲子