Comprehensive analysis of intracellular proteins on the cell surface for elucidation of their roles in tissue damage and repair.

全面分析细胞表面的细胞内蛋白质，阐明它们在组织损伤和修复中的作用。

• 批准号: 23592670
• 负责人: IZUMI Tomonori
• 金额: $ 3.24万
• 依托单位: Yamaguchi University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23592670/
• 关键词: 機能プロテオーム解析; 細胞表面標識; 細胞質漏出; 炎症メディエーター; 疾患マーカー

Although various intracellular proteins are released from damaged tissues, functional impact of these proteins in the extracellular space remains largely unknown. To characterize intracellular proteins potentially functioning in the extracellular space and affecting cellular responses, cell surface-associated proteins were selectively identified using a combination of cell surface labeling and mass spectrometry-based protein identification technology. We identified 454 proteins, including 405 putative intracellular proteins, on the surface of U937 cells. Besides a variety of high-abundance proteins, the protein subset included some of clinical markers, such as HMGB1. Out of the 405 proteins, 162 proteins were also found to be released from damaged HEK293 cells. Furthermore, a certain protein was confirmed to affect a signal transduction pathway in U937 cells.

尽管各种细胞内蛋白质从受损组织中释放出来，但这些蛋白质在细胞外空间中的功能影响仍然很大程度上未知。 为了表征可能在细胞外空间发挥作用并影响细胞反应的细胞内蛋白质，结合细胞表面标记和基于质谱的蛋白质鉴定技术，选择性地鉴定了细胞表面相关蛋白质。 我们在 U937 细胞表面鉴定了 454 种蛋白质，其中包括 405 种推定的细胞内蛋白质。 除了各种高丰度蛋白质外，蛋白质子集还包括一些临床标志物，例如 HMGB1。 在 405 种蛋白质中，还发现有 162 种蛋白质从受损的 HEK293 细胞中释放出来。 此外，某种蛋白质被证实影响U937细胞中的信号转导途径。

项目成果

損傷細胞から放出されヒト単球細胞株U937細胞表面と相互作用する細胞内タンパク質のプロテオーム解析

对受损细胞释放的细胞内蛋白进行蛋白质组学分析，并与人单核细胞系 U937 的细胞表面相互作用

• 发表时间: 2013
• 作者: 高見佳宏;長嶋有紀;秋山豪ほか;小田ちぐさ;泉友則,横山勝巳,坂井田功
• 通讯作者: 泉友則,横山勝巳,坂井田功

Selective analysis of cell surface-associated proteins: characterization of intracellular proteins that are released from damaged cells and interact with the surface of human monocytic cell line U937.

细胞表面相关蛋白的选择性分析：受损细胞释放并与人单核细胞系 U937 表面相互作用的细胞内蛋白的表征。

• 发表时间: 2013
• 作者: Izumi T;Yokoyama K;Sakaida I
• 通讯作者: Sakaida I

Selective analysis of cell surface-associated proteins : characterization of intracellular proteins that are released from damaged cells and interact with the surface of human monocytic cell line U937

细胞表面相关蛋白的选择性分析：受损细胞释放并与人单核细胞系 U937 表面相互作用的细胞内蛋白的表征

• 发表时间: 2013
• 作者: Miki H;Nakahashi-Oda C;Shibuya A;田中一郎;泉友則,横山勝巳,坂井田功
• 通讯作者: 泉友則,横山勝巳,坂井田功

臓器プロテオームの比較解析

器官蛋白质组的比较分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 泉 友則;今利詩聖;黒木梨沙;前田有美
• 通讯作者: 前田有美

パイロット研究:U937細胞表面に結合する細胞内タンパク質の選択的同定

初步研究：选择性鉴定与 U937 细胞表面结合的细胞内蛋白

• 发表时间: 2012
• 作者: 小田(中橋)ちぐさ;大河内信弘;渋谷彰;泉友則,横山勝巳,坂井田功
• 通讯作者: 泉友則,横山勝巳,坂井田功