Genome sequence analysis of biofilm-forming Streptococcus constellatus

生物膜形成星座链球菌的基因组序列分析

• 批准号: 23592724
• 负责人: FUKUSHIMA Hisanori
• 金额: $ 3.24万
• 依托单位: Osaka Dental University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23592724/
• 关键词: バイオフィルム; ストレプトコッカス; ゲノム; 病原性; ストレプトコッカス・コンステラタス; 口腔膿瘍

We isolated Streptococcus constellatus strain H39 from an apical abscess lesion. Scanning electron micrographs revealed that strain H39 had dense meshwork-like structures around the cells, which are a characteristic of exopolysaccharide-producing bacteria. Strain H39 grown in flow chambers formed biofilm. We reported a draft genome sequencing of strain H39 which can be used for further genetic study on biofilm formation mechanisms. The genome sequencing was performed by pyrosequencing. The putative gaps between contigs were closed by sequencing of polymerase chain reaction amplicons over the gaps. A high-quality draft genome sequence indicated that strain H39 had 3 ribosomal RNA genes, 45 transfer RNA genes and 1,926 putative protein-coding genes. We also found that strain H39 possessed genes encoding exopolysaccharide biosynthesis proteins and ABC-type polysaccharide transport proteins. These genes might contribute to the biofilm formation of S. constellatus.

我们从根尖脓肿病灶中分离出星座链球菌H39株。扫描电子显微照片显示菌株H39在细胞周围具有致密的网状结构，这是产胞外多糖细菌的特征。菌株H39在流动室中生长形成生物膜。我们报道了H39菌株的基因组测序草图，可用于进一步的生物膜形成机制的遗传研究。通过焦磷酸测序进行基因组测序。重叠群之间的推定缺口通过对缺口上的聚合酶链反应扩增子进行测序来闭合。高质量的基因组测序结果表明，H39菌株含有3个核糖体RNA基因、45个转运RNA基因和1,926个蛋白质编码基因。我们还发现菌株H39具有编码胞外多糖合成蛋白和ABC型多糖转运蛋白的基因。这些基因可能与S.星座。

项目成果

口腔膿瘍から分離したStreptococcus intermediusのゲノム解析

口腔脓肿中分离出的中间链球菌的基因组分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 三島弘幸;井上昌子;門田理佳;服部淳彦;鈴木信雄;筧光夫;松本敬;里村一人;見明康雄;山根一芳,南部隆之,真下千穂,山中武志,福島久典
• 通讯作者: 山根一芳,南部隆之,真下千穂,山中武志,福島久典

難治性根尖性歯周炎から分離したRothia mucilaginosa DY-18株のバイオフィルム形成関連遺伝子の検索

寻找与难治性根尖周炎分离的Rothia mucilaginosa DY-18菌株中生物膜形成相关的基因

• 发表时间: 2011
• 作者: バワール ウジャール;伊藤由美;安孫子宜光;藤平智広,山根一芳,吉田匡宏,山中武志,福島久典,林宏行
• 通讯作者: 藤平智広,山根一芳,吉田匡宏,山中武志,福島久典,林宏行

Gene expression profiles of Rothia mucilaginosa grown under diamide stress. International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology

在二酰胺胁迫下生长的 Rothia mucilaginosa 的基因表达谱。

• 发表时间: 2011
• 作者: Nambu T;Yamane K;Yamanaka T;Mashimo C;Fukushima H
• 通讯作者: Fukushima H

矯正線表面へのActinomyces oris MG‐1株の付着性

口放线菌 MG-1 菌株对正畸线表面的粘附

• 发表时间: 2012
• 作者: 須和部京介;吉田康夫;伊東俊太郎;永野恵司;八重柏隆;吉村文信;大前有紀,山根一芳,南部隆之,松本尚之
• 通讯作者: 大前有紀,山根一芳,南部隆之,松本尚之

Development of new plasmids for cloning and expression in oral Actinomyces spp

开发用于口腔放线菌克隆和表达的新质粒

• 发表时间: 2012
• 作者: Mashimo C;Nambu T;Maruyama H;Yamane K;Yamanaka T;Fukushima H
• 通讯作者: Fukushima H