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クローン植物の環境適応におけるエピジェネティック変異の役割

表观遗传突变在克隆植物环境适应中的作用

基本信息

批准号：
11J00907
负责人：
荒木希和子
金额：
$ 1.54万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2013
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は「クローン植物の環境適応におけるエピジェネティック変異の役割を明らかにすること」を目的とし, クローン成長により新たな植物体を構成するクローン植物の遺伝的個体が, 野外の生育地の微小環境へ適応するための機構として, 塩基配列の変化を伴わないエピジェネティック変異の役割を明らかにすることを目指す. 本年度は,1)野外集団でのクローン構造(ジェネットの分布)とエピジェネティック変異の空間解析に関して, 23,24年度の結果を学会や投稿論文として公表する準備を行い, 単行本の執筆と編集を進めた. また, 同属のクローナル植物Cardamine leicanthaとC. trifoliaを対象にRAD-seqによりゲノムワイドのSNP多型を用いたクローン構造の解析を行った. その結果, 明瞭なクローン構造を示しクローンがパッチ状に分布するC. leucanthaとは対照的にC. trifoliaは集団内の個体の遺伝的変異は非常に小さくエピジェネティック変異が生育地環境への応答に重要な役割を担っている可能性が示唆された.2)栽培環境下での形態, 遺伝子発現, メチル化, 遺伝的変異の解析による環境応答メカニズムの評価に関して, 被陰とコントロールプロットで同一クローン株を栽培し, 光環境による表現型の違いを調べるとともにメチル化変異を調べるためのサンプルを採取した. 2条件間では同一クローンであっても開花数や葉数, 葉の質感などが異なっていた. 次にゲノムワイドに詳細なメチル化変異を解析するために, reference genomeの構築を行うとともに, 2条件で栽培した同一クローンのラメットを対象にバイサルファイトシーケンスを行った. 分析したデータを解析し, 条件間でのメチル化変異の程度やその領域を特定した. 興味深い遺伝子領域については他のサンプルでも分析を行っている.

The purpose of this study is to change the plant environment, plant growth, plant growth, environmental protection, environmental In the base configuration, there is no need to know what to do with each other. This year, 1) in the field, the public table is ready for submission, and this set of executive editors is ready for further development. In the same genus, the plant Cardamine leicantha C. trifolia is similar to that of RAD-seq, which is similar to SNP polymorphisms. According to the results, it is clear that there is a significant increase in the number of individuals in the leucantha collection, such as the number of individuals in the trifolia collection. The results show that there is a significant difference in the results of the results. 2) the shape of the plant in the cultivation environment, the possibility of supporting the burden of important vehicles in the environment, and so on. 2) the shape of the plant in the cultivation environment. The analysis of the environment is due to the impact of environmental pollution on the same plant. The light environment is very sensitive to the environmental impact of environmental pollution. (2) compare the number of flowers in the same number of flowers between conditions, and you will feel the difference. In the second time, we need to know that there are some problems in the analysis, reference genome, and so on. In 2 conditions, the cultivation is the same, the same is the same, the same is the same. The analysis is based on the analysis of the situation, and the level of the analysis is related to the specific situation in the field. There is a deep taste and a deep taste in the sub-field.