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有毒ミクロキスティス殺滅ファージの感染に関する生理・分子生態学的研究

有毒微囊藻噬菌体感染的生理和分子生态学研究

基本信息

批准号：
11J03313
负责人：
木村成子
金额：
$ 0.83万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2011
资助国家：
日本
起止时间：
2011 至 2012
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は、アオコ防除へ向けた基礎的研究として、分子生物学的手法を用いて、環境中におけるミクロキスティス個体群の消長に及ぼす本種感染性ファージ(以下、ファージ)の影響を評価することを目的としている。昨年度明らかとしたファージ感染サイクルや娘ファージの挙動を踏まえて、本年度は、ファージの遺伝的多様性および季節変動を調査し、ファージ感染を受けている宿主細胞数を推定することで、ファージ感染が宿主動態へ及ぼす影響について評価した。京都市広沢池において、2006年から2011年までのアオコ発生時期に計23回、Ma-LMM01タイプファージ尾部遺伝子(g91)の多様性を調査した。計810クローンの塩基配列を決定し、それらは100%塩基配列相同性で419遺伝子型に分類された。最節約ネットワークを構築した結果、それらの遺伝子型はグループI-IIIに分けられた。各グループは、それらの出現頻度に応じて分類された5つの主要型、6つの準主要型、および408つの希少型から構成された。多様性解析の結果、ファージの高い多様性が維持されていることが示され、これは主要および準主要型の1塩基多型である希少型が多数存在したことに由来した。また、調査期間を通して共存する主要型の経時的変動、および希少型の出現パターンから、ファージの遺伝的多様性は、頻度依存選択が働くことにより維持され、宿主との軍拡競争型共進化により創出されることが明らかとなった。これまで、最も小さなグループIIIに属するファージのみを定量していたことが明らかとなった。そこで、グループI-IIIのファージすべてを定量することで、Ma-LMM01タイプファージに感受性である宿主の被感染率を算出したところ、それは0.05-36%だった。従って、ファージ感染は宿主個体群組成の変動のみならず、本ファージ感受性宿主動態へ影響を及ぼす可能性が示された。

The purpose of this study is to prevent and cure the disease, the methods of molecular biology, the growth and decline of individuals in the environment, and the infection of this type of infectious virus (below). The purpose of this study is to affect the purpose of this study. The number of infected hosts is estimated to be affected by the number of infected hosts in the past year, in the current year, in the current season, in the current year, in the current year, and in the current year. The number of infected host cells is presumed to be infected. There are 23 cycles of birth time in Beijing, 2006 and 2011, and multiple pregnancy in the tail of Ma-LMM01 (G91). A total of 810 people are required to decide on the basis of decision and 100% on the basis of similarity. 419 sub-types are classified into categories. The most important thing is that you need to know the results and the results of the test. The sub-type of I-III is divided into two parts. The information is divided into five major types, six major types, and 408 rare and minor types. The results of multi-sex analysis, the results of multi-sex analysis, During the period of the war, the movement of the main types of the co-existing models, the presence of a small number of models, the multiplicity of the major types, and the degree of dependency are selected to ensure the maintenance of the system, and the host military competition model is used to realize the operation of the host military. This is the most important thing in the world. The most important thing is that the III is the most important thing. The infection rate of the host was calculated by the calculation of the infection rate of the host, the infection rate of the host and the rate of infection. The host groups of infected patients and infected hosts are grouped into dynamic host clusters, which are sensitive to host dynamics and show the possibility of infection.