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有毒ミクロキスティス殺滅ファージの感染に関する生理・分子生態学的研究

有毒ミクロキスティス殺滅ファージの感染に関する生理・分子生態学的研究
有毒微囊藻噬菌体感染的生理和分子生态学研究
批准号:
11J03313
负责人:
木村 成子
金额:
$0.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2012

项目摘要

项目成果

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本研究は、アオコ防除へ向けた基礎的研究として、分子生物学的手法を用いて、環境中におけるミクロキスティス個体群の消長に及ぼす本種感染性ファージ(以下、ファージ)の影響を評価することを目的としている。昨年度明らかとしたファージ感染サイクルや娘ファージの挙動を踏まえて、本年度は、ファージの遺伝的多様性および季節変動を調査し、ファージ感染を受けている宿主細胞数を推定することで、ファージ感染が宿主動態へ及ぼす影響について評価した。京都市広沢池において、2006年から2011年までのアオコ発生時期に計23回、Ma-LMM01タイプファージ尾部遺伝子(g91)の多様性を調査した。計810クローンの塩基配列を決定し、それらは100%塩基配列相同性で419遺伝子型に分類された。最節約ネットワークを構築した結果、それらの遺伝子型はグループI-IIIに分けられた。各グループは、それらの出現頻度に応じて分類された5つの主要型、6つの準主要型、および408つの希少型から構成された。多様性解析の結果、ファージの高い多様性が維持されていることが示され、これは主要および準主要型の1塩基多型である希少型が多数存在したことに由来した。また、調査期間を通して共存する主要型の経時的変動、および希少型の出現パターンから、ファージの遺伝的多様性は、頻度依存選択が働くことにより維持され、宿主との軍拡競争型共進化により創出されることが明らかとなった。これまで、最も小さなグループIIIに属するファージのみを定量していたことが明らかとなった。そこで、グループI-IIIのファージすべてを定量することで、Ma-LMM01タイプファージに感受性である宿主の被感染率を算出したところ、それは0.05-36%だった。従って、ファージ感染は宿主個体群組成の変動のみならず、本ファージ感受性宿主動態へ影響を及ぼす可能性が示された。
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会议论文
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [木村成子, 吉田天士, 細田直彦, 本田貴史, 久野草太郎, 上地里佳枝, 左子芳彦]
通讯作者: 左子芳彦
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [木村成子, 吉田天士, 細田直彦, 本田貴史, 久野草太郎, 上地里佳枝, 左子芳彦]
通讯作者: 左子芳彦
DOI: --
发表时间: 2012
期刊:
影响因子: --
作者: [上地里佳枝, 吉田天士, 細田直彦, 本田貴史, 木村成子, 久野草太郎, 金子貴一, 左子芳彦]
通讯作者: 左子芳彦
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [上地里佳枝, 吉田天士, 細田面彦, 本田貴史, 木村成子, 久野草太郎, 左子芳彦]
通讯作者: 左子芳彦
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    環境水中における共進化を通じた細菌とウイルスの遺伝的多様性の創出と維持機構の解明
    • 批准号:
      16J08078
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $2.83万
    • 财政年份:
      2016
    • 负责人:
      木村 成子
    • 依托单位:
    海外基金