A novel method for comprehensive detection of protein complexes in photosynthetic organisms

一种综合检测光合生物中蛋白质复合物的新方法

• 批准号: 23770035
• 负责人: TAKABAYASHI Atsushi
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2013
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23770035/
• 关键词: タンパク質複合体解析; 光合成生物; データベース; タンパク質複合体; 光合成; プロテオーム

To explore protein complexes systematically, we have tried to identify protein complexes by using the Blue-Native PAGE coupled with LC-MS/MS approach. We applied the approach into several photosynthetic organisms. Then, we constructed a new Web-based database PCoM-DB (http://pcomdb.lowtem.hokudai.ac.jp/proteins/top/) to make our data to public. Users can predict interaction partners with their proteins of interest through a user-friendly interface. I hope that the database to help users to find new protein complexes, which can contributes to understand cellular mechanisms in photosynthetic organisms.

为了系统地探索蛋白质复合物，我们尝试使用蓝色非变性PAGE结合LC-MS/MS方法来鉴定蛋白质复合物。我们将这种方法应用于几种光合生物。然后，我们构建了一个新的基于Web的数据库PCoM-DB（http：//pcomdb.lowtem.hokudai.ac.jp/proteins/top/），使我们的数据公开。用户可以通过用户友好的界面预测与感兴趣的蛋白质的相互作用伙伴。我希望该数据库能够帮助用户发现新的蛋白质复合物，从而有助于理解光合生物的细胞机制。

项目成果

The application of BN-PAGE for comprehensive detection of the protein complexes in the chloroplast,シンポジウム「Basis, application and future of the blue-native PAGE in plant sciences」

BN-PAGE在叶绿体中蛋白质复合物综合检测中的应用,研讨会“蓝色原生PAGE在植物科学中的基础、应用和未来”

• 发表时间: 2011
• 作者: Okajima;K.;Y. Aihara;Y. Takayama;M. Nakajima;S. Kashojiya;T. Hikima;T. Oroguchi;A. Kobayashi;Y. Sekiguchi;M. Yamamoto;T. Suzuki;A. Nagatani;M. Nakasako and S. Tokutomi;伊藤久美子，高井直樹，尾上靖宏，佐藤雅子，村山依子，今井圭子，近藤孝男;伊藤 秀臣;中島淳・小早川みどり・中村朋史・高久宏佑・鹿野雄一・乾隆帝・大石敏・鬼倉徳雄・細谷和海;吉本尚子;増田真二;Atsushi Takabayashi
• 通讯作者: Atsushi Takabayashi

Functional Analysis of Light-harvesting-like Protein 3 (LIL3) and Its Light-harvesting Chlorophyll-binding Motif in Arabidopsis

• DOI: 10.1074/jbc.m113.525428
• 发表时间: 2014-01-10
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Takahashi, Kaori;Takabayashi, Atsushi;Tanaka, Ryouichi
• 通讯作者: Tanaka, Ryouichi

新規手法による葉緑体タンパク質複合体の網羅的解析

使用新方法综合分析叶绿体蛋白质复合物

• 发表时间: 2012
• 作者: 高林厚史;栗原克宜;田中亮一;田中歩
• 通讯作者: 田中歩

Allocation of Absorbed Light Energy in PSII to Thermal Dissipations in the Presence or Absence of PsbS Subunits of Rice

• DOI: 10.1093/pcp/pcr119
• 发表时间: 2011-10-01
• 期刊: PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
• 影响因子: 4.9
• 作者: Ishida, Satoshi;Morita, Ken-Ichi;Endo, Tsuyoshi
• 通讯作者: Endo, Tsuyoshi

The oligomeric states of photosystems and light-harvesting complexes in the chlorophyll b-less mutant

无叶绿素 b 突变体中光系统和光捕获复合物的寡聚状态

• 发表时间: 2011
• 期刊: Plant & Cell Physiology
• 影响因子: 4.9
• 作者: Takabayashi A;Kuihara K;Kuwano M;Kasahara Y;Tanaka R;and Tanaka A
• 通讯作者: and Tanaka A