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連鎖球菌による宿主細胞表層多糖の認識及び分解機構の解明とその感染症治療への応用

阐明链球菌对宿主细胞表面多糖的识别和降解机制及其在感染性疾病治疗中的应用

基本信息

批准号：
12J02291
负责人：
中道優介
金额：
$ 1.15万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2012
资助国家：
日本
起止时间：
2012 至 2013
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12J02291/
关键词：
グリコサミノグリカンリアーゼヒドロラーゼ X線結晶構造解析

项目摘要

グリコサミノグリカン(GAG)には、1,3グリコシド結合を有するピアルロン酸やコンドロイチンと1,4グリコシド結合のヘパリンやヘパラン硫酸が存在する。本年度は、細菌における1,4結合のGAGの認識と分解に関わる分子機構の解明に焦点を当て、ヘパラン硫酸リアーゼ(HepC)の立体構造並びに不飽和ヘパリンニ糖に特異性を示す不飽和グルクロニルヒドロラーゼ(UGL)の立体構造と基質認識機構を解析した。[1] HepCの結晶構造GAG資化細菌Pedobacter heparinusに由来するHepCの立体構造を明らかにした。HepCはα/α-バレルのN末端ドメインと逆平行β-シートのC末端ドメインから構成されており、活性部位はドメイン間のクレフトに存在することが示唆された。[2] UGLによる不飽和ヘパリンニ糖の認識機構P. heparinus由来の不飽和ヘパリンニ糖に特異性を示すUGL (Phep_2830)の立体構造を分解能1.35Åで決定した。不飽和コンドロイチンニ糖に特異性を示すUGLとの構造比較、ドッキングシミュレーション、並びに変異体解析により、Phep_2830における不飽和ヘパリンニ糖の認識には、活性部位のポケット構造とループが重要であることが分かった。[3]ヘパリン/ヘパラン硫酸結合タンパク質の探索ヘパリンをリガンドとしたカラムを用いて、連鎖球菌の細胞表層画分からヘパリン/ヘパラン硫酸に親和性を示す分子量約40,000の候補タンパク質を得た。ヘパリンやヘパラン硫酸は、哺乳類を始めとする種々の動物の細胞外マトリックスに含まれるため、本研究成果は感染や共生などの細菌と宿主との相互作用機序の解明につながることが期待される。

GAG (GAG) is a 1,3-segment GAG junction. GAG is a 1,4-segment GAG junction. GAG is a 1,3-segment GAG junction. GAG is a 1,4-segment GAG junction. GAG is a 1,3-segment GAG junction. GAG is a 1,4-segment GAG junction. GAG is a 1,3-segment GAG junction. GAG is a 1,4-segment GAG junction This year, we focused on the elucidation of molecular mechanisms related to the recognition and decomposition of GAG binding in bacteria. We focused on the elucidation of the stereostructure of HepC and the unsaturation of HepC. We focused on the elucidation of the stereostructure and matrix recognition mechanism of UGL. [1]The crystal structure of HepC is derived from Pedobacter heparinus. HepC α/α-mer N-terminal segment and antiparallel β-mer C-terminal segment are composed of α/α-mer and β-mer active segments. [2]UGL Unsaturation UGL Unsaturation UGL Unsaturation Heparinus origin unsaturated sugar specificity shows UGL (Phep_2830) stereo structure can be determined by 1.35. Unsaturated sugar specificity shows UGL structure comparison, change in structure, and analysis of allogeneic species, Phep_2830, unsaturated sugar recognition, active site structure and importance. [3]A candidate for the molecular weight of about 40,000 was obtained by screening the cell surface of the linked cocci for the affinity of sulfuric acid. The results of this study are expected to clarify the mechanism of interaction between bacteria and hosts in infection and symbiosis.