疾病診断用アプタマーセンサーの構築に向けたシステム評価法の開発
构建疾病诊断适配体传感器的系统评价方法开发
基本信息
- 批准号:12J02937
- 负责人:
- 金额:$ 0.58万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2012
- 资助国家:日本
- 起止时间:2012 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本年度の研究では、標的分子を高感度に検出するためのバイオセンサーにおけるセンサー素子となるアプタマーの特性改良を目的として、研究者が所属する研究室独自の分子進化手法であるin silico maturation法を用いて血管内皮細胞増殖因子(VEGF)に結合するアプタマーおよび同分子検出システムの改良を試みた。本研究におけるアプタマーの親配列として、これまでに我々が獲得したVEGF121に結合するアプタマーを用いた。SPR測定による結合能評価と、コンピューター内での配列進化を1セットとした進化のラウンドを3ラウンド行った結果、親配列よりも16倍程度強いVEGF結合能を有するアプタマーを獲得した。また、進化後のアプタマーを二量体化することで二量体アプタマーを設計した。この二量体アプタマーはVEGFに対して非常に強い結合能(解離定数K_d=30pM)を示した。この二量体アプタマーの解離定数は現時点までに報告されているVEGF結合DNAアプタマーの中で最も強い結合能を示す値であり、既に疾病治療薬として実用化されているVEGF結合RNAアプタマーと同程度のものである。このように標的分子に対して強く結合するアプタマーは、バイオセンサーを構築する際の分子認識素子としてのみではなく、医薬品などへの応用が期待される。また、in silico maturation法による結合能改良の結果得られたアプタマーを用いて、VEGF検出システムの構築を試みた。標的分子検出のための原理として、ELISA法などに広く用いられている手法であるサンドイッチアッセイを用いた。担体上に固定化したアプタマーと酵素標識したアプタマーの2種類のアプタマーを用い、VEGFを金線電極上でサンドイッチした。その後、標識酵素の活性に由来する電子産出を電極上で検出することで、電気化学的にVEGFを検出するシステムを構築した。検討の結果、配列進化後のアプタマーを用いた場合において、進化前のアプタマーを用いた場合と比べて明らかな応答電流値の上昇が確認された。この事から、in silico maturation法によって結合能が改良されたアプタマーを用いてVEGF検出システムを構築することで、高感度なVEGF検出システムが構築できることが示された。
This year's study aimed to improve the properties of target molecules by detecting their high sensitivity and by using the silico maturation method to bind vascular endothelial growth factor (VEGF) to the molecular evolution of target molecules in the laboratory to which the researchers belong. In this study, we found that VEGF121 could be used in combination with other genes. SPR assay binding energy evaluation, alignment evolution within the range of 1 to 3 times, alignment results, 16 times stronger VEGF binding energy, alignment results. After the evolution of the two volume These two molecules are very strong binding energy (dissociation constant K_d=30pM). The dissociation of these two molecules is reported to be the strongest binding energy among VEGF-binding DNA molecules, and to the same extent as VEGF-binding RNA molecules for disease therapy. The target molecule is strongly bound to the target molecule, and the target molecule is strongly bound to the target molecule, and the target molecule is strongly bound to the target molecule. In silico maturation, the results were improved and VEGF expression was improved. The principle of target molecule identification and ELISA method are discussed. Immobilization of VEGF on the gold wire electrode After the identification of enzyme activity, electron production on the electrode, electrical and chemical VEGF detection system construction The result of the test is that the test results are different from those of the test results. This method is used to improve the sensitivity of VEGF expression system.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
VEGF結合アプタマーのin silico maturation
VEGF 结合适体的计算机成熟
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:安藤満;高橋有己;西川元也;渡部好彦;高倉喜信;野中 芳彦・深谷 剛弘・阿部 公一・ 吉田 亘・池袋 一典
- 通讯作者:野中 芳彦・深谷 剛弘・阿部 公一・ 吉田 亘・池袋 一典
Improvement of Affinities of VEGF-binding Aptamers for Biosensor by in silico maturation
通过计算机成熟提高 VEGF 结合适体对生物传感器的亲和力
- DOI:
- 发表时间:2012
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Y. Nonaka;T. Fukaya;K;Abe;K. Ikebukuro
- 通讯作者:K. Ikebukuro
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野中 芳彦其他文献
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