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Molecualr dynamics study on the molecuar permeability of membrane protein

Molecualr dynamics study on the molecuar permeability of membrane protein
膜蛋白分子通透性的分子动力学研究
批准号：
23750008
负责人：
SAITO Hiroaki
金额：
$1.33万
依托单位：
Kanazawa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2011
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2011 至 2013
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23750008/
关键词：
分子動力学法脂質二重層膜膜タンパク質自由エネルギーペプチドイオンチャネル溶媒和自由エネルギー分子動力学グラミシジン

项目摘要

项目成果

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We have carried out molecular dynamics simulations to analysis the structure and dynamics of peptide and membrane protein in several lipid bilayer environments and have investigated the ion and molecular permeability through the channel of membrane protein. The thermal stability of membrane protein in the lipid bilayers has also been investigated by free energy calculation.
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会议论文
Theoretical Study on Entrainment Phenomenon in Model Molecular Systems
模型分子系统中夹带现象的理论研究
DOI： 10.1063/1.4794669
发表时间： 2013
期刊： AIP Conference Proceedings
影响因子： --
作者： [H. Nagao, S. Kawamoto, M. Rusmerryani, A. Purqon, K. Kawaguchi, H. Saito]
通讯作者： H. Saito
Structure and lateral pressure profile of lipid bilayer containing gramicidin A by molecular dynamicssimulation
分子动力学模拟含短杆菌肽A的脂质双层的结构和侧压分布
DOI： --
发表时间： 2012
期刊：
影响因子： --
作者： [H. Saito, M. Iwayama, M. Nishimura, H. Takagi,K. Kawaguchi, H. Nagao]
通讯作者： H. Nagao
Transition State Analysis of Azurin via Go-like Model
通过 Go-like 模型分析天青蛋白的过渡态
DOI： 10.1063/1.4794651
发表时间： 2013
期刊： AIP Conf. Proc.
影响因子： --
作者： [Micke Rusmerryani, Meidy T. Pakpahan, Megumi Nishimura, Masako Takasu, Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao]
通讯作者： Hidemi Nagao
GPGPUによるエネルギー分布関数計算の高速化
使用GPGPU加速能量分布函数计算
DOI： --
发表时间： 2012
期刊：
影响因子： --
作者： [Koichiro Sadakane and Hideki Seto (oral presentation), 塩釜 拓仁，齋藤 大明，川口 一朋，長尾 秀実]
通讯作者： 塩釜 拓仁，齋藤 大明，川口 一朋，長尾 秀実
共 64 条
    An investigation regarding regulatory B cells in gastrointestinal cancer.
    • 批准号：
      16K10498
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.08万
    • 财政年份：
      2016
    • 负责人：
      SAITO Hiroaki
    • 依托单位：
      Tottori University
    The development of new immunotherapy by regulating immune checkpoint molecules for the treatment of digestive cancers
    • 批准号：
      23501285
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.33万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      SAITO Hiroaki
    • 依托单位：
      Tottori University
    The effect of i nterleukin-17 producing CD4+ T cells (T_H-17 cells) on immune system and progression of digestive cancer.
    • 批准号：
      20591571
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.0万
    • 财政年份：
      2008
    • 负责人：
      SAITO Hiroaki
    • 依托单位：
      Tottori University
    Study on the function of carbon transport by heterotrophic dinoflagellates
    • 批准号：
      17310016
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $8.38万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      SAITO Hiroaki
    • 依托单位：
      Fisheries Research Agency
    海外基金