Gemom-weite Matrix-CGH-Analyse des klassischen Hodgkin Lymphoms

经典霍奇金淋巴瘤的全基因组矩阵 CGH 分析

• 批准号: 5415327
• 负责人: Professor Dr. Harald Stein
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Pathologie (CCM)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2002-12-31 至 2010-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5415327?language=en
• 关键词: Gemom; weite; Matrix; CGH; Analyse

Die genomische Analyse der Tumorzellen (Hodgkin und Reed-Sternberg [HRS]-Zellen) des klassischen Hodgkin Lymphoms (cHL) steht erst am Beginn. Untersuchungen mittels der klassischen Zytogenetik ergaben bisher wenig charakteristische Chromosomenveränderungen bzw. Hinweise auf pathogenetisch wichtige Gene. Erst durch den Einsatz molekular-zytogenetischer Verfahren, wie der Vergleichenden Genomischen Hybridisierung (CGH) in Kombination mit Mikrodissektion der HRS-Zellen und universeller genomischer Amplifikation konnten charakteristische Zugewinne und Verluste identifiziert werden, die auf eine Reihe wichtiger Kandidatengene (z. B. REL) schließen ließen. Es ist Ziel des vorliegenden Antrags, das Ausmaß der genomischen Veränderungen der HRS-Zellen detailliert zu charakterisieren und neue Imbalancen aufzudecken. Dies soll vor allem durch Einsatz des Matrix-CGH Verfahrens (100-fach höhere Auflösung als die CGH) unter Verwendung eines Genom-weiten DNA-Chips (3000 BAC Klone) erreicht werden. Die gewonnenen Daten werden mit RNA-Expressionsprofilen von Hodgkin-Zelllinien korreliert sowie mittels bioinformatischer Methoden auf Zusammenhänge mit klinischen Parametern untersucht. Identifizierte Kandidatengene werden hinsichtlich ihrer Häufigkeit, Spezifität und prognostischen Relevanz an einem großen Patientenkollektiv mittels Immunhistologie, in-situ Hybridisierung und FISH unter Verwendung von Gewebe-Mikroarrays (TMAs) getestet.

经典型霍奇金淋巴瘤（cHL）的肿瘤（Hodgkin und Reed-Sternberg [HRS]-Zellen）基因组学分析始于早期。因此，经典的Zytogenetik工作更适合于具有特征的Chromosomenveränderungen bzw。Hinweise与致病性相关的基因。首先通过分子遗传学方法，如利用HRS-Zellen微电泳和通用基因组扩增技术结合的常规基因组杂交（CGH），获得了一个具有特异性和鉴别力的Kandidatengene（Z. B。REL）schließen ließen.这是一个非常复杂的问题，这是对HRS-Zellen基因组学的详细描述，它具有独特的特点和新的不平衡。通过使用基因组DNA芯片（3000 BAC克隆）构建一个CGH矩阵（100-fach höhere Auflösung als die CGH）来解决韦尔登问题。利用霍奇金-泽氏病的RNA表达谱获得的数据韦尔登，因此，它采用了生物信息学方法，并使用了最佳参数。通过免疫组织学、原位杂交和荧光原位杂交技术，在Gewebe-Mikroarrays（TMAs）上检测一个大的患者，可以识别出与Häufigkeit、Spezifität和Bistischen相关的Kandidatengene。