Proteomic analyses of autophagy-related structures in yeast

酵母自噬相关结构的蛋白质组学分析

• 批准号: 24770182
• 负责人: YAMAMOTO Hayashi
• 金额: $ 3万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24770182/
• 关键词: オートファジー; オートファゴソーム; 出芽酵母; 膜動態; 膜小胞; プロテオーム解析; ベシクル

Autophagy is a conserved degradation process, wherein autophagosomes are generated by cooperative actions of multiple autophagy-related (Atg) proteins. Previous studies using yeast Saccharomyces cerevisiae have provided various insights into the molecular basis of autophagy, however, the most intriguing issues in autophagy, namely, the origin of the autophagosomal membranes, remain to be elucidated. In this study, we succeeded to purify the autophagosomal membranes and the Atg9 vesicles, one of the autophagy-related membranes, and subjected them to proteomic analyses. These analyses showed that both the Atg9 vesicles and the autophagosomal membranes contain the TRAPPIII complex and its downstream factor Ypt1. Furthermore, we found that the Atg9 vesicles become part of the autophagosomal membranes, thereby recruiting the TRAPPIII complex and Ypt1 onto the autophagosomal membranes.

自噬是一种保守的降解过程，自噬体是由多种自噬相关蛋白（Autophagy -related, Atg）协同作用产生的。以往使用酵母的研究已经为自噬的分子基础提供了各种见解，然而，自噬中最有趣的问题，即自噬体膜的起源，仍有待阐明。在这项研究中，我们成功地纯化了自噬体膜和自噬相关膜之一的Atg9囊泡，并对它们进行了蛋白质组学分析。这些分析表明，Atg9囊泡和自噬体膜都含有TRAPPIII复合物及其下游因子Ypt1。此外，我们发现Atg9囊泡成为自噬体膜的一部分，从而将TRAPPIII复合物和Ypt1招募到自噬体膜上。

项目成果

Atg9 vesicles are an important membrane source during early steps of autophagosome formation.

• DOI: 10.1083/jcb.201202061
• 发表时间: 2012-07-23
• 期刊: The Journal of cell biology
• 作者: Yamamoto H;Kakuta S;Watanabe TM;Kitamura A;Sekito T;Kondo-Kakuta C;Ichikawa R;Kinjo M;Ohsumi Y
• 通讯作者: Ohsumi Y

Different phosphatidylinositol 3-phosphate asymmetries in yeast and mammalian autophagosomes revealed by a new electron microscopic technique.

通过新的电子显微镜技术揭示了酵母和哺乳动物自噬体中不同的磷脂酰肌醇 3-磷酸不对称性。

• 发表时间: 2014
• 期刊: Autophagy
• 影响因子: 13.3
• 作者: Fujimoto T.;Yamamoto;H.;and Ohsumi Y.
• 通讯作者: and Ohsumi Y.

Characterization and proteomic analysis of Atg9-containing structures in yeast

酵母中含有 Atg9 的结构的表征和蛋白质组学分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 山本林;大隅良典
• 通讯作者: 大隅良典

オートファジー関連タンパク質のリン酸化による機能制御

通过自噬相关蛋白的磷酸化进行功能控制

• 发表时间: 2014
• 作者: Yamaguchi;M.;Noda;N. N.;Yamamoto;H.;Shima;T.;Kumeta;H.;Kobashigawa;Y.;Akada;R.;Ohsumi;Y. and Inagaki;F;山本 林，鈴木 翔，藤岡 優子，木村 弥生，平野 久，野田 展生，大隅 良典
• 通讯作者: 山本 林，鈴木 翔，藤岡 優子，木村 弥生，平野 久，野田 展生，大隅 良典

Structural basis of starvation-induced assembly of the autophagy initiation complex

• DOI: 10.1038/nsmb.2822
• 发表时间: 2014-06-01
• 期刊: NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY
• 影响因子: 16.8
• 作者: Fujioka, Yuko;Suzuki, Sho W.;Noda, Nobuo N.
• 通讯作者: Noda, Nobuo N.