固液界面で機能する核酸-酵素ハイブリッド分子の創製とその高度利用

在固液界面发挥作用的核酸-酶杂化分子的创建及其高级利用

基本信息

  • 批准号:
    14J04260
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.6万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2014
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2014-04-25 至 2017-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究においては機能性生体分子であるDNAアプタマーとタンパク質に注目し、その二機能を合わせもつDNA-タンパク質ハイブリッド分子の創製及び応用を行っている。DNAアプタマーとは、標的分子に対して特異的に結合する機能性一本鎖核酸である。タンパク質は発光特性、触媒特性など多様な機能を有し、分子認識機能を有するDNAアプタマーへタンパク質をハイブリッド化すると、標的分子に対してDNA-タンパク質複合体を穏やかな条件で配置することができる。即ちハイブリッド分子により、カスケード反応場やナノ構造体を容易に構築可能である。このような応用を視野に入れた場合、ハイブリッド化において双方の機能性を最大にする必要がある。そこで報告者は、二種類の異なる酵素反応、ターミナルトランスフェラーゼ (TdT) 及び微生物由来トランスグルタミナーゼ (MTG) の基質特異性に着目し、部位特異的かつ高効率な複合化を進行させ、最終産物の機能損失を最小にする系を構築した 。昨年度から引き続き、まず、DNAアプタマーを用いた人工酵素を開発した。モデルとしたのは、セルロース系バイオマスの加水分解を触媒するセルラーゼである。報告者が最適化した手法でセルラーゼ (触媒ドメイン) とセルロース結合性アプタマーの複合化を行い、固体セルロース基質の加水分解反応へと応用して天然のセルラーゼに匹敵する機能性を確認した。さらに、天然型のセルラーゼと異なり、塩濃度に応答して活性がスイッチングする性質を発見し、その塩濃度依存性の結合特性を詳細に解析した。並行して、癌細胞イメージング試薬の開発を行い、新たなハイブリッド化法を検証した。新規ハイブリッド化法では、MTGの基質として、DNA側を一級アミン、タンパク質側をグルタミン (Gln) として、基質の最適を行い、汎用的、効率的かつハイブリッド分子の精製が容易な手法を目指した。
在这项研究中,我们专注于功能性生物分子DNA适体和蛋白质,并创建并应用了结合这两个功能的DNA-蛋白质混合分子。 DNA适体是一种功能性的单链核酸,该核酸特异性与靶分子结合。蛋白质具有多种功能,例如发光和催化特性,当蛋白质与具有分子识别功能的DNA适体杂交时,可以将DNA蛋白质复合物与靶分子相对于温和条件。也就是说,混合分子可以轻松构建级联反应场和纳米结构。当考虑此类应用时,有必要最大化两者在杂交中的功能。因此,重点是两个不同酶反应的底物特异性,末端转移酶(TDT)和微生物转谷氨酰胺酶(MTG),并构建了一个系统,该系统以特定地点特异性且高效的共轭进行进行,最小化最终产品的功能损失。从去年开始,我们首先使用DNA适体开发了人工酶。该模型是纤维素生物量催化水解的纤维素酶。将记者优化了纤维素酶(催化结构域)和纤维素结合的适体与纤维素结合的适体共轭,并将其应用于固体纤维素底物的水解反应,以确认功能与自然纤维素酶的功能相当。此外,与天然纤维素酶不同,发现对盐浓度的转换活性,并详细分析了盐浓度依赖性的结合特性。同时,开发了癌细胞成像试剂以验证新的杂交方法。在新型杂交方法中,通过使用DNA侧作为MTG的底物,将蛋白质侧用作主要胺和蛋白质侧作为底物,优化了底物,从而实现了通用,有效的方法,可以轻松纯化混合分子。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
酵素法によるアミノ化DNAのタンパク質標識と細胞染色への応用
使用酶法对胺化 DNA 进行蛋白质标记及其在细胞染色中的应用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    M. Takahara;H. Hayashi;M. Goto;N. Kamiya;高原 茉莉・若林 里衣・後藤 雅宏・神谷 典穂;高原 茉莉・南畑 孝介・若林 里衣・後藤 雅宏・神谷 典穂
  • 通讯作者:
    高原 茉莉・南畑 孝介・若林 里衣・後藤 雅宏・神谷 典穂
酵素反応を介した部位特異的な (酵素)n-DNA アプタマー複合化手法の開発
通过酶反应开发位点特异性(酶促)n-DNA 适体缀合方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高原茉莉;林浩之輔;後藤雅宏;神谷典穂
  • 通讯作者:
    神谷典穂
Design of an artificial cellulase with cellulose-binding DNA aptamer
具有纤维素结合DNA适体的人工纤维素酶的设计
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    M. Takahara;Y. Mori;G. A. L. Gonçalves;H. Nakazawa;M. Umetsu;N. Kamiya
  • 通讯作者:
    N. Kamiya
細胞染色を指向した新規DNA-タンパク質複合化法の開発
开发用于细胞染色的新 DNA-蛋白质缀合方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    M. Takahara;H. Hayashi;M. Goto;N. Kamiya;高原 茉莉・若林 里衣・後藤 雅宏・神谷 典穂
  • 通讯作者:
    高原 茉莉・若林 里衣・後藤 雅宏・神谷 典穂
固相基質に作用するDNAアプタマー-酵素複合体の開発
开发作用于固相底物的 DNA 适体-酶复合物
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高原茉莉;Budinova Geisa. A. L. G.;中澤 光;森 裕太郎;梅津 光央;神谷 典穂
  • 通讯作者:
    神谷 典穂
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  • 通讯作者:
    Y. Ogata
化学工学会第51回秋季大会 (化学工学会 第85年会の再公演) 2020年9月26日 招待有り 酵素反応による水溶性脂質化タンパク質の合成
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  • 作者:
    高原 茉莉;若林 里衣;後藤 雅宏;神谷 典穂
  • 通讯作者:
    神谷 典穂
酵素反応による部位特異的なタンパク質ジアシル化法の開発
利用酶反应开发位点特异性蛋白质二酰化方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高原 茉莉;若林 里衣;南畑 孝介;後藤 雅宏;神谷 典穂
  • 通讯作者:
    神谷 典穂
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高原 茉莉;藤本 直樹;若林 里衣;南畑 孝介;後藤 雅宏;神谷 典穂
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    神谷 典穂
CMB B-mode non-Gaussianity search
CMB B 模式非高斯搜索
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高原 茉莉;藤本 直樹;若林 里衣;南畑 孝介;後藤 雅宏;神谷 典穂;Y. Ogata;Maresuke Shiraishi;高原 茉莉;Y. Ogata;白石希典
  • 通讯作者:
    白石希典

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