電気化学高速AFMと構造解析を用いた新規キノヘモプロテインの電子移動機構の解析
電気化学高速AFMと構造解析を用いた新規キノヘモプロテインの電子移動機構の解析
批准号:
14J08641
负责人:
武田 康太
金额:
$1.22万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-04-25 至 2016-03-31
中文摘要
真核生物由来で初のピロロキノリンキノン(PQQ)酵素である担子菌Coprinopsis cinerea由来ピラノース脱水素酵素(CcPDH)は、新規PQQドメインに加えて、シトクロムドメインとセルロース結合性ドメインを有した、構造的に特徴のある菌体外酸化還元酵素である。全長酵素及び、各ドメインをそれぞれ切り離した組換え体を用いてその酵素学的性質を明らかとした。特徴的な性質として、逆いす形配座の立体配置をとる単糖に対して認識すること、セロビオース脱水素酵素のヘムドメインと類似した性質を有していること、さらにセルロースへの強い吸着能があることがわかった。各ドメインで至適pHが異なることを見出し、全体の電子伝達反応のなかで、分子内電子移動が反応の律速となっており、pHに依存していることが示唆された。電気化学測定により酵素内のPQQとヘムの酸化還元電位を決定することに成功し、本酵素の分子内電子移動機構が電位差によって制御されていることを示唆する結果を得た。全長およびPQQドメインのみからなるタンパク質を、種々の電極上に固定化し直接電子移動型の酵素電極反応に関する知見を得た。PQQドメインのみで直接電子移動反応が可能であることを新たに見出した。タンパク質内に結合したPQQの酸化還元に由来するピーク波を観測することができ、PQQ酵素でこのような電極間と効率的な直接電子移動反応が観察された例は初めてである。明らかにしたシトクロムドメインの構造解析を基に、変異体を作製して調べたところ、ヘム周辺の表面電荷がpHに依存したドメイン間の電子移動反応に関与することがわかり、変異によりpH依存性が変化する結果が得られたことは大変興味深い。金沢大との共同研究を遂行し、電気化学計測と高速原子間力顕微鏡(HS-AFM)の同時測定が可能な電気化学HS-AFM装置の構築をした。本手法により、酸化還元反応に伴うタンパク質一分子の動的挙動を直接観察が可能となる。
英文摘要
真核生物由来で初のピロロキノリンキノン(PQQ)酵素である担子菌Coprinopsis cinerea由来ピラノース脱水素酵素(CcPDH)は、新規PQQドメインに加えて、シトクロムドメインとセルロース結合性ドメインを有した、構造的に特徴のある菌体外酸化還元酵素である。全長酵素及び、各ドメインをそれぞれ切り離した組換え体を用いてその酵素学的性質を明らかとした。特徴的な性質として、逆いす形配座の立体配置をとる単糖に対して認識すること、セロビオース脱水素酵素のヘムドメインと類似した性質を有していること、さらにセルロースへの強い吸着能があることがわかった。各ドメインで至適pHが異なることを見出し、全体の電子伝達反応のなかで、分子内電子移動が反応の律速となっており、pHに依存していることが示唆された。電気化学測定により酵素内のPQQとヘムの酸化還元電位を決定することに成功し、本酵素の分子内電子移動機構が電位差によって制御されていることを示唆する結果を得た。全長およびPQQドメインのみからなるタンパク質を、種々の電極上に固定化し直接電子移動型の酵素電極反応に関する知見を得た。PQQドメインのみで直接電子移動反応が可能であることを新たに見出した。タンパク質内に結合したPQQの酸化還元に由来するピーク波を観測することができ、PQQ酵素でこのような電極間と効率的な直接電子移動反応が観察された例は初めてである。明らかにしたシトクロムドメインの構造解析を基に、変異体を作製して調べたところ、ヘム周辺の表面電荷がpHに依存したドメイン間の電子移動反応に関与することがわかり、変異によりpH依存性が変化する結果が得られたことは大変興味深い。金沢大との共同研究を遂行し、電気化学計測と高速原子間力顕微鏡(HS-AFM)の同時測定が可能な電気化学HS-AFM装置の構築をした。本手法により、酸化還元反応に伴うタンパク質一分子の動的挙動を直接観察が可能となる。
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Enzymatic properties of eukaryotic pyrroloquinoline quinone-dependent sugardehydrogenase belonging to a new auxiliary activity family 12
属于新辅助活性家族12的真核吡咯喹啉醌依赖性糖脱氢酶的酶学特性
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[K. Takeda, H. Matsumura, T. Ishida, M. Samejima, H. Ohno, M. Yoshida, K. Igarashi, N. Nakamura]
通讯作者:
N. Nakamura
DOI:
10.1128/jb.02376-14
发表时间:
2015-02
期刊:
Journal of Bacteriology
影响因子:
3.2
作者:
[Kiwamu Umezawa;K. Takeda;T. Ishida;Naoki Sunagawa;Akiko Makabe;K. Isobe;K. Koba;H. Ohno;M. Samejima;N. Nakamura;K. Igarashi;Makoto Yoshida]
通讯作者:
Kiwamu Umezawa;K. Takeda;T. Ishida;Naoki Sunagawa;Akiko Makabe;K. Isobe;K. Koba;H. Ohno;M. Samejima;N. Nakamura;K. Igarashi;Makoto Yoshida
PQQ依存性酵素を用いたガラクツロン酸酸化触媒によるガラクタロ-1,4-ラクトン生成
使用 PQQ 依赖性酶通过半乳糖醛酸氧化催化剂生产半乳糖 1,4-内酯
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[作田陸, 武田康太, 大野弘幸, 中村暢文]
通讯作者:
中村暢文
担子菌由来PQQキノヘモプロテイン糖質脱水素酵素の分子内電子移動と電極との直接電子移動
担子菌 PQQ 醌血红蛋白碳水化合物脱氢酶电极的分子内电子转移和直接电子转移
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[武田康太, 吉田誠, 五十嵐圭日子, 鮫島正浩, 中村暢文, 大野弘幸]
通讯作者:
大野弘幸
Direct bioelectrocatalysis of PQQ-dependent pyranose dehydrogenase adsorbed on a glassy carbon electrode at various pH levels
不同pH水平下吸附在玻碳电极上的PQQ依赖性吡喃糖脱氢酶的直接生物电催化
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[K. Takeda, H. Matsumura, T. Ishida, M. Yoshida, K. Igarashi, M.Samejima, N. Nakamura, H. Ohno]
通讯作者:
H. Ohno
共 23 条
Direct electron transfer reaction established by fungal redox proteins
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批准号:22K14826
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2022
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负责人:武田 康太
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依托单位:
海外基金