Elucidation of the integrated cellular network for mitochondrial biogenesis
Elucidation of the integrated cellular network for mitochondrial biogenesis
批准号:
15H05705
负责人:
ENDO Toshiya
金额:
$290.62万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015 至 2021
中文摘要
本研究では, サイトゾルからミトコンドリアへのタンパク質の輸送, および膜間の脂質の輸送を中心に, ミトコンドリアが細胞内でいかに作られるかという根源的問題の分子機構を統合的に理解することをめざしてきた。タンパク質の交通については, ミトコンドリア外膜で小分子やタンパク質の通り道を提供するバレル型構造の膜タンパク質(βバレル型膜タンパク質)の構造形成と外膜への挿入を担う, 必須トランスロケータ, SAM複合体の構造情報取得をめざした。そして、SAM複合体の、構成サブユニット(タンパク質)が異なる二つの複合体について、高分解能立体構造を決定することに成功した(Natureに発表)。得られた構造に基づき, SAM複合体がプレイスホルダーとしての構成タンパク質(Sam50とMdm10)および基質のβバレルタンパク質を入れ替えながら、基質のバレル構造形成を促し、外膜に組み込む新規の仕組み(βバレルスイッチモデル)を明らかにすることができた。細菌の外膜にも進化的に近い組み込み装置(BAM複合体)があるが、それとは組込みの仕組みがかなり異なることもわかった。βバレル型膜タンパク質の構造形成と膜への組込みという、膜タンパク質生合成に関する基本原理の理解を大きく進める、インパクトのある結果となった。ミトコンドリア外膜でタンパク質の品質管理に関わるAAAタンパク質のMsp1について, Msp1はミトコンドリアに誤配送されたテイルアンカー(TA)膜タンパク質を外膜から引き抜いてERに送り, ERで分解するか, 配送のやり直しをするかが決まることを見出していた。今回さらに, これまで用いていたモデルタンパク質だけでなく, 本来ERに存在するFrt1でもミトコンドリアに誤配送されると, Msp1によるミトコンドリアからERへの再配送が起こることを見出した。細胞内リン脂質輸送を解析する新しい実験系の構築を行い, 脂肪滴やペルオキシソームからミトコンドリアへのリン脂質輸送経路があることを見出した。またSplit-GFPを用いたオルガネラ間コンタクトサイトの可視化技術を改良し, オルガネラ間コンタクトサイトの動態を定量的に解析できる実験系の構築を行った。この実験系を駆使することで, 様々な細胞ストレスによって複数のオルガネラコンタクトサイトが動的に変化することを見出した。さらにミトコンドリア内で合成される2量体リン脂質, カルジオリピン合成の初期ステップに関与する酵素Tam41の立体構造を解明し, Tam41が脂質二重膜に部分的に埋まり, ホスファチジン酸をCDP-ジアシルグリセロールに変換する分子機構を明らかにした。
英文摘要
本研究では, サイトゾルからミトコンドリアへのタンパク質の輸送, および膜間の脂質の輸送を中心に, ミトコンドリアが細胞内でいかに作られるかという根源的問題の分子機構を統合的に理解することをめざしてきた。タンパク質の交通については, ミトコンドリア外膜で小分子やタンパク質の通り道を提供するバレル型構造の膜タンパク質(βバレル型膜タンパク質)の構造形成と外膜への挿入を担う, 必須トランスロケータ, SAM複合体の構造情報取得をめざした。そして、SAM複合体の、構成サブユニット(タンパク質)が異なる二つの複合体について、高分解能立体構造を決定することに成功した(Natureに発表)。得られた構造に基づき, SAM複合体がプレイスホルダーとしての構成タンパク質(Sam50とMdm10)および基質のβバレルタンパク質を入れ替えながら、基質のバレル構造形成を促し、外膜に組み込む新規の仕組み(βバレルスイッチモデル)を明らかにすることができた。細菌の外膜にも進化的に近い組み込み装置(BAM複合体)があるが、それとは組込みの仕組みがかなり異なることもわかった。βバレル型膜タンパク質の構造形成と膜への組込みという、膜タンパク質生合成に関する基本原理の理解を大きく進める、インパクトのある結果となった。ミトコンドリア外膜でタンパク質の品質管理に関わるAAAタンパク質のMsp1について, Msp1はミトコンドリアに誤配送されたテイルアンカー(TA)膜タンパク質を外膜から引き抜いてERに送り, ERで分解するか, 配送のやり直しをするかが決まることを見出していた。今回さらに, これまで用いていたモデルタンパク質だけでなく, 本来ERに存在するFrt1でもミトコンドリアに誤配送されると, Msp1によるミトコンドリアからERへの再配送が起こることを見出した。細胞内リン脂質輸送を解析する新しい実験系の構築を行い, 脂肪滴やペルオキシソームからミトコンドリアへのリン脂質輸送経路があることを見出した。またSplit-GFPを用いたオルガネラ間コンタクトサイトの可視化技術を改良し, オルガネラ間コンタクトサイトの動態を定量的に解析できる実験系の構築を行った。この実験系を駆使することで, 様々な細胞ストレスによって複数のオルガネラコンタクトサイトが動的に変化することを見出した。さらにミトコンドリア内で合成される2量体リン脂質, カルジオリピン合成の初期ステップに関与する酵素Tam41の立体構造を解明し, Tam41が脂質二重膜に部分的に埋まり, ホスファチジン酸をCDP-ジアシルグリセロールに変換する分子機構を明らかにした。
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DOI:
10.1083/jcb.201712029
发表时间:
2018-09-03
期刊:
The Journal of cell biology
影响因子:
--
作者:
[Jores T, Lawatscheck J, Beke V, Franz-Wachtel M, Yunoki K, Fitzgerald JC, Macek B, Endo T, Kalbacher H, Buchner J, Rapaport D]
通讯作者:
Rapaport D
DOI:
10.1038/s42003-020-0832-5
发表时间:
2020-03
期刊:
Communications Biology
影响因子:
5.9
作者:
[Seiko Nakamura;Aiko Matsui;Shiori Akabane;Y. Tamura;Azumi Hatano;Yuriko Miyano;H. Omote;M. Kajikawa;K. Maenaka;Y. Moriyama;T. Endo;T. Oka]
通讯作者:
Seiko Nakamura;Aiko Matsui;Shiori Akabane;Y. Tamura;Azumi Hatano;Yuriko Miyano;H. Omote;M. Kajikawa;K. Maenaka;Y. Moriyama;T. Endo;T. Oka
Nonvesicular Phospholipid transort via mitochondria
通过线粒体的非囊泡磷脂转运
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[古田詩唯奈, 小島理恵子, 田村康, 遠藤斗志也, Ueda M, Yasushi Tamura]
通讯作者:
Yasushi Tamura
DOI:
10.1002/1873-3468.12948
发表时间:
2018-01-01
期刊:
FEBS LETTERS
影响因子:
3.5
作者:
[Matsumura, Ayaka, Higuchi, Jun, Oka, Toshihiko]
通讯作者:
Oka, Toshihiko
ミトコンドリア外膜トランスロケータTOM複合体の構造・機能研究
线粒体外膜易位蛋白TOM复合物的结构和功能研究
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[荒磯裕平, 包明久, 松本俊介, 柚木芳, 吉川雅英, 遠藤斗志也]
通讯作者:
遠藤斗志也
共 208 条
Effects of orthognathic surgery on facial blood flow analysis using the NIRS
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批准号:15K11374
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2015
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Elucidation of the molecular mechanims of Parkin-PINK1 triggered mitophagy by using budding yeast
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批准号:24657072
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2012
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Elucidation of the mechanism of the control of protein trafficking at mitochondrial membranes
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批准号:22227003
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$134.78万
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财政年份:2010
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Control and alteration of mitochondrial protein traffic
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批准号:18107003
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$71.55万
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财政年份:2006
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Molecular mechanisms of the control of yeast mitochondrial protein fluxes.
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批准号:15207009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$32.2万
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财政年份:2003
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Structures and functions of protein translocator systems
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批准号:14037225
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$95.1万
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财政年份:2002
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Molecular mechanisms of the control and regulation of the mitochondrial protein flux.
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批准号:13480207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$9.47万
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财政年份:2001
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Analyses of mechanisms of protein import into mitochondria by using unnatural amino acids.
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批准号:10480156
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$8.7万
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财政年份:1998
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Analyses of molecular mechanisms of mitochondrial protein transport by using unnatural amino acids
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批准号:09044070
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项目类别:Grant-in-Aid for international Scientific Research
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资助金额:$3.52万
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财政年份:1997
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Molecular anatomy of protein translocation machineries in yeast mitochondria
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批准号:08458180
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$4.8万
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财政年份:1996
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
High-level expression of recombinant proteins by controling the formation of the inclusion body
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批准号:07558222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$2.5万
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财政年份:1995
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Transmembrane Traffic of Proteins with Unnatural Amino Acids
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批准号:06044091
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项目类别:Grant-in-Aid for international Scientific Research
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资助金额:$4.35万
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财政年份:1994
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Development of a cell-free translation system capable of producing functional proteins in high yield.
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批准号:05558085
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research (B)
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资助金额:$4.48万
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财政年份:1993
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位:
Roles of molecular chaperones in protein import into mitochondria.
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批准号:05454621
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:1993
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负责人:ENDO Toshiya
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依托单位: