核内構造体を構築する長鎖Noncoding RNAの探索法の開発
核内構造体を構築する長鎖Noncoding RNAの探索法の開発
批准号:
15J01473
负责人:
中條 岳志
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2018-03-31
中文摘要
点击翻译按钮获取中文摘要
英文摘要
昨年度までの研究から、核内構造体を構築するアーキテクチュラルRNAの候補の探索には難溶性RNAの同定が有効であることを明らかにした。この成果は2017年5月15日にEMBO Journalに掲載された。その後、論文で報告した新しい難溶性RNAが構成する構造体について、その構造体形成に関与するタンパク質を探した。その結果、パラスペックルの形成に必要なある複合体が着目している新規長鎖noncoding RNAの構造体形成にも必要であることを見出した。この結果より、この複合体が様々なアーキテクチュラルRNAによる構造体形成に共通して関与することが支持された。また、難溶性の長鎖noncoding RNAが作る複数の新規構造体は、タンパク質間の疎水性相互作用を阻害する処理により、細かく分離した。この結果より、これら難溶性RNAが作る新規核内構造体は、タンパク質間の疎水性相互作用に依存して複数のRNA-タンパク複合体が集まって作られていると考えられる。様々な真核生物種における既知の6種類のアーキテクチュラルRNAは、いずれも細胞がストレスにさらされた時や特定の発生段階で発現して機能を発揮することが明らかにされている(Chujo et al., Molecules and Cells (2017))。また、ヒトには2万種類以上の機能未知ncRNAが存在する。これらの知見から、ストレスに応答して発現する新たなアーキテクチュラルRNAが存在することが期待される。そこで、ストレス下等に発現する新たなアーキテクチュラルRNAを同定するために、様々なストレスを与えた細胞や疾患モデル細胞における難溶性RNAを同定しようと考えた。このために必要な多サンプルの次世代シーケンス解析を実現するために、本研究の成果を基にして所属研究室が新学術領域先進ゲノム支援に申請して採用され、26種類のRNAサンプルの次世代シーケンス解析を依頼し、その結果を待っている状況である。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
DOI:
10.14348/molcells.2017.0263
发表时间:
2017-12-31
期刊:
Molecules and cells
影响因子:
3.8
作者:
[Chujo T, Hirose T]
通讯作者:
Hirose T
核内構造体形成のアーキテクチュラルlncRNAの共通特性としての難溶性
溶解度差是构建核结构的 lncRNA 的一个共同特征
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中條岳志, 山崎智弘, 川口哲哉, 黒坂哲, 内匠透, 中川真一, 廣瀬哲郎]
通讯作者:
廣瀬哲郎
Characterization of semi-extractable feature of NEAT1 architectural long noncoding RNA in mammalian cells
哺乳动物细胞中 NEAT1 结构长非编码 RNA 半可提取特征的表征
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takeshi Chujo, Tomohiro Yamazaki, Shinichi Nakagawa, Tetsuya Kawaguchi, Toru Takumi, Tetsuro Hirose]
通讯作者:
Tetsuro Hirose
Remarkable semi-extractability as a hallmark of architectural long noncoding RNAs associated with nuclear bodies
显着的半可提取性是与核体相关的结构性长非编码 RNA 的标志
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tomohiro Yamazaki, Tetsuya Kawaguchi, Satoshi Kurosaka, Toru Takumi, Shinichi Nakagawa, Tetsuro Hirose]
通讯作者:
Tetsuro Hirose
核内構造体アーキテクチュラルRNAの探索手法の開発:難溶性RNA-seqとFABS法
核结构RNA搜索方法的开发:难溶性RNA-seq和FABS方法
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中條岳志, 田中くみ子, 山崎智弘, 萬年太郎, 川口哲哉, 黒坂哲, 内匠透, 中川真一, 廣瀬哲郎]
通讯作者:
廣瀬哲郎
共 17 条
トランスファーRNA修飾の破綻による小頭症と精神遅滞の発症機構の解明
-
批准号:20H03187
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
-
资助金额:$11.23万
-
财政年份:2020
-
负责人:中條 岳志
-
依托单位:
海外基金