計算機進化によって器官の成長制御機構を明らかにする
計算機進化によって器官の成長制御機構を明らかにする
批准号:
15J04931
负责人:
廣中 謙一
金额:
$3.33万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2018-03-31
中文摘要
1.ショウジョウバエ属9種における臨界サイズのスケーリング則前年度に引き続き、臨界サイズが異なる器官間への成長エネルギーの配分を切り替えるためのスイッチであるという仮説を検証するため、サイズが3倍以上異なるショウジョウバエ属の近縁9種を使い、各種の成長曲線と臨界サイズを定量的に記述した。我々のデータは、臨界サイズのスケーリング関係がショウジョウバエ属の間で明白に成り立っていることを示し、またスケーリングの比例係数は理論的に見積もられた最適値に近いことも確認された。これらの結果はエネルギー配分スイッチ仮説を強く支持する。さらに我々は、臨界サイズの進化的スケーリングのメカニズムとして成長率と成長期間の逆相関が必要であることを理論的に予測し、実際に成長期間がホルモン・ダイナミクスのスケーリングによって制御されていることを実験的に示した。2.ショウジョウバエの糖代謝応答モデル我々はショウジョウバエの個体発生において、グリコーゲンやトレハロースといった貯蔵糖の飢餓応答が臨界サイズ前後で異なることを実験的に発見した。この現象の適応的意義を調べるため、我々は変動環境における個体発生を記述する数理モデルを構築し、確率動的計画法によって最も優れた飢餓応答のパターンを探索した。興味深いことに、広いパラメータの範囲で、最終時刻の直前では飢餓状態に置かれても糖を消費しないことが最適な戦略となることがわかった。これは我々がショウジョウバエ幼虫で観察した飢餓応答のパターンと一致している。さらに、モデル上のパラメータ同士の関係において「蛹期における貯蔵糖の要求性」が「糖の消費による延命効率」を上回るとき、このような応答が必ず最適になることを我々は数学的に証明した。
英文摘要
1.ショウジョウバエ属9種における臨界サイズのスケーリング則前年度に引き続き、臨界サイズが異なる器官間への成長エネルギーの配分を切り替えるためのスイッチであるという仮説を検証するため、サイズが3倍以上異なるショウジョウバエ属の近縁9種を使い、各種の成長曲線と臨界サイズを定量的に記述した。我々のデータは、臨界サイズのスケーリング関係がショウジョウバエ属の間で明白に成り立っていることを示し、またスケーリングの比例係数は理論的に見積もられた最適値に近いことも確認された。これらの結果はエネルギー配分スイッチ仮説を強く支持する。さらに我々は、臨界サイズの進化的スケーリングのメカニズムとして成長率と成長期間の逆相関が必要であることを理論的に予測し、実際に成長期間がホルモン・ダイナミクスのスケーリングによって制御されていることを実験的に示した。2.ショウジョウバエの糖代謝応答モデル我々はショウジョウバエの個体発生において、グリコーゲンやトレハロースといった貯蔵糖の飢餓応答が臨界サイズ前後で異なることを実験的に発見した。この現象の適応的意義を調べるため、我々は変動環境における個体発生を記述する数理モデルを構築し、確率動的計画法によって最も優れた飢餓応答のパターンを探索した。興味深いことに、広いパラメータの範囲で、最終時刻の直前では飢餓状態に置かれても糖を消費しないことが最適な戦略となることがわかった。これは我々がショウジョウバエ幼虫で観察した飢餓応答のパターンと一致している。さらに、モデル上のパラメータ同士の関係において「蛹期における貯蔵糖の要求性」が「糖の消費による延命効率」を上回るとき、このような応答が必ず最適になることを我々は数学的に証明した。
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Theoretical approaches to organ development── Drosophila wing disc as a model system
器官发育的理论途径──果蝇翼盘作为模型系统
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ken-ichi Hironaka, Takashi Nishimura, Koichi Fujimoto]
通讯作者:
Koichi Fujimoto
Reconstructing 3D deformation dynamics for curved epithelial sheet morphogenesis from positional data of sparsely-labelled cells
根据稀疏标记细胞的位置数据重建弯曲上皮片形态发生的 3D 变形动力学
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yoshihiro Morishita]
通讯作者:
Yoshihiro Morishita
Adaptive significance of critical weight for metamorphosis in holometabolous insect
临界体重对全变态昆虫变态的适应性意义
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ken-ichi Hironaka, Takashi Nishimura and Koichi Fujimoto, 森亜紀子, 森亜紀子, 廣中謙一]
通讯作者:
廣中謙一
完全変態昆虫の最適成長スケジュール
完全变态昆虫的最佳生长时间表
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ken-ichi Hironaka, Takashi Nishimura and Koichi Fujimoto, 森亜紀子, 廣中謙一, 森亜紀子, 廣中謙一, 森亜紀子, 廣中謙一]
通讯作者:
廣中謙一
Optimal growth schedule of holometabolous insects
全变态昆虫的最佳生长时间表
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Higashi, H., Sakaguchi, S., Ikeda, H., Isagi, Y., Setoguchi, H., Ken-ichi Hironaka]
通讯作者:
Ken-ichi Hironaka
共 7 条
器官形成過程における空間パターニングのプロポーション制御メカニズム
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批准号:13J00442
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.62万
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财政年份:2013
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负责人:廣中 謙一
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依托单位:
海外基金