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ヒストン翻訳後修飾特異的一本鎖抗体(scFv)の構築とクロマチン修飾動態の解明

ヒストン翻訳後修飾特異的一本鎖抗体(scFv)の構築とクロマチン修飾動態の解明
组蛋白翻译后修饰特异性单链抗体(scFv)的构建和染色质修饰动力学的阐明
批准号:
15J06807
负责人:
鯨井 智也
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2018-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究では、遺伝子の発現制御機構の解明のため、細胞核内におけるヒストン修飾の動態を明らかにするためのプローブの開発研究を行う。これまでに、経時的に変化するヒストン修飾動態をライブイメージングするために、細胞内においてヒストン修飾特異的一本鎖抗体(scFv)を発現させる修飾特異的細胞内抗体プローブ(mintbody)の開発研究が進行している。しかし、細胞内においてscFvを発現させた場合に、多くのscFvが抗原に結合せず機能しないことが明らかになっている。そこで本研究では、生化学的、構造生物学的解析によりscFvが細胞内において機能するために必要な性質を明らかにすることで、さらなるmintbodyをデザインすることを目標としている。これまでに、ヒストンH4の20番目のモノメチル化(H4K20me1)特異的scFvである15F11-scFvをモデルに、細胞におけるscFvの機能とscFvの構造的特徴の相関について解析を行ってきた。その結果、scFvのフレーム形成領域の疎水性の相互作用が重要であり、scFvの構造安定性もしくはフォールディングが重要であることが示唆されていた。そこで、さらなるmintbodyの作製のため、様々なscFvについて構造モデリングソフトェアを用いて立体構造モデルを構築し、変異体を予測した。いくつかのscFvについて構造予測を行った結果、mintbodyとして機能するscFvを取得することに成功した。今後、本知見が様々なmintbody作製のための一助となることが期待され、翻訳後修飾全般に関する研究の発展に貢献できると考えられる。
英文摘要
本研究では、遺伝子の発現制御機構の解明のため、細胞核内におけるヒストン修飾の動態を明らかにするためのプローブの開発研究を行う。これまでに、経時的に変化するヒストン修飾動態をライブイメージングするために、細胞内においてヒストン修飾特異的一本鎖抗体(scFv)を発現させる修飾特異的細胞内抗体プローブ(mintbody)の開発研究が進行している。しかし、細胞内においてscFvを発現させた場合に、多くのscFvが抗原に結合せず機能しないことが明らかになっている。そこで本研究では、生化学的、構造生物学的解析によりscFvが細胞内において機能するために必要な性質を明らかにすることで、さらなるmintbodyをデザインすることを目標としている。これまでに、ヒストンH4の20番目のモノメチル化(H4K20me1)特異的scFvである15F11-scFvをモデルに、細胞におけるscFvの機能とscFvの構造的特徴の相関について解析を行ってきた。その結果、scFvのフレーム形成領域の疎水性の相互作用が重要であり、scFvの構造安定性もしくはフォールディングが重要であることが示唆されていた。そこで、さらなるmintbodyの作製のため、様々なscFvについて構造モデリングソフトェアを用いて立体構造モデルを構築し、変異体を予測した。いくつかのscFvについて構造予測を行った結果、mintbodyとして機能するscFvを取得することに成功した。今後、本知見が様々なmintbody作製のための一助となることが期待され、翻訳後修飾全般に関する研究の発展に貢献できると考えられる。
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会议论文
クロマチン結合タンパク質DEKの機能解析
染色质结合蛋白DEK的功能分析
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [鯨井智也, 粉間信樹, 木村宏, 増本博司, 胡桃坂仁志]
通讯作者: 胡桃坂仁志
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [Tomoya Kujirai, Yuka Fujino, Akihisa Osakabe, Frederic Berger, Hitoshi Kurumizaka]
通讯作者: Hitoshi Kurumizaka
ヒストンH3.Yが形成するクロマチン及びヌクレオソームの機能解析
组蛋白 H3.Y 形成的染色质和核小体的功能分析
DOI: --
发表时间: 2015
期刊:
影响因子: --
作者: [鯨井智也, 堀越直樹, 佐藤浩一, 前原一満, 越阪部晃永, 町田晋一, 大川恭行, 木村宏, 胡桃坂仁志]
通讯作者: 胡桃坂仁志
ヒストン修飾特異的細胞内発現抗体の機能解析
组蛋白修饰特异性胞内抗体的功能分析
DOI: --
发表时间: 2016
期刊:
影响因子: --
作者: [鯨井智也, 佐藤優子, 堀越直樹, 木村宏, 胡桃坂仁志]
通讯作者: 胡桃坂仁志
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    細胞内のクロマチンにおける多様な転写機構の構造基盤
    • 批准号:
      23K17392
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
    • 资助金额:
      $16.64万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      鯨井 智也
    • 依托单位:
    クロマチン構造における自然免疫制御機構の解明
    • 批准号:
      22K15033
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额:
      $3.0万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      鯨井 智也
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    基于轻量化蛋白质语言模型的CAR T细胞scFv智能化设计方法研究
    • 批准号:
      JCZRMS202601195
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2026
    • 负责人:
    • 依托单位:
    基因工程改造的多能CD19-CART细胞通过外泌抗 CD47 scFv 增强抗肿瘤免疫的功能验证与机制探索
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      15.0万元
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      李玉华
    • 依托单位:
    抗CD24scFv表面修饰的类外泌体药物载体靶向神经母细胞瘤并增强巨噬细胞免疫监视功能的作用及机制研究
    自分泌NGF scFv的CAR-T细胞通过肿瘤局部去交感神经增强抗实体瘤活性的研究
    • 批准号:
      82302071
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      30万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      杨培伟
    • 依托单位: