权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

細菌のリグニン系芳香族代謝から見出した新規転写制御メカニズムの解明

阐明从细菌木质素芳香代谢中发现的新型转录控制机制

基本信息

批准号：
16J11003
负责人：
荒木拓馬
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Nagaoka University of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-04-22 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

平成30年度は、Sphingobium sp. SYK-6株のバニリン酸 (VA)およびシリンガ酸 (SA)代謝酵素遺伝子であるligMとdesBの転写制御因子DesRに対し、SAがエフェクター分子として機能することを明らかにした。ligMとdesBの誘導物質であるVAとSAのうち、VAはDesRのエフェクター分子として機能するが、SAの効果は不明であった。そこで、SAのエフェクター分子としての効果を検証するため、精製DesRを用いたゲルシフト解析を行った。終濃度0.05, 0.5, 5.0, 50 mMのSA存在下で、精製DesR (24 nM)とligMまたはdesBプロモーター領域を含むDNAプローブ (500 pM)を反応させた結果、50 mM SAの存在下においてDNA-DesR複合体を示すシフトバンドが完全に消失した。比較対照としてVAでも同様の実験を行ったところ、VAでは5 mM VA存在下においてDNA-DesR複合体を示すシフトバンドが完全に消失した。SYK-6株において、ligMおよびdesBの転写がVAまたはSAの存在下で同等に誘導されることを鑑みると、DesRと相互作用する他のタンパク質 (メディエーター)が存在し、メディエーターがSAを認識することでDesRによる転写抑制の解除に働く可能性も考えられた。そこで、精製タンパク質を用いた場合と比べ、細胞内状態をより正確に反映すると考えられるSYK-6株の細胞抽出液を用いてゲルシフト解析を行った。その結果、精製DesRを用いた場合と同等の結果が得られた。したがって、SAを認識しDesRによる転写抑制の解除に働くメディエーターは存在しないことが強く示唆された。以上の結果から、VAに加えSAもDesRのエフェクター分子として機能するが、両化合物のDesRに対する親和性には明確な差があると考えられた。

In 2006, Sphingobium sp. SYK-6 strain was isolated from the plant and its functional components were identified. LigM and desB induce substances, VA and SA, VA and DesR induce molecules, SA and SA induce substances, VA and DesR induce molecules, SA and SA induce substances, VA and SA induce molecules, VA and SA induce substances, VA and SA induce substances, VA induce molecules, SA induce substances, VA induce molecules, SA induce molecules, SA induce substances, VA induce molecules, SA induce molecules, VA induce molecules, SA induce molecules, SA induce substances, VA induce molecules, SA induce substances, SA induce substances, VA induce molecules, SA induce substances, SA induce substances, VA induce molecules, SA induce substances, SA induce substances, VA induce molecules, SA induce substances, VA induce molecules, SA induce substances, SA, SA induce substances, VA induce molecules, SA, SA induce substances, SA, SA, SA induce substances, SA, SA induce substances, SA, SA, For example, if you want to use a product, you can use it to analyze it. In the presence of SA at final concentrations of 0.05, 0.5, 5.0, and 50 mM, the purified DesR (24 nM) and ligM were found to be in the presence of a DNA precursor (500 pM). In the presence of SA at 50 mM, the DNA-DesR complex was shown to be completely absent. Compared with VA, the DNA-DesR complex disappeared completely in the presence of VA. SYK-6 strain is characterized by the presence of SA, lig M and desB, and the presence of SA, lig M and desB, and the presence of SA, lig M and desB. The cell extract of SYK-6 strain was analyzed in detail. The result of refining is equal to the result of refining. To understand the meaning of the word, to understand the meaning of the word, to understand the meaning of the word. The above results show that the affinity of the compound to DesR is clearly different from that of SA and DesR.