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Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ　Ｅｔｈｏｌｏｇｙで解き明かす動物の群れ形成メカニズム

通过计算伦理学揭示动物群体形成机制

基本信息

批准号：
16J00129
负责人：
福永津嵩
金额：
$ 2.08万
依托单位：
The University of Tokyo (2017)Waseda University (2016)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2016
资助国家：
日本
起止时间：
2016-04-22 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は、昨年度開発した画像認識技術を用いた動物トラッキング技術を利用して、実際に複数の系統のメダカのトラッキングデータ解析を行った。トラッキングソフトウェアの性能そのものは下流のデータ解析に十分使用できるほど優れていたものの、得られたトラッキングデータをどのようにQTL解析に利用できる形の量として表現するかという点に苦心している。これは、速度や進行角度の比較といった類似性を比較することは容易であるが、人間が見たらわかる行動パターンの違いを単一の量として表現することが困難なためである。現在のところ、地理学の分野などで利用されている空間統計学の手法を適用出来るかどうか、また機械学習手法における分類指標を用いることが出来るかについて検討を進めている最中である。また、昨年度開発を行ったlncRNAとmRNAの相互作用を高速かつ網羅的に予測するソフトウェアであるRIblastについては、その後も研究を進め、ヒト・マウスのlncRNA-mRNAの網羅的な相互作用予測データベースであるLncRRIdb(under submission)や、検出されたRNA-RNA相互作用の統計的有意性の検出手法(in revision)について開発を行った。今後は、ヒト・マウス間で保存されているlncRNA-mRNA相互作用の網羅的検出や、pre-mRNAとlncRNAの相互作用予測を可能にする更に高速なアルゴリズムの開発を進めることで、行動の基盤となる分子機構の一つであるlncRNAの機能を明らかにしていきたいと考えている。

This year and last year we developed image recognition technology and animal image recognition technology. Analyze the を行った using the して, 実记に plural system のメダカのトラッキングデータ.トラッキングソフトウェアのPERFORMANCE そのものは indecent のデータANALYZE is very usefulたトラッキングデータをどのようにQTL analysis and utilization The shape of the shape and the amount of the expression are the points and the painstaking efforts.これは、Speed やComparison of angle といったsimilarity をComparison することはeasy であるが、人间がSee たらわかるactionパターンのviolationいを単一のquantityとしてperformanceすることがdifficultyなためである. Nowadays, the division of geography has been applied using spatial statistics techniques.たMechanical learning techniqueにおけるClassification indexをUseいることが come outるかについて検问を入めているmost中である.また、Last year's opening of the 発を行ったlncRNA and とmRNAのInteraction をHigh-speed かつNET に Prediction するソフトウェアであるRIblast については, その后も研究を进め、ヒト・マウスのlncRNA-mRNAのNANA's interaction prediction データベースであるLncRRIdb(under Submission)や、検出されたThe statistical significance of RNA-RNA interactionの検出technique (in revision)について开発を行った. It is possible to save the lncRNA-mRNA interaction network and predict the lncRNA interaction between pre-mRNA and lncRNA in the future. The high-speed なアルゴリズムの开発を进めることで, the action base となるmolecule The function of the lncRNA is as follows: