ニホンドロソコエビの遺伝子発現解析を用いた汽水域底質の汚染源推定
利用日本虾的基因表达分析估算苦咸水沉积物的污染源
基本信息
- 批准号:16J04681
- 负责人:
- 金额:$ 0.83万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2016
- 资助国家:日本
- 起止时间:2016-04-22 至 2018-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
昨年度の研究によって、cDNA-AFLP法によって非モデル生物における新規の曝露マーカー遺伝子を探索でき、多様な化学物質を含む環境試料へも適用可能であることが示された。今年度は、これら遺伝子発現解析の結果が、Sediment TIE(Toxicity Identification Evaluation)などの物理化学的な処理を主とした従来の毒性原因物質特定手法と整合するかどうか検証した。cDNA-AFLP解析時に使用した物と同一の道路塵埃試料を用いて、Sediment TIEを実施した。結果、陽イオン交換樹脂SIR-300を添加した系よりも炭素系吸着剤XAD-4を添加した系で有意に10日間致死率および成長阻害が低減され、有機系物質による毒性寄与が示唆された。さらにSediment TIEにおける曝露試験中の溶存態濃度の分析結果から、亜鉛、銅と遊離アンモニアよりもニコチンの道路塵埃毒性への寄与が大きいことが明らかになった。これらの結果は、道路塵埃曝露時の発現パターンはニコチン曝露時の発現パターンと最も類似していたというcDNA-AFLP解析の結果と整合しており、cDNA-AFLPによって探索されたマーカー遺伝子の頑健性を示している。ただしニコチンのみを曝露した追加実験を実施したところ、道路塵埃曝露系で検出された溶存態ニコチン濃度では有意な致死影響は見られなかった。したがって、溶存態ニコチン以外の他の未測定物質や測定物質間の複合影響が道路塵埃の急性毒性に寄与していると示唆された。さらに次世代シーケンサーを用いて、ニホンドロソコエビのストレス応答関連遺伝子の塩基配列を取得した。金属曝露に関連するメタロチオネインや異物代謝に関わるシトクロムP450などの遺伝子の塩基配列を、相同性検索に基づき決定した。これらのデータは、今後本種を用いた生態毒性研究をおこなう上で有用な基礎知見である。
Last year's research conducted by cDNA-AFLP revealed the possibility of applying new methods to biological and environmental samples containing various chemicals. This year, the results of the analysis of the occurrence of toxic substances, Sediment TIE (Toxicity Identification Evaluation), the main treatment of toxic substances, and the integration of toxic substances. cDNA-AFLP analysis was performed using the same road dust sample as Sediment TIE. The results showed that the addition of SIR-300 to the cation exchange resin and the addition of XAD-4 to the cation exchange resin intentionally reduced the daytime lethality and growth inhibition, and the toxicity of organic substances was also reduced. Analysis results of dissolved state concentration in Sediment TIE exposure test show that lead, copper, and free substances are toxic to road dust. The results of the analysis were similar to those of the results of cDNA-AFLP analysis. The road dust exposure system was developed in the form of a dissolved substance. Other undetermined substances other than those in the dissolved state and the combined effects of determined substances are indicated in the acute toxicity of road dust. In the next generation, the system is used to optimize the system, and the system is used to optimize the system Metal exposure is associated with the formation of a matrix of P450 molecules and the determination of their identity. This species will be used in ecotoxicity studies in the future.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Transcriptional profiling of a native estuarine amphipod exposed to road dust and the related chemicals by cDNA-AFLP
通过 cDNA-AFLP 对暴露于道路灰尘和相关化学物质的本地河口端足类动物进行转录分析
- DOI:
- 发表时间:2016
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kyoshiro Hiki;Fumiyuki Nakajima;Tomohiro Tobino
- 通讯作者:Tomohiro Tobino
Causes of highway road dust toxicity to an estuarine amphipod: Evaluating the effects of nicotine
- DOI:10.1016/j.chemosphere.2016.11.122
- 发表时间:2017-02-01
- 期刊:
- 影响因子:8.8
- 作者:Hiki, Kyoshiro;Nakajima, Fumiyuki;Tobino, Tomohiro
- 通讯作者:Tobino, Tomohiro
Duration of life-cycle toxicity tests with the ostracod Heterocypris incongruens
介形类异鲤生命周期毒性试验的持续时间
- DOI:10.1002/etc.3931
- 发表时间:2017
- 期刊:
- 影响因子:4.1
- 作者:Hiki Kyoshiro;Tobino Tomohiro;Nakajima Fumiyuki;Tsukahara Kenta
- 通讯作者:Tsukahara Kenta
Exploration of biomarkers in a benthic amphipod for toxic chemicals in road dust using cDNA-AFLP
使用 cDNA-AFLP 探索底栖片脚类动物中道路灰尘中有毒化学物质的生物标志物
- DOI:
- 发表时间:2017
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hiki Kyoshiro;Nakajima Fumiyuki;Tobino Tomohiro
- 通讯作者:Tobino Tomohiro
亜鉛曝露下のニホンドロソコエビにおけるde novoトランスクリプトーム解析
接触锌的日本虾的从头转录组分析
- DOI:
- 发表时间:2017
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:日置恭史郎;中嶋信美;渡部春奈;中島典之;飛野智宏
- 通讯作者:飛野智宏
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- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
日置 恭史郎;春奈 渡部;岳彦 林;雄一 岩崎;裕史 山本 - 通讯作者:
裕史 山本
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$ 0.83万 - 项目类别:
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- 资助金额:16.0 万元
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