Developing a computational method for microbial contaminant detection and functional inference using next-generation sequencing data

使用下一代测序数据开发微生物污染物检测和功能推理的计算方法

基本信息

  • 批准号:
    17K00396
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.91万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2017
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2017-04-01 至 2020-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

项目成果

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Development of a Pipeline for Contamination Profiling of Cells with Next Generation Sequencing Data
开发利用下一代测序数据进行细胞污染分析的流程
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鬼塚 理;朴 聖俊;貝淵 信之;妻沼 有香;安藤 智博;中井 謙太;岩田 隆紀;Sung-Joon Park and Kenta Nakai;Sung-Joon Park and Kenta Nakai;Sung-Joon Park;Sung-Joon Park
  • 通讯作者:
    Sung-Joon Park
Profiling of Cell Microbial Contamination by NGS data
通过 NGS 数据分析细胞微生物污染
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鬼塚 理;朴 聖俊;貝淵 信之;妻沼 有香;安藤 智博;中井 謙太;岩田 隆紀;Sung-Joon Park and Kenta Nakai;Sung-Joon Park and Kenta Nakai;Sung-Joon Park
  • 通讯作者:
    Sung-Joon Park
Applying Joint Non-Negative Matrix Factorization to Functional Analysis of Microbial Infection
将联合非负矩阵分解应用于微生物感染的函数分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鬼塚 理;朴 聖俊;貝淵 信之;妻沼 有香;安藤 智博;中井 謙太;岩田 隆紀;Sung-Joon Park and Kenta Nakai;Sung-Joon Park and Kenta Nakai
  • 通讯作者:
    Sung-Joon Park and Kenta Nakai
Host-unmapped NGS reads shape the prevalence of microbial contamination
宿主未映射的 NGS 读数影响微生物污染的流行
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鬼塚 理;朴 聖俊;貝淵 信之;妻沼 有香;安藤 智博;中井 謙太;岩田 隆紀;Sung-Joon Park and Kenta Nakai
  • 通讯作者:
    Sung-Joon Park and Kenta Nakai
Genome-Wide Scanning of Gene Expression
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Lee Jong-Hun;Saito Yutaka;Park Sung-Joon;Nakai Kenta;丁大橋
  • 通讯作者:
    丁大橋
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    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Lee Jong-Hun;Saito Yutaka;Park Sung-Joon;Nakai Kenta;Vandenbon Alexis
  • 通讯作者:
    Vandenbon Alexis

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    2023
  • 资助金额:
    $ 2.91万
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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    2023
  • 资助金额:
    $ 2.91万
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    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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    2023
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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  • 批准号:
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    2023
  • 资助金额:
    $ 2.91万
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    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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  • 批准号:
    23K11014
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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