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Development of horizontal gene transfer detection system and elucidation of environmental adaptation and co-evolution process

Development of horizontal gene transfer detection system and elucidation of environmental adaptation and co-evolution process
水平基因转移检测系统的开发以及环境适应和共同进化过程的阐明
批准号：
17K00401
负责人：
Abe Takashi
金额：
$2.91万
依托单位：
Niigata University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2017
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2017-04-01 至 2021-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17K00401/
关键词：
一括学習型自己組織化マップ連続塩基組成水平伝播遺伝子環境適応共生細菌系統推定水平伝播候補遺伝子南極細菌BLSOMSC-BLSOM

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An AI strategy for detecting HGT relies on nucleotide compositional features.
检测 HGT 的人工智能策略依赖于核苷酸组成特征。
DOI： --
发表时间： 2019
期刊：
影响因子： --
作者： [Takashi Abe, Yu Akazawa, Tomoya Baba, Toshimichi Ikemura.]
通讯作者： Toshimichi Ikemura.
Batch-Learning Self-Organizing Map Identifies Horizontal Gene Transfer Candidates and Their Origins in Entire Genomes
DOI： 10.3389/fmicb.2020.01486
发表时间： 2020-07-03
期刊： FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
影响因子： 5.2
作者： [Abe, Takashi, Akazawa, Yu, Baba, Tomoya]
通讯作者： Baba, Tomoya
水平伝播遺伝子検出ワークフロー　PEMS4HGT
水平转移基因检测工作流程 PEMS4HGT
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
A strategy for predicting gene functions from genome and metagenome sequences on the basis of oligopeptide frequency distance
基于寡肽频率距离的基因组和宏基因组序列预测基因功能的策略
DOI： 10.1266/ggs.19-00041
发表时间： 2020
期刊： Genes & Genetic Systems
影响因子： 1.1
作者： [Abe Takashi, Ikarashi Ryo, Mizoguchi Masaya, Otake Masashi, Ikemura Toshimichi]
通讯作者： Ikemura Toshimichi
A comprehensive odor mapping of compartmentalized and valence-encoding MB intrinsic neurons in Drosophila
  • 批准号：
    19K16254
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 资助金额：
    $2.83万
  • 财政年份：
    2019
  • 负责人：
    Abe Takashi
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Comprehensive mapping of odor-evoked activity underlying presynaptic plasticity in compartmentalized axonal lobes of Drosophila mushroom body
  • 批准号：
    17K17681
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额：
    $2.75万
  • 财政年份：
    2017
  • 负责人：
    Abe Takashi
  • 依托单位：
    The University of Tokyo
Investigating the Mechanism of Fluctuations in Arousal Levels
  • 批准号：
    17K19639
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
  • 资助金额：
    $3.91万
  • 财政年份：
    2017
  • 负责人：
    Abe Takashi
  • 依托单位：
    University of Tsukuba
Development of a crystal oscillator based chemical calculator with a micro/nano fluidic circuit
  • 批准号：
    16K13649
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.33万
  • 财政年份：
    2016
  • 负责人：
    Abe Takashi
  • 依托单位：
    Niigata University