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Development of a novel bioinformatics method to analyze big genome sequence data for efficient knowledge discovery

Development of a novel bioinformatics method to analyze big genome sequence data for efficient knowledge discovery
开发一种新的生物信息学方法来分析大基因组序列数据以实现有效的知识发现
批准号：
26330327
负责人：
Abe Takashi
金额：
$3.08万
依托单位：
Niigata University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2014
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2014-04-01 至 2017-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26330327/
关键词：
一括学習型自己組織化マップ自己圧縮BLSOM連続塩基組成連続アミノ酸組成メタゲノム系統推定自己圧縮生物系統推定タンパク質機能推定比較ゲノム連続塩基連続アミノ酸

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Genomic features of uncultured methylotrophs in activated-sludge microbiomes grown under different enrichment procedures.
DOI： 10.1038/srep26650
发表时间： 2016-05-25
期刊： Scientific reports
影响因子： 4.6
作者： [Fujinawa K, Asai Y, Miyahara M, Kouzuma A, Abe T, Watanabe K]
通讯作者： Watanabe K
BLSOMを用いたメタゲノム配列に対する系統推定PEMSソフトウェア
使用 BLSOM 进行宏基因组序列的系统发育估计 PEMS 软件
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
研究室ホームページ
实验室主页
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Development of Self-Compress BLSOM for comprehending big sequence data.
开发用于理解大序列数据的自压缩 BLSOM。
DOI： --
发表时间： 2014
期刊：
影响因子： --
作者： [Akihito Kikuchi, Shigehiko Kanaya, Toshimichi Ikemura and Takashi Abe]
通讯作者： Toshimichi Ikemura and Takashi Abe
共 24 条
    A comprehensive odor mapping of compartmentalized and valence-encoding MB intrinsic neurons in Drosophila
    • 批准号：
      19K16254
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额：
      $2.83万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      Abe Takashi
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Development of horizontal gene transfer detection system and elucidation of environmental adaptation and co-evolution process
    • 批准号：
      17K00401
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.91万
    • 财政年份：
      2017
    • 负责人：
      Abe Takashi
    • 依托单位：
      Niigata University
    Comprehensive mapping of odor-evoked activity underlying presynaptic plasticity in compartmentalized axonal lobes of Drosophila mushroom body
    • 批准号：
      17K17681
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $2.75万
    • 财政年份：
      2017
    • 负责人：
      Abe Takashi
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    Investigating the Mechanism of Fluctuations in Arousal Levels
    • 批准号：
      17K19639
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额：
      $3.91万
    • 财政年份：
      2017
    • 负责人：
      Abe Takashi
    • 依托单位：
      University of Tsukuba