Exploring pool of horizontally transferred antibiotic resistance genes in reclaimed water

探索再生水中水平转移的抗生素抗性基因库

• 批准号: 17F17373
• 负责人: 春日 郁朗
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2017
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2017-11-10 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17F17373/
• 关键词: 抗生物質耐性遺伝子; 細胞外DNA; 下水再生水; 塩素消毒

下水再生水処理では、細胞内だけではなく、細胞外に存在するDNA画分中の抗生物質耐性遺伝子（ARGs: Antibiotic resistance genes）に注目する必要がある。本研究で確立した限外ろ過膜を活用した細胞外DNAの回収率にについて詳細な評価を行った。まず限外ろ過膜を用いてすべての画分のDNAを試料中から濃縮した。その後、細胞内DNA及び懸濁物に付着した細胞外DNA（Ads_exDNA）を、遠心分離によって溶存態の細胞外DNA（Dis_exDNA）から分離した。Ads_exDNAについては、プロテアーゼKによる処理を施すことで回収率が向上することが明らかになった。Dis_exDNA及びAds_exDNAはシリカを用いて精製し、細胞内DNAについては既成のキットを用いて抽出した。Dis_exDNAの回収率を評価するために、異なる長さのDis_exDNA（10, 4, 1.0, 0.5 kbp）をスパイクして実験を行ったところ、プロセス全体での回収率は10 kbp及び4 kbpのDis_exDNAについては60%程度であったのに対して、より短いDis_exDNAの回収率は40％程度であり、Dis_exDNAの回収率はDNA長に依存することが示された。下水処理水が流入する都市河川において、Dis_exDNA及びAds_exDNAに含まれるARGsの実態を評価した。Dis_exDNA及びAds_exDNAに含まれるARGsは、全体の0.03%-20.9%、1.8%-26.7%をそれぞれ占めており、ARGsの全存在量の中で無視できない画分であることが確認された。これらの知見について、国際学会での発表に加え、国際学術雑誌への論文掲載を達成した。

There are antimicrobial tolerance substrates (ARGs: Antibiotic resistance genes) in the reclaimed water (ARGs: Antibiotic resistance genes) in the reclaimed water. The purpose of this study was to determine the effective use of extracellular DNA (extracellular DNA). To limit the amount of material used in the DNA film, you need to use the information to separate the materials. The extracellular DNA (Ads_exDNA), extracellular DNA (Dis_exDNA) and extracellular DNA (Dis_exDNA) were separated from each other after incubation. Ads_exDNA, please tell me that the rate of return is higher than that of others. The Dis_exDNA and Ads_exDNA drugs were used to extract the cells from the cells, and the intracellular DNA particles were extracted from the cells. Dis_exDNA return rate (10, 4, 1. 0), long cycle (10, 4, 1.0) Kbp) the overall response rate is 10 kbp and the overall response rate is 10 kbps. the response rate is 60%, the response rate is 40%, the response rate is 40%, and the Dis_exDNA response rate is DNA long-term dependency window. The discharge water flows into the urban rivers, Dis_exDNA and Ads_exDNA, including the urban rivers, the ARGs, and the urban rivers. Dis_exDNA and "Ads_exDNA" include: 0.03%, 20.9%, and 1.8%, 26.7%, respectively. In the total presence of ARGs, no attention is paid to each other. I have been informed that I have received information, the International Society of International Studies has received an increase in the number of papers, and the articles in the journal of international science have become successful.

项目成果

Prevalence of intracellular and extracellular antibiotic resistance genes in an urban river receiving wastewater effluent

接收废水的城市河流中细胞内和细胞外抗生素抗性基因的流行率

• 发表时间: 2019
• 作者: Miaomiao Liu;Ikuro Kasuga;and Akihiko Hata
• 通讯作者: and Akihiko Hata