Comparative mitochondrial genomics of Bilateria

双侧对称动物线粒体基因组学比较

• 批准号: 5453188
• 负责人: Privatdozent Dr. Lars Podsiadlowski
• 金额: --
• 依托单位: Zentrum für Molekulare Biodiversitätsforschung (zmb)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Priority Programmes
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2011-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5453188?language=en
• 关键词: Comparative; mitochondrial; genomics; Bilateria

Mitochondrial genomes provide a powerful set of data for phylogenetic analyses among bilaterian animals. Besides pure sequence data a multitude of additional information is useful in phylogenetic contexts, e.g. gene rearrangements, duplication or loss of genes, secondary structures of tRNAs and rRNAs, as well as changes in the mitochondrial genetic code. In the preceding project we could close some important gaps of bilaterian taxa without complete mitogenomic data (e.g. Onychophora, Tardigrada, Sipuncula, Myzostomida, Nemertea). But there are still high-ranking taxa without sequence records of complete mitochondrial genomes, e.g. Pterobranchia, Acoelomorpha, Gnathostomulida, Nematomorpha. In other taxa a great variation of mitochondrial gene order is found, so more data is in need for a better understanding of the mode of genome rearrangements in these taxa. These include e.g. Ectoprocta, Entoprocta, Tunicata, non-parasitic Platyhelminthes. One main objective of the study is to provide a detailed scenario of mitochondrial genome evolution among Bilateria.

线粒体基因组为两侧对称动物的系统发育分析提供了一组强大的数据。除了纯序列数据之外，大量附加信息在系统发育背景中也很有用，例如基因重排、基因重复或丢失、tRNA 和 rRNA 二级结构以及线粒体遗传密码的变化。在前面的项目中，我们可以在没有完整的线粒体基因组数据的情况下弥补两侧对称动物类群的一些重要空白（例如甲藻，缓步动物，Sipuncula，Myzostomida，Nemertea）。但仍然有一些高级分类群没有完整线粒体基因组的序列记录，例如翼鳃亚纲、无腔亚纲、颌口纲、线形亚纲。在其他类群中，发现线粒体基因顺序存在很大差异，因此需要更多数据来更好地了解这些类群中基因组重排的模式。这些包括例如外直肠动物、内直肠动物、被囊动物、非寄生扁形动物。该研究的一个主要目标是提供双边对称动物线粒体基因组进化的详细情况。