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エフェクター遺伝子集合領域に着目した植物病原糸状菌の感染戦略の解明

以效应基因组装区域为重点阐明植物病原真菌感染策略

基本信息

批准号：
17J02983
负责人：
津島綾子
金额：
$ 1.22万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2017
资助国家：
日本
起止时间：
2017-04-26 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17J02983/
关键词：
植物病原糸状菌エフェクター Colletotrichum PacBio 植物免疫学比較ゲノム解析

项目摘要

エフェクターは植物細胞をかく乱することで、植物病源体の感染成立に寄与する、重要な分子である。申請者はシロイヌナズナに感染するColletotrichum higginsianumのゲノム解読をPacBio RSIIを用いて行い、感染を協調的に促進している可能性のあるエフェクター候補遺伝子の集合領域を見出した。本研究の目的は、これらの領域に座乗する病原性に寄与するエフェクターを見出し、その植物細胞内の標的因子の同定を含めた機能を解明することである。本年度も、エフェクター候補遺伝子の集合領域に座上する、エフェクター候補遺伝子CCE1に着目し研究を進めた。研究計画に従い、共免疫沈降法と質量分析を組み合わせた手法によって、CCE1の宿主細胞内因子の探索を行った。本実験は、「平成30年度若手研究者海外挑戦プログラム」の採用者として、Sophien Kamoun教授の研究グループ（英国セインズベリー研究所）に留学して実施した。Kamoun教授をはじめ研究室内のメンバーの指導を受け、申請者はCCE1の標的候補を得ることに成功した。現在は、共免疫沈降法および酵母ツーハイブリット法により、CCE1と標的候補タンパク質との結合を確認し、本エフェクターの作用機序解明を目指している。申請時の計画に加え、PacBio RSIIを用いて解読したゲノムアセンブリを用いて、C. higginsianum菌株間の比較ゲノム解析を行った。この解析結果をまとめた論文は、Genome Biology and Evolution誌に受理された（平成31年4月）。また、これまでに培ったゲノム解析技術を生かして、共同研究者と4種のColletotrichum属菌のゲノム解読を行い、Molecular Plant-Microbe Interactions誌に発表した。

Plant pathogens are responsible for infection and important molecules. The applicant shall be responsible for the infection of Colletotrichum higginsianum and the possibility of infection coordination in PacBio RSII. The purpose of this study is to identify the pathogenic factors and their functions in plant cells. This year, the research on CCE1 of candidate genes is progressing. The study was conducted to investigate the factors in CCE1 and host cells by means of immunoprecipitation assay and quality analysis. This year, Professor Sophien Kamoun, the adopter of the "Research Institute for International Research in Heisei 30", conducted the study abroad. Prof. Kamoun received guidance from the research team, and the applicant successfully received CCE1's candidate. Now, co-immunoprecipitation method and yeast When applying for a project, add it, PacBio RSII, and C. Comparisons between higginsianum strains must be analyzed. The results of this analysis were accepted in Genome Biology and Evolution Journal (April 2003). Co-investigators developed Molecular Plant-Microbe Interactions for four species of Colletotrichum.