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エフェクター遺伝子集合領域に着目した植物病原糸状菌の感染戦略の解明

エフェクター遺伝子集合領域に着目した植物病原糸状菌の感染戦略の解明
以效应基因组装区域为重点阐明植物病原真菌感染策略
批准号:
17J02983
负责人:
津島 綾子
金额:
$1.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-04-26 至 2019-03-31

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项目成果

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エフェクターは植物細胞をかく乱することで、植物病源体の感染成立に寄与する、重要な分子である。申請者はシロイヌナズナに感染するColletotrichum higginsianumのゲノム解読をPacBio RSIIを用いて行い、感染を協調的に促進している可能性のあるエフェクター候補遺伝子の集合領域を見出した。本研究の目的は、これらの領域に座乗する病原性に寄与するエフェクターを見出し、その植物細胞内の標的因子の同定を含めた機能を解明することである。本年度も、エフェクター候補遺伝子の集合領域に座上する、エフェクター候補遺伝子CCE1に着目し研究を進めた。研究計画に従い、共免疫沈降法と質量分析を組み合わせた手法によって、CCE1の宿主細胞内因子の探索を行った。本実験は、「平成30年度 若手研究者海外挑戦プログラム」の採用者として、Sophien Kamoun教授の研究グループ(英国 セインズベリー研究所)に留学して実施した。Kamoun教授をはじめ研究室内のメンバーの指導を受け、申請者はCCE1の標的候補を得ることに成功した。現在は、共免疫沈降法および酵母ツーハイブリット法により、CCE1と標的候補タンパク質との結合を確認し、本エフェクターの作用機序解明を目指している。申請時の計画に加え、PacBio RSIIを用いて解読したゲノムアセンブリを用いて、C. higginsianum菌株間の比較ゲノム解析を行った。この解析結果をまとめた論文は、Genome Biology and Evolution誌に受理された(平成31年4月)。また、これまでに培ったゲノム解析技術を生かして、共同研究者と4種のColletotrichum属菌のゲノム解読を行い、Molecular Plant-Microbe Interactions誌に発表した。
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专著(0)
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会议论文
Comparative genomics reveals strain-specific variations in the genome of the plant pathogenic fungus Colletotrichum higginsianum
比较基因组学揭示植物病原真菌Colletotrichum higginsianum基因组中的菌株特异性变异
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [Tsushima A., Gan P., Kumakura N., Narusaka M., Takano Y., Narusaka Y., Shirasu K.]
通讯作者: Shirasu K.
Colletotrichum gloeosporioides species complex comparative genomics provides insights into mechanisms of effector evolution
胶孢炭疽菌物种复杂的比较基因组学为效应子进化机制提供了见解
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [Gan P, Hiroyama R, Tsushima A, Kumakura N, Ueno A, Masuda S, Shibata A, Narusaka M, Narusaka Y, Takano Y, Shirasu K]
通讯作者: Shirasu K
A novel class of conserved effectors with ribonuclease domains is involved in virulence of phytopathogenic Colletotrichum fungi on plants
一类具有核糖核酸酶结构域的新型保守效应子参与植物病原炭疽菌真菌对植物的毒力
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [Kumakura, N., Ogawa, S., Gan, P., Tsushima, A., Narusaka, M., Narusaka, Y., Takano, Y., Shirasu, K.]
通讯作者: K.
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [津島綾子, Pamela Gan, 熊倉直祐, 鳴坂真理, 高野義孝, 鳴坂義弘, 白須]
通讯作者: 白須
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    野外における植物病原菌を中心とした微生物間相互作用の解明
    • 批准号:
      24K17895
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额:
      $3.0万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      津島 綾子
    • 依托单位:
    Decoding the molecular basis of phytopathogen evolution in the fungal kingdom
    • 批准号:
      22K20583
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
    • 资助金额:
      $1.83万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      津島 綾子
    • 依托单位:
    海外基金