Decoding the molecular basis of phytopathogen evolution in the fungal kingdom
Decoding the molecular basis of phytopathogen evolution in the fungal kingdom
批准号:
22K20583
负责人:
津島 綾子
金额:
$1.83万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-08-31 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究の目的は、真菌界の植物病原性獲得に関わる因子の同定である。先行研究において、申請者は24種の子のう菌を用いた比較ゲノム解析を行い、植物病原性を示す種に特異的に保存された6BP-2遺伝子を見出した。本年度はこの遺伝子の解析を中心に研究を進めた。申請者は2022年3月までイギリスでポスドクとして研究に従事していた。帰国後、テニュアトラック助教として自身の新しい研究をスタートさせるため、実験材料を取り寄せてそれらの培養環境を整備した。実験に用いるモデル植物病原真菌Colletotrichum higginsianum(Ch)の形質転換系も整備し、Ch6BP-2遺伝子の恒常発現株を得ることに成功した。今後は接種実験を実施して病原性への寄与を評価する予定である。また、公共データベースを利用し、6BP-2の保存パターンを249種の真菌ゲノムに対して調査した。その結果、先行研究で着目した子のう菌類だけでなく担子菌類でも、6BP-2遺伝子の有無と植物病原性の表現型との間に共起関係が見られることがわかった。近年、大量のゲノム情報を高速処理する手法として、k-merによる配列プロファイリングが注目されている。この手法の有用性を検証するため、コムギ赤さび病菌を題材として解析を行なった結果、感染の可否と有意に関連する配列の同定に成功した。k-merを使った手法は多様な真菌に由来する大量の遺伝子配列の解析にも応用できると期待される。この研究成果は令和5年度日本植物病理学会大会で発表した。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
John Innes Centre/NIAB(英国)
约翰英尼斯中心/NIAB(英国)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
コムギ赤さび病菌の病原性決定因子同定に向けたk-mer GWAS解析
K-mer GWAS 分析鉴定小麦锈菌致病决定因素
DOI:
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发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[津島綾子, Amelia Hubbard, Grzegorz Czajowski, Pawel Czembor, Diane G.O. Saunders]
通讯作者:
Diane G.O. Saunders
IHAR-PIB(ポーランド)
IHAR-PIB(波兰)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
野外における植物病原菌を中心とした微生物間相互作用の解明
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批准号:24K17895
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:津島 綾子
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依托单位:
エフェクター遺伝子集合領域に着目した植物病原糸状菌の感染戦略の解明
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批准号:17J02983
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.22万
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财政年份:2017
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负责人:津島 綾子
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依托单位:
海外基金