生理活性化合物の新規標的タンパク質同定法の開発と植物シグナル伝達物質受容体の解明
生理活性化合物の新規標的タンパク質同定法の開発と植物シグナル伝達物質受容体の解明
批准号:
17J03994
负责人:
穴吹 友亮
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-04-26 至 2020-03-31
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英文摘要
生理活性化合物の標的タンパク質同定のためには、標的タンパク質を精製し、アミノ酸配列解析に供することが重要である。ビオチンなどの検出基で修飾した生理活性化合物を用いたアフィニティークロマトグラフィーによる標的タンパク質の精製は多くの研究例がある。しかし、本方法では非特異的に吸着されたタンパク質の混入や回収率の低さという問題があり、標的タンパク質のアミノ酸配列解析を妨げる要因となっている。そのため、この問題を解決した手法を開発できれば、正確でより簡便な標的タンパク質同定が可能になる。そこで、本研究では純度が低いサンプルにおいても標的タンパク質の正確なアミノ酸配列解析を可能にするという観点から、蛍光基を利用した新規な標的タンパク質同定法の開発を研究テーマとした。本手法では、生理活性化合物の化学修飾を最小限に止めたアジドプローブおよびリンカーを用いて蛍光基を標的タンパク質に導入する。当該年度は、これまでに合成した蛍光基を有するリンカーを用いて、新規手法の有効性の検証実験を行った。有効性の検証においては、アブシジン酸(ABA)とその受容体AtPYL2の既知の相互作用を対象とした。組換えAtPYL2を過剰発現した大腸菌由来の粗タンパク質抽出液とABA由来のアジドプローブをインキュベートした。次に、蛍光基を有するリンカーとヨウ化銅を添加し、クリック反応によりアジドプローブに結合させた。360 nmのUVを照射し、標的タンパク質とリンカーのクロスリンクを行った。蛍光基がAtPYL2に導入していることを確認するため、反応後の粗タンパク質抽出液を電気泳動に供した後、ゲル撮影装置を用いて蛍光の検出を試みた。しかし、組換えAtPYL2の分子量付近に蛍光は検出されなかった。本年度内にその原因を特定することはできなかったため、今後手法が有効になるように改良していく必要がある。
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会议论文
化学と生物
化学和生物学
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tsuji Y, Watanabe K, Araki K, Shinohara M, Yamagata Y, Tsurimoto T, Hanaoka F, Yamamura K, Yamaizumi M, Tateishi, S., 清成信一]
通讯作者:
清成信一
アグリバイオ 2019年4月号
Agribio 2019年4月号
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[穴吹 友亮, 高橋 公咲]
通讯作者:
高橋 公咲
DOI:
10.1016/j.bmcl.2017.12.055
发表时间:
2018-02-15
期刊:
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS
影响因子:
2.7
作者:
[Anabuki, Tomoaki, Tsukahara, Miu, Takahashi, Kosaku]
通讯作者:
Takahashi, Kosaku
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