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Dissecting the co-translational modifications by quantitative proteomics

通过定量蛋白质组学剖析共翻译修饰

基本信息

批准号：
20H03241
负责人：
今見考志
金额：
$ 10.73万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research (2022-2023)Kyoto University (2020-2021)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度はpSNAP法（Uchiyama et al., iScience 2022）と種々の生化学濃縮技術を組み合わせることで、リン酸化、アセチル化、ミリストイル化などの共翻訳修飾を系統的に同定し、新生鎖に起きる修飾の全貌を明らかにすることを目的とした。まず、N末端濃縮技術（Chang CH et al. Mol Cell Proteomics. 2021）を改良し、簡便なピペットチップ型のN末端濃縮法を確立した。これにより、low inputの新生鎖濃縮サンプルにも適用可能な高感度N末端アセチル化ペプチドの濃縮が可能となった（Morikawa et al., in prep.）。また、液液抽出を用いた共翻訳的に起こるN末端ミリストイル化ペプチド濃縮法も開発した（Tsumagari et al., submitted）。さらにリン酸化に関しては、100種以上の共翻訳的なリン酸化部位を同定し、そのうちヒストンH1.5のN末端ではアセチル化とリン酸化が共存することを見出した。興味深いことに、アセチル化ペプチドフォームとアセチル化・リン酸化ペプチドフォーム、未修飾フォームでは結合するタンパク質種が異なっていた。これらの結合相手をさらに解析すると、共翻訳的な修飾種によってタンパク質の安定化や分解を制御しうる可能性を見出した。今後、本手法をさらに発展させ、共翻訳的な修飾の高深度解析とその機能的意義の解明に取り組んでいく予定である。

This year, the pSNAP method (Uchiyama et al., iScience 2022) is used to modify the whole system of biochemistry, chemistry, chemistry, acidification, chemistry, chemistry and chemistry. Chang CH et al, N-terminal telomerization technology. Mol Cell Proteomics. 2021) the method of improving and defecating is confirmed by the N-terminal method. The new students in low input may have a high sensitivity in the N-terminal (Morikawa et al., in prep.) The liquid-liquid extraction and liquid-liquid extraction devices are used to start the start-up and end-to-end operation of the liquid-liquid extraction machine. The chemical reaction method is used to open the Tsumagari et al., submitted. The acidizing sites of more than 100 kinds of oils are the same, and the N-terminal chemical acidizing sites of more than 100 kinds of oils are the same, H1.5 and H1.5, respectively. The flavor is deep, the temperature is low, the temperature is low. In combination with the hand-made analysis of the system, a total of several types of equipment have been reviewed to determine the possibility of stabilization and control of the system. In the future, this technique will be used to analyze the meaning of the mechanism in a high-depth analysis.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Protein Synthesis in the Developing Neocortex at Near-Atomic Resolution Reveals Ebp1-Mediated Neuronal Proteostasis at the 60S Tunnel Exit.

DOI：
10.1016/j.molcel.2020.11.037
发表时间：
2021-01-21
期刊：
Molecular cell
影响因子：
16
作者：
Kraushar ML;Krupp F;Harnett D;Turko P;Ambrozkiewicz MC;Sprink T;Imami K;Günnigmann M;Zinnall U;Vieira-Vieira CH;Schaub T;Münster-Wandowski A;Bürger J;Borisova E;Yamamoto H;Rasin MR;Ohler U;Beule D;Mielke T;Tarabykin V;Landthaler M;Kramer G;Vida I;Selbach M;Spahn CMT
通讯作者：
Spahn CMT

Nascent proteome matters

新生蛋白质组很重要