乳癌細胞におけるシグナル伝達ダイナミクスのリン酸化プロテオーム解析
乳腺癌细胞信号转导动力学的磷酸化蛋白质组学分析
基本信息
- 批准号:09J05184
- 负责人:
- 金额:$ 1.09万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2009
- 资助国家:日本
- 起止时间:2009 至 2010
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
乳癌用分子標的薬ラパチニブのin vivo薬効評価を定量的リン酸化プロテオミクス手法を用いて行った。乳癌患者の25%で過剰発現している上皮増殖因子受容体2(HER2)は癌の増殖・浸潤に積極的に関わっているため、分子標的薬の多くはHER2をターゲットにしている。ラパチニブはHER1/2に対する選択性の高さからも最も臨床で用いられている分子標的薬である。一方、ラパチニブがin vivoにおいて細胞内シグナル伝達経路にどのように作用するかは分かっていない。今回我々は質量分析法に基づく定量的リン酸化プロテオミクス手法を用いることで、約5,000ものタンパク質リン酸化部位に対して、ラパチニブ処理によって誘導される濃度・時間依存的リン酸化シグナル動態をプロファイルすることに成功した。安定同位体標識した乳癌細胞から抽出したタンパク質を消化後、独自に開発したヒドロキ酸修飾金属クロマトグラフィーによってリン酸化ペプチドを選択的に濃縮し、質量分析計によりリン酸化ペプチドを同定・定量した。その結果、全同定リン酸化ペプチドのうち5%程度がラパチニブ処理によって変動しており、HER1/2シグナル伝達経路の既知分子のみならず多くの未知シグナル伝達分子を同定することに成功した。バイオインフォマティクス解析により、これまでラパチニブが作用することが報告されていなかった特定のタンパク質ネットワーク・複合体にもラパチニブが作用しうることを示した。また、HER1/2の21のリン酸化部位に対してそれらの濃度・時間依存的リン酸化ダイナミクスをプロファイルしたところ、領域特異的にリン酸化が制御されていることを明らかにした。HER1/2のリン酸化部位とチロシンキナーゼ活性との関係性を明らかにすることで、HER1/2の活性制御の理解と新たな薬剤標的に関する考察が得られることが期待できる。
The molecular marker for breast cancer is in vivo. Epithelial growth factor receptor 2(HER2) is found in 25% of breast cancer patients and is actively involved in cancer growth and invasion. The molecular target of the drug is selected from the group consisting of HER1 and HER2. A side, a side. This paper reports the successful application of mass spectrometry in the determination of the concentration and time-dependent acidification dynamics in the treatment of 5,000 samples. Stable isotope identification, extraction, digestion, isolation, concentration, mass analysis, determination, quantification of acid-modified metals As a result, the identity of each molecule is determined by 5% of the total number of molecules in the sequence. The identity of each molecule is determined successfully by 1/2 of the sequence. For example, if you want to use a computer, you can use a computer. For example, HER1/2 and 21 have different concentrations and time dependent acidification. The relationship between HER1/2 activity and its acidifying site was investigated.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Can SILAC Quantitatively Characterize Phosphoproteome in Culture Cells?
SILAC 能否定量表征培养细胞中的磷酸化蛋白质组?
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Akitsugu Konno;Miho Inoue-murayama;Toshikazu Hasegawa;渡邉浩平;青山弘之;今見考志
- 通讯作者:今見考志
定量的リン酸化プロテオミクスを用いたラパチニブのin vivo薬効評価
使用定量磷酸蛋白质组学评估拉帕替尼的体内功效
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Sakata Y;Kaneko S;Hayano A;Inoue-Murayama M;Ohgushi T;Isagi Y;Kimitaka Matsuzato;小山信裕;斉藤慶・中島淳・関島恒夫・島谷幸宏・河口洋一;今見考志
- 通讯作者:今見考志
二重標識SILAC法を用いた乳癌細胞のシグナル伝達ダイナミクスのリン酸化プロテオーム解析
使用双标记 SILAC 方法对乳腺癌细胞信号转导动力学进行磷酸化蛋白质组学分析
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:高瀬識之;高橋裕里香;山根久和;野尻秀昭;今見考志
- 通讯作者:今見考志
Quantitative proteome and phosphoproteome analyses of cultured cells based on SILAC labeling without requirement of serum dialysis
- DOI:10.1039/b921379a
- 发表时间:2010-01-01
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Imami, Koshi;Sugiyama, Naoyuki;Ishihama, Yasushi
- 通讯作者:Ishihama, Yasushi
定量的リン酸化プロテオーム解析による分子標的薬評価
通过定量磷酸化蛋白质组分析评价分子靶点药物
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Noda;A.;Mitsui;Y.;Ikeda;H.;Setoguchi;H.;吉崎えり奈・及川康子・高村典子;杉山直幸
- 通讯作者:杉山直幸
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今見 考志其他文献
Nascent proteome matters
新生蛋白质组很重要
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西田 紘士;今見 考志;石濱 泰;Koshi Imami - 通讯作者:
Koshi Imami
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- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
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森 和俊
タンパク質末端解析データを用いたノンカノニカルタンパク質の同定
使用蛋白质末端分析数据鉴定非典型蛋白质
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西田 紘士;今見 考志;高地 雄太;石濱 泰 - 通讯作者:
石濱 泰
Diet-related factors showed greater effects than host phylogeny in shaping the gut microbiota of Japanese macaques
饮食相关因素对日本猕猴肠道微生物群的塑造比宿主系统发育的影响更大
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西田 紘士;今見 考志;石濱 泰;Wanyi Lee - 通讯作者:
Wanyi Lee
細胞外小胞の動態を捉えるプロテオミクス基盤技術
捕捉细胞外囊泡动态的蛋白质组学基础技术
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西田 紘士;今見 考志;石濱 泰;Koshi Imami;今見考志 - 通讯作者:
今見考志
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Dissecting the co-translational modifications by quantitative proteomics
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- 批准号:
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