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媒介蚊のゲノムに眠る古代ウイルス遺伝子は蚊に深刻な病態を引き起こすのか？

隐藏在蚊子载体基因组中的古代病毒基因是否会导致蚊子患严重疾病？

基本信息

批准号：
21K19119
负责人：
鈴木康嗣
金额：
$ 3.99万
依托单位：
Ehime University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-07-09 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19119/
关键词：
内在性ウイルス配列媒介蚊古代ウイルス

项目摘要

本研究は、多くのヒト病原性ウイルスを媒介するシマカに高い病原性を示すウイルスを蚊の内在性ウイルス配列（EVE）から探索し、その復元を目的とするものである。本年度は、複数のバイオデータベースとバイオインフォマティクスデータベースを用いて、シマカのEVE探索を行った。まず、新たに高品質のゲノム配列情報が公開されたネッタイシマカゲノム（CU_AaegROCK_1.0）に対して、BLASTnとtBLASTnにより、フラビウイルス属ウイルスに類似する配列の検索を行った。その結果、リファレンスゲノムとして用いられているAaegL5.0では8遺伝子座のEVEが検出されたのに対し、CU_AaegROCK_1.0では14遺伝子座のEVEが検出された。現在、詳細な解析を行っている。また、同様にTFASTX、TFASTYを用いたEVE探索も実施した結果、tBLASTnよりヒット数が多いものの、ヒットした配列のうち、FASTAでのみヒットしてきた配列の多くは単純リピート様配列であったため、False positiveである可能性が高い。False positiveと真のEVE配列を適切に選別するには、大規模検索後に手動での精査が必要であったため、その使用には方法の改善や使用場面を限定することが不可欠であることが分かった。さらに公共のデータベースであるSequence Read Archive (SRA)に登録されているシマカ由来の4233ハイスループットシークエンスデータ（DNAライブラリ）に対して、Magic-BLASTによりフラビウイルス属ウイルスの類似配列の検出を行った。フラビウイルス属ウイルスのうち、73種のウイルスに類似した配列が検出された。

In this study, multiple pathogenicity tests showed that the pathogenicity of mosquitoes was high, the pathogenicity of vectors was high, and the intrinsic sex of mosquitoes was detected by EVE. This year, the number of copies will be used. This year, we will use the EVE to explore the line. The configuration information is similar to that of the configuration line, which is similar to that of the queue, which is similar to that of the public, new, high-quality, high-quality, high-quality, In the results, you can use the command AaegL5.0