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RNA転写のDNA複製へのトランスアクション

将 RNA 转录转导为 DNA 复制

基本信息

批准号：
21K19203
负责人：
大学保一
金额：
$ 4.08万
依托单位：
Japanese Foundation for Cancer Research (2022)Tohoku University (2021)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-07-09 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K19203/
关键词：
DNA複製転写 DNAポリメラーゼ複製開始点染色体編成

项目摘要

研究代表者は、本研究一年次にリーディング鎖・ラギング鎖合成それぞれを担うPolε（イプシロン）とPolα（アルファ）の合成プロファイルを用いて複製フォーク開始・停止領域を解析する方法を確立した。本年次は、この方法を用いて、遺伝子転写による複製フォーク動態への影響を検証した。特に、個々のDNAポリメラーゼ機能、複製開始・停止を示すゲノムプロファイルのパターンを、転写量によってグループ化した遺伝子群に分けて検証し、転写による影響を明確化する解析作業を実施した。転写開始領域(Transcription Start Site: TSS)付近においては、複製開始反応がおきる一方で，その領域を通過する複製フォークの進行が遅延・停止することが示された。このことは、転写開始領域付近に結合したRNAポリメラーゼが複製フォークの進行に影響を及ぼすことを示唆する。転写領域（gene body）を進行する複製フォークにおいて、転写と逆方向に進む、すなわち、非転写鎖を鋳型とする、DNA合成の効率が低下することを発見した。この現象は、RNAポリメラーゼが転写領域を通過する際に、非転写鎖が単鎖DNAとして露出し、配列特異的な立体構造や化学修飾によるDNA損傷が蓄積し、引き起こされたと考えられる。現在まで、がんのゲノム情報の解析から、非転写側のDNA損傷が変異の誘発の原因となることが示されている。本研究の結果はこの点と整合性があり、転写領域のDNAポリメラーゼ動態がゲノム安定性において重要な要素であることを示した。

The research representative established the method for analyzing the starting and stopping fields of the first year of this study. This year, the method is used to verify the impact of replication and dynamic analysis. Special, individual DNA replication function, replication start/stop indication, replication amount, replication time, replication time, identification time, replication time, analysis time. Transcription Start Site: TSS is near, copy start is near, copy start is near, all fields are near, copy start is near. This is the first time that the virus has been detected. Gene body replication, gene reverse direction, gene lock, gene synthesis efficiency reduction This phenomenon involves the accumulation of DNA damage caused by RNA fragmentation and chemical modification. Now, the analysis of DNA damage information and the causes of DNA damage variation on the non-writing side are shown. The results of this study show that the DNA diversity in the domain of integration is important for stability.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Global usage of replicative polymerases and its relation with transcription in human cells U

复制聚合酶的全球使用及其与人类细胞转录的关系 U

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Koyanagi Eri;Kakimoto Yoko;Yoshifuji Fumiya;Natsume Toyoaki;Higashitani Atsushi;Ogi Tomoo;Carr Antony M.;Kanemaki Masato T.;Daigaku Yasukazu;Yasukazu Daigaku
通讯作者：
Yasukazu Daigaku

DNA polymerase dynamics and genomic instability

DNA聚合酶动力学和基因组不稳定性