DNAポリメラーゼ研究におけるゲノム科学的,分子科学的アプローチの融合
DNAポリメラーゼ研究におけるゲノム科学的,分子科学的アプローチの融合
批准号:
15H06032
负责人:
大学 保一
金额:
$0.92万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-08-28 至 2016-03-31
中文摘要
<Polζゲノム科学的解析に必要な分裂酵母株の作成>リボヌクレオチドを高頻度の取り込むPolζをコードする変異遺伝子の作成に着手した.第一に,Polε,PolδとPolζのカタリティックドメインのアライメントを作成し,Polζの変異されるべきアミノ酸を特定した.その後,Polζをコードする遺伝子(rev3)をプラスミドにクローニング後,当該アミノ酸が変異した遺伝子を作成した.その遺伝子をcre-loxシステムを用いて,分裂酵母の内在のrev3遺伝子と置換した.この酵母を使用して,細胞内での変異Polζの機能を解析した結果,多少の機能低下は観察されるものの,PolζのDNA合成能は失われていないことが判明した.現在,変異PolζのDNA合成によるリボヌクレオチドの取り込み定量を行っている.今後は,この株を利用して,ゲノムワイドにPolζ合成領域の特定(Pu-seq)を行う.変異Polζ遺伝子をコードする酵母株の作成と並行して,PolζによるDNA合成が必要となる細胞株の樹立もおこなった.Polζ欠損株とPolεの機能が低減した株をかけ合せて結果,PolεとPolζの二重変異株において顕著な増殖阻害が観察された.これは,Polε変異体でゲノム中のPolζの合成領域が拡大していることを示している.よって,Polε変異体において,Polζを対象としたPu-seq実験を行い,Polζがリーディング鎖合成を担うPolεを補助する仕組みを今後検証する.<細胞内でのPolζの1分子レベルでの観察に必要な酵母株の作成>PALM法を用いて,Polζの細胞内1分子観察を行うため,Polζのカタリティック因子のN末端にmEos蛍光体が結合した遺伝子の作成に着手した.現在までに,Polζ遺伝子とmEos遺伝子が結合した配列のプラスミド上へのクローニングが完了し,現在,酵母株への導入を行っている.
英文摘要
<Polζゲノム科学的解析に必要な分裂酵母株の作成>リボヌクレオチドを高頻度の取り込むPolζをコードする変異遺伝子の作成に着手した.第一に,Polε,PolδとPolζのカタリティックドメインのアライメントを作成し,Polζの変異されるべきアミノ酸を特定した.その後,Polζをコードする遺伝子(rev3)をプラスミドにクローニング後,当該アミノ酸が変異した遺伝子を作成した.その遺伝子をcre-loxシステムを用いて,分裂酵母の内在のrev3遺伝子と置換した.この酵母を使用して,細胞内での変異Polζの機能を解析した結果,多少の機能低下は観察されるものの,PolζのDNA合成能は失われていないことが判明した.現在,変異PolζのDNA合成によるリボヌクレオチドの取り込み定量を行っている.今後は,この株を利用して,ゲノムワイドにPolζ合成領域の特定(Pu-seq)を行う.変異Polζ遺伝子をコードする酵母株の作成と並行して,PolζによるDNA合成が必要となる細胞株の樹立もおこなった.Polζ欠損株とPolεの機能が低減した株をかけ合せて結果,PolεとPolζの二重変異株において顕著な増殖阻害が観察された.これは,Polε変異体でゲノム中のPolζの合成領域が拡大していることを示している.よって,Polε変異体において,Polζを対象としたPu-seq実験を行い,Polζがリーディング鎖合成を担うPolεを補助する仕組みを今後検証する.<細胞内でのPolζの1分子レベルでの観察に必要な酵母株の作成>PALM法を用いて,Polζの細胞内1分子観察を行うため,Polζのカタリティック因子のN末端にmEos蛍光体が結合した遺伝子の作成に着手した.現在までに,Polζ遺伝子とmEos遺伝子が結合した配列のプラスミド上へのクローニングが完了し,現在,酵母株への導入を行っている.
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
ゲノム複製におけるDNAポリメラーゼ間での機能分担と協調性
基因组复制中DNA聚合酶的功能分工与协作
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大学 保一, Andrea Keszthelyi, 宮部 泉, Antony M. Carr]
通讯作者:
Antony M. Carr
DOI:
10.1038/nprot.2015.116
发表时间:
2015-11-01
期刊:
NATURE PROTOCOLS
影响因子:
14.8
作者:
[Keszthelyi, Andrea, Daigaku, Yasukazu, Carr, Antony M.]
通讯作者:
Carr, Antony M.
University of Sussex(英国)
萨塞克斯大学(英国)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DNA複製・RNA転写コンフリクトのゲノム科学的解析
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批准号:23K27156
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.57万
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财政年份:2024
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负责人:大学 保一
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依托单位:
DNA複製・RNA転写コンフリクトのゲノム科学的解析
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批准号:23H02463
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.98万
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财政年份:2023
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负责人:大学 保一
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依托单位:
RNA転写のDNA複製へのトランスアクション
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批准号:21K19203
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.08万
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财政年份:2021
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负责人:大学 保一
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依托单位:
海外基金