食物連鎖を介した海鳥における抗菌薬耐性菌の蓄積・拡散動態

海鸟体内耐药细菌通过食物链的积累和扩散动态

基本信息

  • 批准号:
    21K12272
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

令和4年度は、北海道で繁殖する海鳥(オオセグロカモメおよびウミネコ)の糞、餌となる海洋生物、動物プランクトン、生息域周辺の海水を採取した。濃縮法方法を検討したが、動物プランクトン、海洋生物(二枚貝)、海水については、コリスチン耐性大腸菌および大腸菌群数が検出限界付近であり、分離した菌株ではコリスチン耐性遺伝子mcrは検出されなかった。一方海鳥については耐性大腸菌および大腸菌群数が多く、周辺の環境よりも顕著に濃度が高かった。分離した耐性大腸菌については、mcr-1株を保有しているものが多くすべてmcr1.1の塩基配列であった。また糞に含まれるmcr-1遺伝子の陽性率は採取時期とともに変動した。超並列DNAシーケンサーを用いて、16S rRNA遺伝子をもとにした細菌群集組成、真核生物のCOI遺伝子をもとにした餌の組成を網羅的に調べた。属レベルでは細菌群集組成は比較的安定であったが、一部有意に増加、減少する属が見られた。餌の種類は季節変動が大きい傾向にあった。耐性菌数と海鳥の餌の種類との相関性を調べたところ、mcr-1遺伝子陽性率は、Anisodactylus(ゴミムシ)、Cerorhinca(ウトウ)、Pseudocalanus(カイアシ類)正の相関を示した。一部の昆虫が耐性大腸菌数と正の相関を示した。異なる地域(天売島、稚内、厚岸)で繁殖するオオセグロカモメについて、mcr-1遺伝子、細菌群集組成、餌の組成を比較したところ、異なる地域のオオセグロカモメにおいてもmcr-1遺伝子を保有していることがわかり、mcr-1遺伝子陽性率と餌の組成は地域差が小さく、細菌群集組成は特定の属の地域差が大きいことがわかった。
Make and 4 annual は, Hokkaido で す to reproduce る seabirds (オ オ セ グ ロ カ モ メ お よ び ウ ミ ネ コ) の dung, bait と な る Marine biology, animal プ ラ ン ク ト ン, interest-bearing domain weeks 辺 の seawater を take し た. Beg し enrichment process method を 検 た が, animal プ ラ ン ク ト ン, Marine life, (2), seawater に つ い て は, コ リ ス チ ン patience coliform お よ び fecal coliform count が 検 out limit pay nearly で あ り, separating し た strains で は コ リ ス チ ン patience heritage 伝 son MCR は 検 out さ れ な か っ た. A seabird に つ い て は patience coliform お よ び fecal coliform count が く, weeks 辺 の environment よ り も 顕 with high concentration of に が か っ た. Separation し た patience coliform に つ い て は, MCR - 1 strain を retain し て い る も の が more く す べ て McR1.1 の salt base with column で あ っ た. Youdaoplaceholder0 fecal に containing まれるmcr-1 remains 伝 positive rate <s:1> collection period とと に に に variation た た. Super parallel DNA シ ー ケ ン サ ー を with い て, 16 s rRNA but 伝 を も と に し た of bacterial colonization, eukaryotes の COI heritage 伝 son を も と に し た の bait composition を snare に adjustable べ た. The bacterial community composition of the genus レベ で で レベ is relatively stable であったが, and some intentionally に increases and decreases する. The genus が can be seen in られた. The species of bait が seasonal variation が large <s:1> が tendency にあった にあった. Types of resistant bacterium number と seabirds の bait の と の phase masato sex を adjustable べ た と こ ろ heritage, MCR - 1 伝 positive rate は, Anisodactylus (ゴ ミ ム シ), Cerorhinca (ウ ト ウ), Pseudocalanus (カ イ ア シ class) is の phase masato を shown し た. The number of coliform bacteria in an insect が with tolerance と is positively correlated with を and shows <s:1> た. Different な る region (days 売 island, childish, thick shore) で breeding す る オ オ セ グ ロ カ モ メ に つ い て heritage, MCR - 1 伝, bacterial colonization of composition, bait の を compare し た と こ ろ, different な る regional の オ オ セ グ ロ カ モ メ に お い て も MCR - 1 heritage 伝 son を retain し て い る こ と が わ か り, MCR - 1 but 伝 positive と の bait The regional differences of が are small さく, and the regional differences of <s:1> specific <s:1> genera composed of bacterial clusters are が large が とがわ とがわ った った.

项目成果

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专著数量(0)
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专利数量(0)
繁殖期のオオセグロカモメ腸内に含まれる細菌群集、餌、コリスチン耐性大腸菌の変動
繁殖季节黑背鸥肠道内细菌群落、饮食和耐粘菌素大肠杆菌的变化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    上田 翔太;鶴田 悠斗;中村 優花;見坂 武彦
  • 通讯作者:
    見坂 武彦
北海道で繁殖するカモメ腸内に含まれる細菌群集、餌、コリスチン耐性大腸菌の変動
北海道繁殖的海鸥肠道内细菌群落、饮食和耐粘菌素大肠杆菌的变化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    上田 翔太;鶴田 悠斗;中村 優花;見坂 武彦
  • 通讯作者:
    見坂 武彦
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