南極アイスコア中の古代真菌DNA系統解析と古環境変動に伴う真菌の動態解明

南极冰芯中古代真菌 DNA 的系统发育分析以及与古环境变化相关的真菌动力学的阐明

• 批准号: 21K12215
• 负责人: 中澤 文男
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: National Institute of Polar Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-11-15 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K12215/
• 关键词: 遺伝子解析; 古代DNA; 1細胞; PCR; ゲノム

本研究の目的は、1）ドームふじアイスコアに保存されている真菌を1細胞ずつ分離し、DNA分析する方法を開発すること、2)アイスコア中の古代真菌について包括的にDNA系統解析をおこなうこと、3）古環境変動データと組み合わせることで、環境変動が真菌の起源（発生源）や数、種組成に及ぼした影響を解析することにある。今年度は、氷試料から真菌細胞を捕集する方法について検討を始めた。本研究では真菌細胞の捕集に細胞分離装置を用いる計画とした。氷試料を融解し、融解水試料を本装置に導入するのだが、導入量は数mlに限られる。アイスコア中の真菌細胞濃度は低いため、前処理として細胞を濃縮する操作が必要となる。そこで、遠心分離による濃縮を試すこととした。そのために遠心分離機を購入した。この方法で効率よく濃縮できない場合は、融解水試料をフィルターろ過し、フィルター上に細胞を捕集する。その後、フィルターを少量の水に浸し、フィルターから細胞を剥離させる操作を追加する予定である。尚、南極地域観測隊の越冬隊員として南極昭和基地にて観測活動に従事することになり、その期間は研究活動を進めることが困難になったため、本研究課題の研究を令和3年11月1日より一時中断することとした。

は の purpose, this study 1) ド ー ム ふ じ ア イ ス コ ア に save さ れ て い る fungi を 1 cell ず つ separation し, DNA analysis す る method を open 発 す る こ と, 2) ア イ ス コ ア の ancient fungus に つ い て including に DNA system analytic を お こ な う こ と, 3) the ancient environment - デ ー タ と group み close わ せ る こ と で, environment - が really The origin (origin source) of the bacteria や number, species composition に and ぼ <s:1> た influence を analysis する する とにある とにある. This year, the <s:1> and 氷 test materials ら ら fungal cell を collection する method に 氷 て検 て検 て検 て検 て検 is discussed を and めた is initiated めた. In this study, で で fungal cells were captured by a に cell separation device を using the で る project と た た. Youdaoplaceholder0 test material を dissolution られる, dissolved water test material を this device に introduction する だが だが, introduction volume に number of mlに limit られる. ア イ ス コ ア は の fungal cell concentration in the low い た め, former 処 と し て cells を enrichment す る が necessary operation と な る. Youdaoplaceholder0 で で, telecentric separation による concentration を try す とと とと た た た. Youdaoplaceholder0 ために telecentric separator を purchased た た. こ の way で sharper rate よ く enrichment で き な い は, melt water sample を フ ィ ル タ ー ろ し, フ ィ ル タ ー に cells on を capture す る. , after そ の フ ィ ル タ ー little の を に immersion し, フ ィ ル タ ー か ら cells を stripping さ せ る operation を additional す る designated で あ る. Is の wintering, the Antarctic region 観 team と し て Antarctic showa base に て 観 activity measurement に 従 matter す る こ と に な り, そ の は research activities during を into め る こ と が difficult に な っ た た を の め, this research subject research to November 1, and 3 よ り temporarily interrupt す る こ と と し た.