Elucidating the dynamics of the Copan dynasty in the Maya civilization through paleogenomics

通过古基因组学阐明玛雅文明科潘王朝的动态

• 批准号: 22H04928
• 负责人: 中村 誠一
• 金额: $ 125.63万
• 依托单位: Komatsu University (2023)Kanazawa University (2022)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-27 至 2027-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22H04928/
• 关键词: コパンのマヤ遺跡; コパン王朝史; パレオゲノミクス; ティカル遺跡; マヤ文明; コパン王朝; ティカル国立公園

本年度は、マヤ文明研究において世界で初めてとなる本格的なパレオゲノミクス研究の基盤を築いた1年であった。研究代表者は3回にわたり現地へ渡航し、過去40年間にわたる現地調査において発掘・収集した数百点に及ぶ埋葬人骨一次資料のうち、合計92サンプルを日本のラボへ移送した。本年度は選定サンプルとして、これまでの研究によりDNAの残存率が比較的高い側頭骨錐体部に限定した。断片状のサンプルも多かったため、収集したサンプルが側頭骨錐体部であることを確認する目的でチェックを行った結果、日本のラボへ運ばれたサンプルの約72％が該当部位であった。一方、本年度は金沢大学の考古科学実験室内に分子生物学実験の自動前処理装置であるベックマンコールター社のBiomek i5を設置した。自動前処理装置の導入によって、人が手動で長い時間をかけて実験をしていた工程を自動化できるため、手動での実験よりもはるかに迅速かつ正確に実験ができるようになる。この前処理装置をパレオゲノミクス研究に応用し、コパン遺跡出土人骨のパレオゲノミクス研究を加速させるための準備を進めてきた。Biomek i5にパレオゲノム解析専用のDNA自動抽出プロトコルと次世代シーケンサー用のDNAライブラリ作成プロトコルを実装し、1日で80検体のDNA抽出・DNAライブラリ作成が可能になった。古代ゲノムデータ取得のハイスループット化に成功したので、今後はサンプリングしたコパン遺跡出土人骨から多検体のゲノムデータの取得を順次進めていく。ゲノムデータ取得と合わせて放射性炭素年代測定のための骨コラーゲン抽出も実施し、保存状態の良好な骨コラーゲンの抽出にも成功している。コパン遺跡から得られる多くの個体のゲノム・年代・形態・同位体・考古学データを統合的に解析することで、出土人骨の遺伝的な繋がりについて多角的に評価し王朝のダイナミクスに迫っていきたい。

This year は, マ ヤ civilization research に お い て め the early で て と な る this lattice な パ レ オ ゲ ノ ミ ク ス の plate was studied を built い た で 1 year あ っ た. Research representatives は 3 back に わ た り in situ へ tayouan し, over the past 40 years に わ た る in situ investigation に お い て 発 digging, collections of 収 し た hundreds of points に and ぶ bury a bone materials の う ち, total 92 サ ン プ ル を Japan の ラ ボ へ transferred し た. This annual は selected サ ン プ ル と し て, こ れ ま で の research に よ り DNA の が survival rate comparison of high い lateral skull cone に qualified し た. More than broken flake の サ ン プ ル も か っ た た め, 収 し た サ ン プ ル が lateral skull cone department で あ る こ と を confirm す る purpose で チ ェ ッ ク を line っ た results, Japan の ラ ボ へ luck ば れ た サ ン プ ル の about 72% が should place で あ っ た. One party, this year's は の kanazawa university archaeology science be 験 indoor に molecular biology be 験 の automatic 処 before manage device で あ る ベ ッ ク マ ン コ ー ル タ ー club の Biomek i5 を set し た. Automatic 処 before manage device の import に よ っ て, people が manual で い long time を か け て be 験 を し て い た engineering を automation で き る た め, manual で の be 験 よ り も は る か に quickly か つ に right be 験 が で き る よ う に な る. こ の 処 before Richard device を パ レ オ ゲ ノ ミ ク ス research に 応 し, コ パ ン relics unearthed bones の パ レ オ ゲ ノ ミ ク ス research を accelerate さ せ る た め の prepare を into め て き た. Biomek i5 に パ レ オ ゲ ノ ム parsing 専 with の DNA automatic extraction プ ロ ト コ ル と nextgen シ ー ケ ン サ ー with の DNA ラ イ ブ ラ リ made プ ロ ト コ ル を be で し, 1, 80 検 body の DNA extraction, DNA ラ イ ブ ラ リ made が may に な っ た. Ancient ゲ ノ ム デ ー タ obtain の ハ イ ス ル ー プ ッ ト change に successful し た の で, future は サ ン プ リ ン グ し た コ パ ン relics unearthed bones か ら much 検 の ゲ ノ ム デ ー タ の obtain を progressive into め て い く. ゲ ノ ム デ ー タ achieve a と わ せ て radiocarbon dating の た め の bone コ ラ ー ゲ ン spare も be し, keep good state の な bone コ ラ ー ゲ ン の spare に も successful し て い る. コ パ ン ruins か ら have ら れ る more く の individual の ゲ ノ ム · s · form, with a body, archaeology デ ー タ を integrative に parsing す る こ と で の bone unearthed from, but 伝 な 繋 が り に つ い て に polygonal reviews 価 し dynasty の ダ イ ナ ミ ク ス に forced っ て い き た い.

项目成果

Ancient human and pathogen genomics in the Japanese archipelago

日本列岛的古代人类和病原体基因组学

• 发表时间: 2022
• 作者: 戸嶋和也;一寸木佑;高戸了;田丸司;森田良文;Shigeki Nakagome;Shigeki Nakagome;Shigeki Nakagome
• 通讯作者: Shigeki Nakagome

パレオゲノミクスによるマヤ文明コパン王朝のダイナミクス解明

利用古基因组学阐明玛雅文明科潘王朝的动态

Cooperacion internacional japonesa en arqueologia de Honduras; Resultados de 40 anos de historia y perspectiva en el future

日本考古与洪都拉斯国际合作；

• 发表时间: 2022
• 作者: 戸嶋和也;一寸木佑;高戸了;田丸司;森田良文;Shigeki Nakagome;Shigeki Nakagome;Shigeki Nakagome;Shigeki Nakagome;Seiichi Nakamura
• 通讯作者: Seiichi Nakamura

マヤ文明コパン遺跡における先端技術を導入した調査研究プロジェクトと 文化庁「文化遺産国際協力拠点交流事業」の令和4年度実施報告

玛雅文明科潘遗址引进尖端技术研究项目及文化厅“文化遗产国际合作中心交流项目”2020年度实施情况报告

• 发表时间: 2022
• 作者: 戸嶋和也;一寸木佑;高戸了;田丸司;森田良文;Shigeki Nakagome;Shigeki Nakagome;Shigeki Nakagome;Shigeki Nakagome;Seiichi Nakamura;中村誠一
• 通讯作者: 中村誠一

Tracing genetic origins and legacy of Japanese populations: insights from ancient genomics in insular East Asia

追踪日本人口的遗传起源和遗产：东亚岛屿古代基因组学的见解

• 发表时间: 2022
• 作者: 戸嶋和也;一寸木佑;高戸了;田丸司;森田良文;Shigeki Nakagome
• 通讯作者: Shigeki Nakagome