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Dissecting biosynthetic machineries of natural peptides leading to structural and functional diversities.

Dissecting biosynthetic machineries of natural peptides leading to structural and functional diversities.
剖析天然肽的生物合成机制,导致结构和功能的多样性。
批准号:
22H04976
负责人:
大利 徹
金额:
$108.33万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-27 至 2027-03-31

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项目成果

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天然ペプチド化合物に構造・機能多様性をもたらす以下の新規酵素と生合成機構に着目し解析行った。①一部細菌は、ペプチドグリカン生合成で、MurLが中間体UDP-MurNAc-L-Ala-L-Gluの末端L-Gluを異性化する。MurLの反応機構解明のためのX線結晶構造解析に必要な反応中間体を保護基がついた状態まで合成した。②ペプチドMS-271の生合成においてMslHがプレカーサーペプチドのC末端L-TrpをD体に異性化する。その反応機構解明のため結晶構造解析を行った結果、Ca2+に依存した酸塩基触媒反応によることが分かった。③grisemycinはリボソームで生合成されるが複数のDアミノ酸を含む。生合成遺伝子クラスターを異種宿主で発現させた結果、D体アミノ酸を含むgrisemycinが生産されたことから、クラスター中、唯一機能未知のL遺伝子産物が関与すると推定された。④ポリグルタミン酸は4つの膜酵素PgsABCEにより合成されるが詳細な機構は不明である。これまでにL-Gluの重合反応と続く異性化反応によりD-Gluが導入されることを実証した。PgsAが上述のMslH と相同性を示すことから、PgsAの推定活性領域に変異導入した結果、D-Glu比率が変化したことから、PgsAがエピメリ化反応を触媒すると示唆された。⑤negamycinのヒドラジド(N-N-C=O)構造の生成機構を明らかにすることを目的に、これまでN-N結合形成への関与が示されている亜硝酸生成酵素の相同遺伝子を破壊した結果、negamycinの生産が消失したことから、ヒドラジド構造の形成にも亜硝酸が関与することが分かった。⑥ ベラクトシンはシクロプロピルアラニン構造を有する。その生合機構はBelKがL-リジンから6-ニトロノルロイシンへの酸化反応を触媒し、BelLが6-ニトロノルロイシンからニトロシクロプロピルアラニンへの環化反応を触媒することが分かった。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1002/anie.202113189
发表时间: 2022-02-07
期刊: Angewandte Chemie (International ed. in English)
影响因子: --
作者: [Li X, Shimaya R, Dairi T, Chang WC, Ogasawara Y]
通讯作者: Ogasawara Y
ラッソペプチド生合成を担うエピメリ化酵素MslHのX線結晶構造解析
负责套索肽生物合成的差向异构酶 MslH 的 X 射线晶体结构分析
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [倉田朋, 鈴木良明, 楯野真也, 味八木茂, Elva Bernotiene, Wayne Giles, 山村寿男, 中嶋優,川上篤士,小笠原泰志,大利徹,森田洋行]
通讯作者: 中嶋優,川上篤士,小笠原泰志,大利徹,森田洋行
微細藻類由来DHA合成酵素のdehydrataseドメインの機能解析
微藻 DHA 合酶脱水酶结构域的功能分析
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [小林 飛悠, 佐藤 康治, 小笠原 泰志, 大利 徹]
通讯作者: 大利 徹
抗生物質resormycinが有するβ-homolysineの生合成機構の解明
抗生素利索霉素的β-高赖氨酸生物合成机制的阐明
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [今堀千咲, 小笠原泰志, 山中一也, 五十嵐雅之, 大利徹, 濱野吉十, 丸山千登勢]
通讯作者: 丸山千登勢
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    病原菌が持つメナキノン新規生合成経路の全容解明と経路特異的阻害剤の探索
    • 批准号:
      20018023
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.61万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      大利 徹
    • 依托单位:
    Studies on diterpene cyclases found in eubacteria
    • 批准号:
      19510220
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.91万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      大利 徹
    • 依托单位:
    病原菌が持つメナキノン新規生合成経路の全容解明と経路特異的阻害剤の探索
    • 批准号:
      18018035
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.42万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      大利 徹
    • 依托单位:
    海外基金