The role of histone modification in bovine skeletal muscle altered by nutrition during fetal life

胎儿期营养改变组蛋白修饰在牛骨骼肌中的作用

• 批准号: 22K05963
• 负责人: 室谷 進
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: National Agriculture and Food Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K05963/
• 关键词: 代謝プログラミング; ウシ; ヒストン修飾; 肉用牛; 骨格筋

本研究では、代謝プログラミング研究のために栄養条件を通常の120％（高栄養区：HN）または60％（低栄養区：LN）に設定した飼養条件下の黒毛和種妊娠牛の胎子を分析対象としている。これまでに各♂4頭の飼養条件区の間において、重量に差が生じた胎子骨格筋（最長筋）では、多くの遺伝子の発現とともに代謝物の含量に有意な差が認められている。本課題では、低栄養区の胎齢8.5ヵ月の胎子において遺伝子発現調節を制御するヒストン修飾がどのように変化しているかを調べることを目的としている。ヒストン修飾には遺伝子発現に及ぼす制御の違いによる複数のタイプがある。そこで今回は、転写活性化に作用する修飾様式H3K4me3が牛胎子骨格筋ゲノム上のどの遺伝子で増加または低下するかを調べ、ヒストン修飾が代謝プログラミングでどのような意義を持つのかを明らかにすることを目的としている。このために、最長筋より抽出したゲノムDNAを用い、ChIP-seq法によりヒストン修飾について網羅的に解析した。ChIP-seqの結果、H3K4me3の修飾を受けた遺伝子領域として、総計26,986のピーク領域にアノテーションが付与された。LN胎子において、数種のオートファジー関連遺伝子、脂質代謝および糖代謝等に関わる遺伝子のプロモータ領域にH3K4me3の有意な変化があることが判明した。LN胎子における骨格筋の成長遅滞には、これらの遺伝子群におけるH3K4me3の変化が関与する可能性が示唆された。H3K4me3は遺伝子の転写活性化に関与することが知られており、これらの遺伝子群の転写活性化が変化すると考えられる。

This study で は, metabolic プ ロ グ ラ ミ ン グ research の た め に を tech students.their ownship keep conditions usually の 120% (high tech students.their ownship raising area: HN) ま た は 60% (low tech students.their ownship raising area: LN) に set し た の black feathers and breeding conditions according to the analysis of the pregnancy cow の tire son を like と seaborne し て い る. こ れ ま で に among 4 ♂ head の raised area の に お い て born poor, weight に が じ た son fetal skeletal muscle (reinforced) longest で は, multiple く の posthumous son 伝 の 発 now と と も に metabolites の content に intentionally な differential が recognize め ら れ て い る. This topic で は area, low tech students.their ownship の tire 齢 の tyres for 8.5 ヵ month に お い て posthumous son 伝 発 now adjust を suppression す る ヒ ス ト ン modified が ど の よ う に variations change し て い る か を adjustable べ る こ と を purpose と し て い る. Youdaoplaceholder0 <e:1> modifies に, に, 伝, and the appearance of に and ぼす control, <s:1>, による, による plurals, タ, タ, プがある. そ こ で は back today, planning to write activeness に す る modify others type H3K4me3 が cow son fetal skeletal muscle ゲ ノ ム on の ど の posthumous son 伝 で raised plus ま た は low す る か を べ, ヒ ス ト ン modified が metabolic プ ロ グ ラ ミ ン グ で ど の よ う な meaning を hold つ の か を Ming ら か に す る こ と を purpose と し て い る. こ の た め に, longest reinforcement よ り spare し た ゲ ノ ム を DNA with い, ChIP - seq に よ り ヒ ス ト ン modified に つ い て snare に resolution し た. ChIP - seq の results, H3K4me3 の modified を by け た heritage 伝 sub-fields と し て, 26986 の 総 ピ ー ク field に ア ノ テ ー シ ョ ン が give さ れ た. LN child child に お い て, several の オ ー ト フ ァ ジ ー masato even heritage 伝, lipid metabolism お よ び sugar metabolism such as に masato わ る heritage 伝 son の プ ロ モ ー タ field に H3K4me3 の intentionally な variations change が あ る こ と が.at し た. LN child child に お け る skeletal muscle の 遅 growth lag に は, こ れ ら の heritage 伝 subgroup に お け る H3K4me3 の variations change が masato and す が る possibility in stopping さ れ た. H3K4me3 は posthumous son 伝 の planning write activeness に masato and す る こ と が know ら れ て お り, こ れ ら の heritage 伝 subgroup の planning write activeness が variations change す る と exam え ら れ る.

项目成果

MEATabolomics in postmortem aging of beef and pork.

牛肉和猪肉死后老化中的肉类代谢组学。

• 发表时间: 2022
• 作者: Muroya Susumu;Nomura Riko;Nagai Hirotaka;Ojima Koichi;Matsukawa Kazutsugu;Muroya Susumu;室谷 進;室谷 進
• 通讯作者: 室谷 進

Farm Animal Muscle Metabolism Approached with Omics Technologies.

利用组学技术研究农场动物的肌肉代谢。

• 发表时间: 2022
• 作者: Muroya Susumu;Nomura Riko;Nagai Hirotaka;Ojima Koichi;Matsukawa Kazutsugu;Muroya Susumu;室谷 進
• 通讯作者: 室谷 進

牛肉の代謝成分を網羅的に把握する －熟成中の変化を中心に－

全面了解牛肉代谢成分 - 关注老化过程中的变化 -

• 发表时间: 2022
• 作者: Muroya Susumu;Nomura Riko;Nagai Hirotaka;Ojima Koichi;Matsukawa Kazutsugu;Muroya Susumu;室谷 進;室谷 進;室谷 進
• 通讯作者: 室谷 進