全長型アニオンチャネルロドプシンのイオン輸送機能:C末端ドメインの役割について
全長型アニオンチャネルロドプシンのイオン輸送機能:C末端ドメインの役割について
批准号:
22K06120
负责人:
出村 誠
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
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英文摘要
光で活性化してアニオンを受動輸送するアニオンチャネルロドプシン(ACR)は、膜貫通ドメインのうしろに長いC末端ドメインをもつ。しかし 、これまでの研究でC末端ドメインは切除されてきたため、機能的役割はわかっていない。これを解明するために、我々は世界初の全長型ACRの遺伝子組換え発現系を構築した。さらに、全長型ACRではアニオン選択性が変化し、C末端ドメインと膜貫通ドメインの間の相互作用が示唆された。そこで本 研究では、(1)C末端および膜貫通ドメインの間の相互作用を確かめる、(2)変異体を用いて相互作用部位を特定する、(3)アニオン選択性と相互作用の関連性を明らかにする。本研究は、天然状態のACRの姿を明らかにする世界で唯一の研究である。2022年度はまず、上記(1)について検討を行った。検討を行う中で、C末端ドメインは天然変性領域であり、同時にリン酸化修飾を受けることを新たに発見した。リン酸化修飾は、C末端ドメインの構造形成および膜貫通ドメインとの相互作用に必須であるという結果を得た。さらに、上記(2)について、C末端ドメインは膜貫通ドメインの細胞質側領域と相互作用する。リン酸化修飾されたC末端ドメインは、細胞質側領域に数個あるArg残基と強い相互作用をする可能性が高いことがわかってきた。本年度の成果は、以前の成果と併せて国際的な論文雑誌に投稿し、査読中である。
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北海道大学大学院先端生命科学研究院 生物情報解析科学研究室ホームページ
北海道大学尖端生命科学研究生院生物信息学实验室主页
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Comparative study in thermodynamics of microbial proton-pumping rhodopsins identified in various temperature environments
不同温度环境下微生物质子泵视紫红质的热力学比较研究
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ryouhei Ohtake, Kaori Kondo, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto]
通讯作者:
Takashi Tsukamoto
Biological role and molecular mechanism of preferential NO3- transport by full-length Guillardia theta anion channelrhodopsin 1
全长Guillardia theta阴离子通道视紫红质1优先转运NO3的生物学作用和分子机制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yuya Ohki, Ryouhei Ohtake, Yukino Sato, Takuma Watanabe, Jo Watanabe, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto]
通讯作者:
Takashi Tsukamoto
Comprehensive thermodynamic analysis for microbial proton pump rhodopsins identified in various temperature environments
对各种温度环境下鉴定的微生物质子泵视紫红质的综合热力学分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ryouhei Ohtake, Kaori Kondo, Makoto Demura, Takashi Kikukawa, Takashi Tsukamoto]
通讯作者:
Takashi Tsukamoto
北海道大学大学院先端生命科学研究院 生物情報解析科学研究室Twitter
北海道大学尖端生命科学研究生院生物信息分析科学实验室 Twitter
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
αラクトアルブミン構造中間体の形成と細胞結合機能
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批准号:18031002
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.39万
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财政年份:2006
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负责人:出村 誠
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依托单位:
リゾチーム・αラクトアルブミンの構造変換と細胞結合機能
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批准号:16041201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.7万
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财政年份:2004
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负责人:出村 誠
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依托单位:
新しい固体NMR法による膜タンパク質の分子配向解析
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批准号:07750985
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1995
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负责人:出村 誠
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依托单位:
膜電位プローブ分子の生体膜中での配向挙動の固体NMR解析
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批准号:06772100
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:出村 誠
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依托单位:
二次元結晶構造を有するタンパク質膜中の酵素反応とその膜電位の解析
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批准号:05780472
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1993
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负责人:出村 誠
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依托单位:
刺激に応答する絹フィブロイン膜の開発
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批准号:04760044
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:出村 誠
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依托单位:
絹糸腺細胞のタンパク質分泌過程におけるエネルギー変換
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批准号:63780333
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1988
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负责人:出村 誠
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依托单位:
機能性絹フィブロイン膜のセンサ素子への応用に関する研究
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批准号:62760051
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1987
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负责人:出村 誠
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依托单位:
海外基金