ショウジョウバエ類における微生物群集との相互作用を介した環境適応

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本年度は、実験に用いるショウジョウバエ類の野生種の採集および、微生物群集解析の予備実験、免疫関連遺伝子の発現解析に用いる遺伝子マーカーの開発を行った。2022年の6月および9月に、長野県上田市および東御市の標高500~1600mの地点において、バナナトラップを用いてショウジョウバエ類の採集を行った。採集した高地性のショウジョウバエ類のうち、主な対象であるマキオショウジョウバエ（Drosophila curviceps）に加え、4種を実験室内に持ち帰り、飼育系統を作成した。また、2022年11月から2023年2月には、東京大学構内でも同様にバナナトラップによる採集を行い、マキオショウジョウバエおよび、その近縁種であるダンダラショウジョウバエ（D. annulipes）などを採集し、それらについても飼育系統を作成した。野外から採集したショウジョウバエ個体からDNAを抽出し、細菌類の16S rRNA領域のPCR増幅を行い、目的の長さのDNA断片が単一ピークとして増幅されるように、プライマーの選定と最適なPCR反応条件の探索を行った。これに加えて、塩基配列データベースに登録されているショウジョウバエのゲノム配列を収集し、免疫関連遺伝子として、抗微生物ペプチド産生に関わる遺伝子の塩基配列情報に基づいてプライマー開発を行った。