疾患関連抗体に対する抗イディオタイプDNAアプタマーのファスト&ファインデザイン

针对疾病相关抗体的抗独特型DNA适体的快速精细设计

基本信息

  • 批准号:
    22K06550
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2025-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

研究計画1「抗体を標的とした抗イディオタイプDNA アプタマーの効率的探索法の構築」では、(1) タンパク質精製分取用クロマトグラフ(FPLC)による結合解離スクリーニング、(2) NGS解析、(3) アプタマー最適配列アルゴリズムSMART-Aptamerを用いたin silico探索を行った。得られた候補配列については、ELAAによる結合能・特異性評価やドッキングシミュレーションの結果から最適配列を導出し、各薬物に対してKd=20 ~ 50 nM程度の高親和性アプタマーの獲得に成功した。これらの候補配列は血清試料中においても標的医薬と特異的に結合したことから血中薬物濃度分析への適用性が示された。研究計画2「抗イディオタイプDNA アプタマーの高性能化のための精密デザイン」では、アプタマーの更なる親和性向上を目的としたアプタマーダイマーの設計及び結合能評価を行った。最初にアプタマー単量体とTrastuzumabのFab断片のドッキングシュミレーションから結合様式を予測した。この結果をもとにダイマーの設計を行った。リンカー長はアプタマー間距離の予測を行うことで決定し、26、30、34塩基のpoly Tと、その中央に(PEG)6を挿入した3つの異なるリンカー長のダイマーを設計した。最後に設計したダイマーの結合能評価を行った結果、モノマーのKd値135.4 nMに対し、ダイマーのKd値は最良のもので52.5 nMと算出された。以上よりアプタマーの二量体化はアプタマーの結合能を向上させるうえで有効であることが示された。研究計画3「抗イディオタイプDNA アプタマーによる抗体医薬のバイオアナリシス」では、先行研究で構築したELAA法におけるアプタマーの固定化法および検出法を変更することで血清中nivolumabを10-240 μg/mLの範囲で良好な精度で定量できることを示した。
Research project 1. The method of exploring the rate of anti-DNA antigens, (1) antigens, antibodies, antibodies, The results show that you can get the best results by using the combination of ELAA and ELAA information, and the results show that the most efficient configuration results in the most efficient configuration, high level of Kd=20 ~ 50 nM, and high level of sexual performance. The clinical characteristics of the serum samples were analyzed by the combination of the serum samples and the blood samples. Research project 2, "Anti-virus, anti-DNA, high-performance, precision, high-performance, high-performance, high-performance At first, the Trastuzumab Fab fragments were measured and the formula was combined with each other. The results show that you are not required to set up a design line. Please tell us how far you can go to the bank. You need to know how to use the poly decision, 26th, 30th, 34th base poly, PEG, and so on. You need to enter the remote monitoring system in the middle of the day. In the end, we can use the combination of design and simulation to analyze the results of the operation, the Kd of 135.4 nM, and the best performance of Kd of 52.5 nM to calculate the error. The combination of the above two-dimensional data acquisition system can be used to display the information in the upper part of the system. Research project 3: anti-tumor drugs, anti-DNA drugs, anti-tumor antibodies, anti-tumor drugs, anti-nivolumab drugs, anti-tumor drugs, anti-nivolumab drugs, anti-tumor drugs

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Development of a DNA aptamer that binds to the complementarity-determining region of therapeutic monoclonal antibody and affinity improvement induced by pH-change for sensitive detection
  • DOI:
    10.1016/j.bios.2022.114027
  • 发表时间:
    2022-02-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    12.6
  • 作者:
    Saito, Taro;Shimizu, Yutaka;Ikebukuro, Kazunori
  • 通讯作者:
    Ikebukuro, Kazunori
抗体医薬Trastuzumabに対する高親和性DNAアプタマーの探索研究
抗体药物曲妥珠单抗高亲和力DNA适配体探索性研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    青木萌恵;磯部亮太;小林直央;北條泰成;古庄 仰;杉山栄二;轟木堅一郎
  • 通讯作者:
    轟木堅一郎
水晶振動子マイクロバランス法による抗体医薬に対する抗イディオタイプDNA アプタマーの結合定数測定
石英晶体微天平法测定抗独特型DNA适体与抗体药物的结合常数
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    磯部亮太;小林直央;青木萌恵;古庄 仰;杉山栄二;水野 初; 轟木堅一郎
  • 通讯作者:
    轟木堅一郎
Efficient screening of anti-idiotype DNA aptamers that bind specifically to trastuzumab for bioanalytical applications
  • DOI:
    10.1016/j.jpbao.2023.100006
  • 发表时间:
    2023-02
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    K. Todoroki;Jiaxing Tong;Moe Aoki;N. Kobayashi;Ryota Isobe;Hiroyuki Tasaki;Tomohiro Yamada;Aogu Furusho;Eiji Sugiyama;H. Mizuno;H. Hayashi;T. Toyo′oka
  • 通讯作者:
    K. Todoroki;Jiaxing Tong;Moe Aoki;N. Kobayashi;Ryota Isobe;Hiroyuki Tasaki;Tomohiro Yamada;Aogu Furusho;Eiji Sugiyama;H. Mizuno;H. Hayashi;T. Toyo′oka
静岡県立大学教員データベース
静冈县立大学教员数据库
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

轟木 堅一郎其他文献

アミノ酸キラル分析を指向した新規キラル誘導体化試薬の開発とその分離挙動解析
新型氨基酸手性分析手性衍生化试剂的研制及其分离行为分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    柳澤拓摩;高山卓大;轟木 堅一郎;水野 初;閔 俊哲;豊岡利正
  • 通讯作者:
    豊岡利正
唾液中ポリアミン安定化法の開発と乳がん診断法への応用
唾液多胺稳定方法的研制及其在乳腺癌诊断方法中的应用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鈴木安希子;高山卓大;清水逸平;轟木 堅一郎;水野 初;閔 俊哲;豊岡利正
  • 通讯作者:
    豊岡利正
イオン選択性マイクロ電極を用いたアセチルコリン関連化合物のセンシング
使用离子选择性微电极感测乙酰胆碱相关化合物
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉里 香織;轟木 堅一郎;吉田 秀幸;能田 均;山口 政俊
  • 通讯作者:
    山口 政俊
ルテニウム錯体化学発光法によるコリン類の分析
钌络合物化学发光法分析胆碱
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉田 秀幸;小南 萌子;轟木 堅一郎;能田 均;山口 政俊
  • 通讯作者:
    山口 政俊
蛍光法によるレシチン-モノオレイン混合脂質膜中の側方圧力の評価
荧光法评价卵磷脂-单油酸甘油酯混合脂膜的侧压力
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉武 誠;緒方 進;馬場 恵里香;轟木 堅一郎;吉田 秀幸;能田 均;後藤 一洋;山口 政俊;中野実
  • 通讯作者:
    中野実

轟木 堅一郎的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('轟木 堅一郎', 18)}}的其他基金

光触媒を反応場とする生理活性フェノール類の高感度計測システムの開発
开发使用光催化剂作为反应位点的生理活性酚类高灵敏度测量系统
  • 批准号:
    18750068
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

相似海外基金

セルフフォールディング高分子をビルディングブロックとする新規抗体医薬品の創製
使用自折叠聚合物作为构建模块创建新型抗体药物
  • 批准号:
    24KJ1070
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Neglectedフィロウイルス感染症に対する抗体医薬開発
针对被忽视的丝状病毒感染的抗体药物开发
  • 批准号:
    24K02283
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
抗体医薬品のバイオトランスフォーメーションの実態解明
阐明抗体药物生物转化的实际状况
  • 批准号:
    23K27340
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
新規SLE抗体医薬品の治療効果最大化を目指した臨床薬理学研究
旨在最大化新SLE抗体药物治疗效果的临床药理学研究
  • 批准号:
    24K09890
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
免疫抑制分子HLA-Gアイソフォームを特異的に機能阻害する腫瘍治療抗体医薬品開発
开发特异性抑制免疫抑制分子 HLA-G 亚型功能的肿瘤治疗抗体
  • 批准号:
    23K24012
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
抗体医薬を真に置き換える小タンパク質医薬の開発
开发真正替代抗体药物的小蛋白药物
  • 批准号:
    23K21153
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
胆道がんに対するEphA2を標的とした抗体医薬の開発ー光感受物質と核酸医薬の融合ー
开发针对胆道癌的EphA2抗体药物 - 光敏剂与核酸药物的融合 -
  • 批准号:
    24K11879
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
小児悪性腫瘍に対する新規抗CD26ヒト化モノクローナル抗体医薬の抗腫瘍効果の解析
新型抗CD26人源化单克隆抗体药物对小儿恶性肿瘤的抗肿瘤作用分析
  • 批准号:
    24K10958
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
表面分子スクリーニングに基づく非小細胞肺癌に対する新規抗体医薬の開発
基于表面分子筛选的非小细胞肺癌新型抗体药物开发
  • 批准号:
    24K12033
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
膵島細胞に高発現する膜蛋白を標的とする膵島炎治療抗体医薬の開発
开发针对胰岛细胞中高表达膜蛋白的胰腺炎治疗抗体
  • 批准号:
    24K10180
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了