Mouse model and omics analyses exploring bacterial and host factors involved in pathogenesis of MAC lung disease

小鼠模型和组学分析探索 MAC 肺病发病机制中涉及的细菌和宿主因素

• 批准号: 22K07065
• 负责人: 瀬戸 真太郎
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: 公益財団法人結核予防会 結核研究所
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07065/
• 关键词: 肺MAC症; マウスモデル; トランスポゾンシークエンシング; RNAシークエンシング; MAC; TN-seq

これまでにマウス肺内で定着して感染成立を行うヒト肺MAC症臨床分離株を4株単離している。これらの臨床分離株の全ゲノム配列の決定を行った。また、それぞれの臨床分離株のトランスポゾン（Tn）ライブラリーを構築した。トランスポゾンシークエンシング（Tn-seq）を行い、高密度なTn挿入を確認した後に、培地上での増殖に必須な遺伝子を決定した。増殖に必須もしくは欠損によって増殖に阻害が生じる遺伝子は計300-400遺伝子であり、臨床分離株ごとに異なることが明らかになった。本研究結果から、新規創薬標的として可能性のあるMAC菌遺伝子を見出すことができた。また、肺MAC臨床分離株をマウスに感染させて、感染肺のRNA-seqを行った。感染肺ではTh1、Th17などによる炎症に関わる遺伝子群の発現が亢進していることを明らかにした。本研究成果は、ヒト病態を反映する肺MAC症マウスモデルの構築を促進するとともに、ヒト肺MAC症を含む肺NTM症における難治化、重症化に関わる菌、宿主因子の探索のための基盤形成に寄与する。

The infection was established in the lung and four clinical isolates of MAC were isolated. The determination of the complete sequence of these clinical isolates was carried out. The clinical isolates were constructed from the same strain. Tn-seq is the most important factor in the development of the plant. The results showed that there was no significant difference between the two strains. The results of this study indicate that the new target is likely to be identified. The infection was caused by the presence of RNA-seq in the lung. Infection of the lungs Th1, Th17, inflammation, and the development of genetic subgroups are increased. The results of this study are related to the exploration of bacteria and host factors in the pathogenesis of pulmonary MAC disease, including the refractory and severe pulmonary NTM disease.

项目成果

空間的マルチオミックスで探索する結核肉芽腫における泡沫化マクロファージのバイオマーカー

利用空间多组学探索结核肉芽肿中泡沫状巨噬细胞的生物标志物

• 发表时间: 2023
• 作者: Ito N;Masuda T;Nakashima T;Nakao S;Yamaguchi K;Sakamoto S;Horimasu Y;Miyamoto S;Iwamoto H;Fujitaka K;Hamada H;Hattori N.;瀬戸真太郎，土方美奈子，慶長直人
• 通讯作者: 瀬戸真太郎，土方美奈子，慶長直人

オミックス解析による活動性結核マウスモデルにおける泡沫化マクロファージ形成過程の解析

利用组学分析分析活动性结核小鼠模型中泡沫巨噬细胞的形成过程

• 发表时间: 2022
• 作者: 瀬戸真太郎;中村 創;引地遥香;土方美奈子;慶長直人
• 通讯作者: 慶長直人