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BRCA関連重複癌患者の全エクソン解析を通じた新規癌発症リスク因子の同定

BRCA関連重複癌患者の全エクソン解析を通じた新規癌発症リスク因子の同定
通过 BRCA 相关重复癌症患者的全外显子分析鉴定新的癌症危险因素
批准号:
22K07233
负责人:
谷岡 真樹
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31

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既に国立がんセンター中央病院において2008年から20年の間に診断されたBRCA関連癌重複患者50名の正常組織と腫瘍組織50名の全エクソン解析を実施した。腫瘍では相同組換え(HR)欠損を反映するLoss of heterogeneity(LOH)スコアを算出した。24例(48%)にBRCA1(n=13)、BRCA2(n=9)、ATM(n=1)、TP53(n=1)、MRE11(n=1)、BLM(n=1)、TET2(n=1)の生殖細胞変異があり、3例(6%)にはこれらの変異が2つ含まれていた。他の26名のうち、乳癌と膵臓癌を重複した1名は、LMO2の生殖細胞変異が唯一の候補として見出された。さらに、彼女は乳房と胃にびまん性大細胞型リンパ腫(DLBCL)を2回経験していた。LMO2はDLBCLの予後因子として知られており、53BP1と相互作用して相同組み換えを阻害し、びまん性大細胞型リンパ腫のPARP阻害に合成致死を与えることも知られている。Variant allele frequency(VAF)は生殖細胞では52%であったが乳腺腫瘍で68%とさらに高く、LOH scoreは乳腺腫瘍で24%と高値であった。以上からLMO2の新規変異は、PARP阻害剤に反応するDLBCLおよびBRCA関連癌の原因となる可能性があると考えられた。さらにバイオバンクジャパンにおいて、びまん性大細胞型リンパ腫と乳癌、膵臓癌、または卵巣癌を重複した103名の患者の中で、これまでに認められたLMO2のバリアントを有する症例が認められるかを検討したものの、バリアント症例を認めなかった。
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会议论文
BRCA関連重複癌と生殖細胞の全エクソン解析により同定された新規候補遺伝子
通过 BRCA 相关重复癌症和种系全外显子分析鉴定出新的候选基因
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [安藤基純, 池村舞, 福島昭二, 杉岡信幸, 橋田亨, 谷岡真樹]
通讯作者: 谷岡真樹
Japan-U.S. collaboration to find novel biomarkers of CDK4/6 inhibitor using explainable deep learning and spatial genetic analysis.
  • 批准号:
    22KK0118
  • 项目类别:
    Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
  • 资助金额:
    $12.9万
  • 财政年份:
    2022
  • 负责人:
    谷岡 真樹
  • 依托单位:
乳癌組織全エクソン解析データに基づく相同組み換え修復機能の新規測定モデル開発
海外基金