Elucidating the heterogeneity of amyotrophic lateral sclerosis by neuropathological analysis linked to clinical genomic information

通过与临床基因组信息相关的神经病理学分析阐明肌萎缩侧索硬化症的异质性

• 批准号: 22K07359
• 负责人: 熱田 直樹
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Aichi Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K07359/
• 关键词: 筋萎縮性側索硬化症; 神経病理解析; 疾患レジストリ

多施設共同ALS患者レジストリであるJaCALSでは、臨床情報は前向きに患者の死亡まで経過観察している。患者登録は継続中であり、さらなる症例登録、試料の蓄積を行った。検体管理・利用体制の整備運用、データ管理とクオリティコントロールを継続した。また、登録時に血液検体からDNA抽出および不死化リンパ球作製を行った。この登録患者で逝去され剖検が実施された例の一部について、愛知医科大学加齢医科学研究所の神経病理リソースに蓄積があり、それら症例のデータ連結を進めた。病理学的解析では、ALSの主要な病態関連タンパク質（TDP-43、FUS、SOD-1など）の凝集に基づいて、免疫組織化学的分類を行った。。また、タンパク質不溶性分画、DNA、およびmRNAを抽出し、それぞれタンパク質コンフォーメーションの評価、遺伝子発現パターンの解析を行い得られた病理学的所見と臨床データを連結して、病態関連タンパクの分布や生化学的性状と、臨床経過や脳萎縮との相関を検討した。JaCALSの臨床ゲノム解析では、JaCALS に登録された1807例で、線形回帰分析を用いてSNPと発症年齢の関連を検討し、ゲノムワイド有意な関連を示すSNPを同定した。得られた回帰係数から、このSNPのTアレルを一つ持つ場合、持たない場合と比べて4.1歳早く発症することが示された。このSNPに関連する遺伝子発現について、神経病理リソースを用いた解析を進めていく。我が国に多いSOD1遺伝子G93S変異例について、臨床ゲノムデータと神経病理を連結した解析を進めている。

More common ALS patients are expected to receive more clinical information and more patients will die. Patient registration, case registration, sample accumulation System management and utilization of equipment, data management, data collection, etc. DNA extraction from the blood sample at the time of registration and the preparation of the non-fatal virus. A part of the patient's clinical profile, a part of the neuropathology profile of the Aichi Medical University, and a part of the clinical profile of the patient's clinical profile. Pathological analysis, aggregation and immunohistochemical classification of ALS The analysis of DNA, protein, and mRNA was performed to investigate the relationship between pathological findings, clinical profiles, and biochemical traits. JaCALS clinical profile analysis, JaCALS registration of 1807 cases, linear regression analysis to use the SNP and disease year association to discuss, must use the intentional association to show SNP identity The test results show that the regression coefficient is lower than that of the SNP, and the SNP is higher than that of the SNP. This SNP is associated with gene discovery, neuropathology, and application analysis. In China, SOD1 gene G93S is a special case, clinical and pathological link, and analysis.

项目成果

Serum asymmetric dimethylarginine level correlates with the progression and prognosis of amyotrophic lateral sclerosis.

• DOI: 10.1111/ene.15254
• 发表时间: 2022-05
• 期刊: EUROPEAN JOURNAL OF NEUROLOGY
• 影响因子: 5.1
• 作者: Ikenaka, Kensuke;Maeda, Yasuhiro;Hotta, Yuji;Nagano, Seiichi;Yamada, Shinichiro;Ito, Daisuke;Torii, Ryota;Kakuda, Keita;Tatebe, Harutsugu;Atsuta, Naoki;Aguirre, Cesar;Kimura, Yasuyoshi;Baba, Kousuke;Tokuda, Takahiko;Katsuno, Masahisa;Kimura, Kazunori;Sobue, Gen;Mochizuki, Hideki
• 通讯作者: Mochizuki, Hideki

Mutation screening of the DNAJC7 gene in Japanese patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis

• DOI: 10.1016/j.neurobiolaging.2021.12.002
• 发表时间: 2022-04-18
• 期刊: NEUROBIOLOGY OF AGING
• 影响因子: 4.2
• 作者: Tohnai, Genki;Nakamura, Ryoichi;Sobue, Gen
• 通讯作者: Sobue, Gen

The SYNGAP1 3'UTR Variant in ALS Patients Causes Aberrant SYNGAP1 Splicing and Dendritic Spine Loss by Recruiting HNRNPK.

• DOI: 10.1523/jneurosci.0455-22.2022
• 发表时间: 2022-11-23
• 期刊: JOURNAL OF NEUROSCIENCE
• 影响因子: 5.3
• 作者: Yokoi, Satoshi;Ito, Takuji;Sahashi, Kentaro;Nakatochi, Masahiro;Nakamura, Ryoichi;Tohnai, Genki;Fujioka, Yusuke;Ishigaki, Shinsuke;Udagawa, Tsuyoshi;Izumi, Yuishin;Morita, Mitsuya;Kano, Osamu;Oda, Masaya;Sone, Takefumi;Okano, Hideyuki;Atsuta, Naoki;Katsuno, Masahisa;Okada, Yohei;Sobue, Gen
• 通讯作者: Sobue, Gen

Convenient Auditory-Based Language and Executive Function Test for Patients With Amyotrophic Lateral Sclerosis: A Pilot Study

针对肌萎缩侧索硬化症患者的方便的基于听觉的语言和执行功能测试：一项试点研究

• DOI: 10.1093/arclin/acac069
• 发表时间: 2022
• 期刊: Archives of Clinical Neuropsychology
• 影响因子: 2.6
• 作者: Ohdake Reiko;Watanabe Hirohisa;Kawabata Kazuya;Ogura Aya;Sato Maki;Tanaka Yasuhiro;Imai Kazunori;Masuda Michihito;Kato Toshiyasu;Yokoi Takamasa;Hara Kazuhiro;Nakamura Ryoichi;Atsuta Naoki;Nakagawa Masafumi;Katsuno Masahisa;Sobue Gen
• 通讯作者: Sobue Gen

Safety and Clinical Benefits of Laryngeal Closure in Patients with Amyotrophic Lateral Sclerosis.

• DOI: 10.1007/s00455-022-10454-0
• 发表时间: 2023-02
• 期刊: Dysphagia
• 影响因子: 2.6