網羅的菌叢解析を用いた慢性下気道感染症の病態の解明

利用综合细菌菌群分析阐明慢性下呼吸道感染的病理学

• 批准号: 22K08272
• 负责人: 矢寺 和博
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: University of Occupational and Environmental Health, Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K08272/
• 关键词: 慢性下気道感染症; 非結核性抗酸菌症; 気管支拡張症; 細菌叢解析法

2022年度は非結核性抗酸菌症を疑う慢性下気道感染症患者に対して、クローンライブラリー法を用いたSanger法による細菌叢解析を行った。対象患者の病変部の気管支肺胞洗浄液を用いて、16S ribosomal RNA遺伝子におけるV3-V5の超可変領域をターゲットとするE341F-E907Rをプライマーとした解析だけでなく、抗酸菌特異的な可変領域をターゲットとするプライマーを用いた解析を行うことで非結核性抗酸菌の検出の精度を上げた。この手法を用いることで、慢性下気道感染症患者の下気道細菌叢、及び抗酸菌感染の有無、複数抗酸菌種の混合感染の有無を調査した。本手法では、複数菌種を同時に評価できる利点に加えて、通常は抗酸菌の菌種同定を行う場合だと菌が培養されるまで数週間かかりその後も同定を行うまでにさらなる時間を要するが、本手法だと検体採取後数日間で菌種の推定を行うことが可能となる利点がある。上記手法による慢性下気道感染症患者の病変部の気管支肺胞洗浄液の細菌叢解析、及び臨床所見との比較を行った結果、非結核性抗酸菌が検出された群の方が検出されなかった群に比較して、細菌叢における嫌気性菌の占める割合（特にPrevotella属の占める割合）が高値となる事を確認する事ができている。また、非結核性抗酸菌が複数菌種検出される症例が一定数存在する事を確認出来ており、この非結核性抗酸菌が複数菌種検出される症例と単一菌種のみが検出される症例とにおいて画像所見、臨床症状の差異について比較すると、複数抗酸菌種が検出された群において臨床症状の改善が乏しく、画像所見が悪化しやすい傾向にある事を確認出来ている。また、非結核性抗酸菌を複数菌種検出された症例の一部では抗酸菌培養を延長する事で複数菌種の非結核性抗酸菌の菌株を同時に確認出来ている。

In 2022, the analysis of bacterial flora in patients with suspected non-tuberculous acid-resistant diseases was carried out by Sanger method. E341F-E907R is used to analyze the ultra-variable domain of V3-V5 in patients with disease, and the accuracy of detection of non-tuberculous acid-resistant bacteria is improved. To investigate the presence or absence of bacterial flora in the lower respiratory tract of patients with chronic lower respiratory tract infection, and the presence or absence of mixed infection with multiple acid-resistant bacteria. This method is used to evaluate the multiple strains simultaneously. Usually, the strains of acid-resistant bacteria are cultured for several weeks. The time required for the simultaneous determination of the strains is several weeks. This method is used to estimate the strains during the days after the samples are taken. The results of bacterial flora analysis and comparison of clinical findings in patients with chronic lower tract infections, detection of non-tuberculous acid-resistant bacteria, detection of non-tuberculous acid-resistant bacteria, comparison of non-tuberculous acid-resistant bacteria, identification of bacterial flora and identification of pathogenic bacteria (especially Prevotella genus) were reported. Moreover, it was confirmed that a certain number of cases of non-tuberculous acid-fast bacteria were detected with multiple strains. These cases of non-tuberculous acid-fast bacteria were detected with multiple strains, but the cases of single strain were detected with multiple strains. The symptoms and differences in clinical symptoms were compared. The clinical symptoms were improved due to the detection of multiple acid-fast strains. The portrait was revealed. One part of the case was identified by multiple strains of non-tuberculous acid-resistant bacteria, and the other part was identified by multiple strains of non-tuberculous acid-resistant bacteria.

项目成果

Mycobacterium intracellulareとM. lentiflavumの混合感染による肺非結核性抗酸菌症の1例

胞内分枝杆菌与慢黄分枝杆菌混合感染致肺非结核分枝杆菌病1例

• 发表时间: 2023
• 作者: Shiting Xu;Takehito Shukuya;Kazuhiro Suzuki;Taichi Miyawaki;Shoko Sonobe Shimamura;Hironari Matsuda;Ryota Kanemaru;Tetsuhiko Asao;Tomoyasu Mimori;Yujiro Otsuka;Kazuhisa Takahashi;久保 直登
• 通讯作者: 久保 直登